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中国农学通报 ›› 2010, Vol. 26 ›› Issue (16): 1-7.

所属专题: 生物技术 畜牧兽医

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TLR4基因SNP检测及在中外鸡种中的群体变异分析

宋咏梅 庞建建 赵桂苹   

  • 收稿日期:2010-03-19 修回日期:2010-04-15 出版日期:2010-08-20 发布日期:2010-08-20

  • Received:2010-03-19 Revised:2010-04-15 Online:2010-08-20 Published:2010-08-20

摘要: 摘要:以9个地方鸡种(北京油鸡、白耳鸡、溧阳鸡、河南斗鸡、泰和乌骨鸡、大骨鸡、狼山鸡、仙居鸡、茶花鸡)和3个引进品种(隐性白羽肉鸡、科宝鸡、来航蛋鸡)为素材,利用DNA直接测序技术对Toll样受体4(TLR4)蛋白基因(登陆号为AY064697)的全部外显子、部分内含子及5`调控区共4373bp的序列进行单核苷酸多态性检测,共检测到36个SNPs,其中19个SNPs位于编码区(cSNPs),12个集中于第三外显子的特定区域上(蛋白的TRR结构域);10个为错义突变,21个为新发现的SNPs。对集中于第三外显子上的12个SNP位点,在十二个品种的688个个体进行了PCR-SBT检测,这些SNPs 产生的不同基因型及等位基因在12个品种鸡间分布存在显著的差异,推测与该基因的功能存在相关。

关键词: Sclerotinia sclerotiorum 菌核病 花瓣测试 PH指示剂, Sclerotinia sclerotiorum 菌核病 花瓣测试 PH指示剂