中国农学通报 ›› 2012, Vol. 28 ›› Issue (20): 148-153.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.2012-0859
所属专题: 生物技术
姜娜 马志宏 侯莉 邢薇 李铁梁 罗琳
摘要:
为了从虹鳟肝脏中扩增出Hepcidinc全长DNA序列,预测出氨基酸序列,并进行序列分析。通过RT-PCR和RACE PCR的方法,从虹鳟肝脏中克隆获得了Hepcidin 全长cDNA序列,利用在线工具和软件包分析。结果表明:虹鳟Hepcidin全长cDNA序列(GenBank登录号HQ711993)为883 bp,5’端非翻译区211 bp,3’端非翻译区为405 bp,以及一段267 bp的编码序列,编码88个氨基酸,由信号肽(24个氨基酸)、原肽(39个氨基酸)和成熟肽(25个氨基酸)组成,成熟肽C端含有Hepcidin类抗菌肽的8个半胱氨酸保守性结构,可形成4个分子内二硫键。与已报道的鲑形目大西洋鲑Hepcidin氨基酸序列的一致性为93%,与其他鱼类Hepcidin氨基酸序列的一致性为44%~88%,是Hepcidin家族的新成员。