基于转录组的水稻干尖线虫锌指蛋白基因克隆及功能分析

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb14110064

中国农学通报 ›› 2015, Vol. 31 ›› Issue (7): 175-179.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.casb14110064

所属专题：生物技术；水稻

基于转录组的水稻干尖线虫锌指蛋白基因克隆及功能分析

刘晓晗,王峰,李丹蕾,董爱荣,陈俏丽,王博文,

零雅茗,江珊,段颜祯,张玉洲(东北林业大学,哈尔滨 150040）

收稿日期:2014-11-11 修回日期:2015-02-22 接受日期:2014-12-01 出版日期:2015-04-03 发布日期:2015-04-03
通讯作者: 董爱荣
基金资助:
中央高校基本科研业务费专项资金项目“基于RNA-Seq策略研究杨树抗杨褐盘二孢菌侵染分子机理”(DL13BA01)；高等学校博士学科点专项科研基金资助课题（博士点新教师基金资助项目）“水稻干尖线虫诱导水稻防卫反应基因及其相应microRNA克隆与分析”(20100062120002)；林业公益性项目“大兴安岭药用真菌、黄芪栽培”(201004079)。

Genetic Cloning of A Zinc Finger Protein from Aphelenchoides besseyi (Aphelenchida: Aphelenchoididae)

Liu Xiaohan, Wang Feng, Li Danlei, Dong Airong, Chen Qiaoli, Wang Bowen,

Ling Yaming, Jiang Shan, Duan Yanzhen, Zhang Yuzhou(Northeast Forestry University, Harbin 150040)

Received:2014-11-11 Revised:2015-02-22 Accepted:2014-12-01 Online:2015-04-03 Published:2015-04-03

摘要/Abstract

摘要： 为了寻找线虫生殖相关基因，为开发线虫生殖抑制药剂提供理论基础，通过分析水稻干尖线虫转录组文库高通量测序数据，对Unigene进行KEGG路径分析，筛选出一个孕酮介导的卵母细胞形成代谢路径(progesterone-mediated oocyte maturation)，并筛选出该路径的主要调控基因——锌指蛋白基因。通过同源序列比对发现水稻干尖线虫锌指蛋白氨基酸序列中含有核酸结合保守结构域NLS，进一步通过三维结构分析及分子对接验证该蛋白可与DNA分子结合。结果表明，水稻干尖线虫锌指蛋白可与其调控基因的启动子结合从而完成对孕酮介导的卵母细胞形成代谢路径的调控。通过本研究得出最终结论，水稻干尖线虫锌指蛋白具有生物防治价值，值得深入研究。

关键词: 环境互作, 环境互作

Abstract: To find the gene which can influence nematode breeding, the zinc finger protein gene was cloned, based on the analysis of the transcriptome of Aphelenchoides besseyi and the study of KEGG pathway. This study is the theoretical basis for the development of nematicide. By the method of homology alignment, the results indicated that the zinc finger protein had a NLS motif. The protein 3D structure study and docking analysis indicated that this protein could regulate the progesterone-mediated oocyte maturation pathway by combining with the promoter of the target gene. The results showed that the zinc finger protein gene was a potential biological control target gene, and worthy of further study.

刘晓晗,王峰,李丹蕾,董爱荣,陈俏丽,王博文,零雅茗,江珊,段颜祯,张玉洲. 基于转录组的水稻干尖线虫锌指蛋白基因克隆及功能分析[J]. 中国农学通报, 2015, 31(7): 175-179.

Liu Xiaohan,Wang Feng,Li Danlei,Dong Airong,Chen Qiaoli,Wang Bowen,,, and . Genetic Cloning of A Zinc Finger Protein from Aphelenchoides besseyi (Aphelenchida: Aphelenchoididae)[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2015, 31(7): 175-179.

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Genetic Cloning of A Zinc Finger Protein from Aphelenchoides besseyi (Aphelenchida: Aphelenchoididae)

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