新疆野扁桃自交不亲和花粉SFB基因的克隆及生物信息学分析

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb16100096

中国农学通报 ›› 2017, Vol. 33 ›› Issue (25): 22-30.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.casb16100096

所属专题：生物技术；园艺

新疆野扁桃自交不亲和花粉SFB基因的克隆及生物信息学分析

曾斌,刘楠楠,夏江宏,刘梦雯,王建友,王波

新疆农业大学林学与园艺学院/新疆农业大学果树学新疆特色果树研究中心,新疆应用职业技术学院园林园艺系,新疆农业大学林学与园艺学院/新疆农业大学果树学新疆特色果树研究中心,新疆农业大学林学与园艺学院/新疆农业大学果树学新疆特色果树研究中心,中国林业科学院新疆分院,新疆农业大学林学与园艺学院/新疆农业大学果树学新疆特色果树研究中心

收稿日期:2016-10-24 修回日期:2016-12-13 接受日期:2016-12-23 出版日期:2017-09-15 发布日期:2017-09-15
通讯作者: 曾斌
基金资助:
国家自然科学基金“基于S-核酸酶的新疆野生扁桃自交不亲和性泛素化特性的分子机制研究(31660557)”，“新疆野生扁桃自交不亲和性的分子机制研究”(31260465)；新疆维吾尔自治区果树学重点学科项目“新疆特色果树种质资源开发利用与优良品种选育推广”(201007)。

Molecular Cloning and Bioinformatics Analysis of SFB Genes Controlling Self-incompatibility in Xinjiang Wild Almond (Prunus tenella Batsch.)

Received:2016-10-24 Revised:2016-12-13 Accepted:2016-12-23 Online:2017-09-15 Published:2017-09-15

摘要/Abstract

摘要： 旨在克隆获得新疆野扁桃自交不亲和花粉SFB 新基因，以新疆野扁桃花药为试材，应用分子同源克隆及RT-PCR等技术，并进一步采用在线软件分析SFB 基因的蛋白质理化性质，实验成功克隆到了PtSFB5 与PtSFB6 2 个新SFB 基因的cDNA全长，2 个基因的cDNA全长分别为1124 bp 和1072 bp，分别编码了374 和348 个氨基酸，2 个基因都具有F-Box 基因结构，属于F-Box 基因家族，预测的相对分子量分别为30787.26和44037.74，等电点为5.93和5.43，均属于水溶性不稳定蛋白。

关键词: 柽柳, 柽柳, 白刺, 盐胁迫, 光合日变化

Abstract: The study aims to clone full-length sequence of the new pollen SFB gene of self-incompatibility in Prunus tenella. Xinjiang wild almond was used as the material, and molecular homologous cloning and RT-PCR were conducted in this study. The online software was used to analyze the protein physicochemical properties of SFB. The full-length gene sequences of PtSFB5 and PtSFB6 were successfully cloned. The full-length sequence of the two SFB genes was 1124 bp and 1072 bp, respectively, and encoded 374 aa and 348 aa, respectively. Both of the two genes had F- Box structure, belonged to the F- Box gene family. The predicted relative molecular mass was 30787.26 and 44037.74, and the isoelectric point was 5.93 and 5.43, respectively. PtSFB5 and PtSFB6 protein belonged to the unstable water-soluble protein.

中图分类号:

S662.9

曾斌,刘楠楠,夏江宏,刘梦雯,王建友,王波. 新疆野扁桃自交不亲和花粉SFB基因的克隆及生物信息学分析[J]. 中国农学通报, 2017, 33(25): 22-30.

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新疆野扁桃自交不亲和花粉SFB基因的克隆及生物信息学分析

Molecular Cloning and Bioinformatics Analysis of SFB Genes Controlling Self-incompatibility in Xinjiang Wild Almond (Prunus tenella Batsch.)

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