变性梯度凝胶电泳分析亚麻茎秆菌群多样性

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb15090066

中国农学通报 ›› 2016, Vol. 32 ›› Issue (6): 102-105.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.casb15090066

变性梯度凝胶电泳分析亚麻茎秆菌群多样性

周晓杭^1,2,葛菁萍²,平文祥²

(¹病原与免疫实验室牡丹江市医学院基础医学院,黑龙江牡丹江 157011；²微生物黑龙江省高校重点实验室黑龙江大学生命科学学院,哈尔滨 150080）

收稿日期:2015-09-16 修回日期:2016-01-25 接受日期:2015-11-24 出版日期:2016-03-07 发布日期:2016-03-07
通讯作者: 葛菁萍
基金资助:
国家自然科学基金“菌群演替与温水沤麻系统关键酶产生菌代谢组学特征的耦合机制”(31270534)；国家自然科学基金青年科学基金项目“酸菜发酵生态系统中细菌群落与代谢物组特征耦合机制”(31300355)；国家自然科学基金“副干酪乳杆菌与枯草芽孢杆菌等菌群种间关系及协同合作策略的研究”(31470537)；国家自然科学基金“从2,3-丁二醇代谢角度构建工程微生物群体及其生态学机制研究”(31570492)。

Analysis of Flax Stem Microflora Community Diversity by Denaturant Gradient Gel Electrophoresis

Zhou Xiaohang^1,2, Ge Jingping², Ping Wenxiang²

(¹Laboratory of Pathogens and Immunity of College of Basic Medicine, Mudanjiang Medical University, Mudanjiang Heilongjiang 157011; ²Key Laboratory of Microbiology of Heilongjiang Province, College of Life Science, Heilongjiang University, Harbin 150080)

Received:2015-09-16 Revised:2016-01-25 Accepted:2015-11-24 Online:2016-03-07 Published:2016-03-07

摘要/Abstract

摘要： 亚麻是中国重要的经济作物，为了提高亚麻原茎脱胶的效率，在利用PCR-DGGE技术研究亚麻茎杆上菌群多样性的基础上，对其最优电泳条件进行了优化。结果表明：当使用经胶回收后的样品进行PCR-DGGE，电泳时间为200~220 min，变性凝胶梯度为25%~55%，固定时间为12~15 min，染色时间为20 min，显影时间为5~10 min时，得到电泳和分离效果最好。本研究通过优化DGGE电泳条件，可以更加清晰的得到沤麻过程中细菌的多样性，该工作对利用PCR-DGGE技术研究亚麻茎秆菌群多样性提供了方法基础。

关键词: 雷暴日, 雷暴日, 时空分布, 统计分析, 张家口地区

Abstract: Flax is an important economic crop in China. In order to improve the efficiency of retting, the authors used PCR-DGGE technique to study the flax stem microflora diversity, and optimized the best condition of this method. The results showed that, when PCR-DGGE was carried out using the gel recycling samples, the electrophoresis time was 200-220 min, modified gel gradient was 25%-55%, fixed time was about 12-15 min, dyeing time was 20 min, developing time was 5-10 min, the electrophoresis and separation results were good. The study clearly obtained the bacteria diversity in flax retting by optimizing the electrophoresis condition of DGGE. It could set a base for the use of PCR-DGGE to study the microflora community diversity of flax stem.

周晓杭,葛菁萍,平文祥. 变性梯度凝胶电泳分析亚麻茎秆菌群多样性[J]. 中国农学通报, 2016, 32(6): 102-105.

Zhou Xiaohang,Ge Jingping and Ping Wenxiang. Analysis of Flax Stem Microflora Community Diversity by Denaturant Gradient Gel Electrophoresis[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2016, 32(6): 102-105.

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Analysis of Flax Stem Microflora Community Diversity by Denaturant Gradient Gel Electrophoresis

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