番石榴遗传多样性的ISSR分析及指纹图谱构建

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb2022-0420

中国农学通报 ›› 2023, Vol. 39 ›› Issue (21): 39-47.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.casb2022-0420

番石榴遗传多样性的ISSR分析及指纹图谱构建

邵雪花(), 赖多, 肖维强, 刘传和, 贺涵, 匡石滋()

广东省农业科学院果树研究所，农业部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室，广东省热带亚热带果树研究重点实验室，广州 510640

收稿日期:2022-05-25 修回日期:2022-08-15 出版日期:2023-07-25 发布日期:2023-07-24
通讯作者: 匡石滋，男，1963年出生，研究员，学士，研究方向：果树育种与新品种选育。通信地址：510640 广东省广州市天河区大丰路二街80号果树研究所内，Tel：020-38765935，E-mail：kuangshizi@126.com。
作者简介:
邵雪花，女，1983年出生，助理研究员，博士，研究方向：番石榴栽培育种。通信地址：510640 广东省广州市天河区大丰路二街80号果树研究所内，Tel：020-38765935，E-mail：sxh19831017@163.com。
基金资助:
广州市科技特派员项目“特色水果优质高效栽培关键技术的示范与推广”(20212100062); 广东省佛山市财政专项资金-2022年高水平广东省农业科技示范市建设项目(2022)

Psidium guajava L.: Genetic Diversity Analysis Based on ISSR Markers and Construction of Fingerprints

SHAO Xuehua(), LAI Duo, XIAO Weiqiang, LIU Chuanhe, HE Han, KUANG Shizi()

Institute of Fruit Tree Research, Guangdong Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of South Subtropical Fruit Biology and Genetic Resource Utilization, Ministry of Agriculture and Rural Affairs/Guangdong Province Key Laboratory of Tropical and Subtropical Fruit Tree Research, Guangzhou 510640

Received:2022-05-25 Revised:2022-08-15 Online:2023-07-25 Published:2023-07-24

摘要/Abstract

摘要：

为研究59份番石榴种质资源的遗传多样性，并绘制指纹图谱。以番石榴为试材，利用ISSR分子标记技术和UPGMA聚类分析方法，绘制番石榴DNA指纹图谱。利用筛选获得的10条ISSR核心引物对59份番石榴样品进行扩增，共得到126条条带，其中多态性条带113条，多态率为89.68%。通过UPGMA聚类分析得知，59份供试番石榴种质资源样品间遗传相似系数为0.50~0.96，平均遗传相似系数为0.73。根据遗传距离的远近，可将59份种质资源分成4组，第1组包含种质34份，第2组包含种质6份，第3组包含种质18份，编号C26‘草莓'番石榴样品单独为第4组。成功构建了59份番石榴种质的DNA指纹图谱，可用于番石榴种质资源的分类与鉴定。

关键词: 番石榴, ISSR分子标记, 指纹图谱, DNA, 聚类分析

Abstract:

In order to study the genetic diversity of 59 guava germplasm resources and to map the fingerprint, DNA fingerprinting of guava was studied by ISSR technique and UPGMA cluster analysis. The 10 ISSR core primers obtained by screening were used to amplify 59 guavas samples, and a total of 126 bands were obtained, including 113 polymorphic bands, with a polymorphism rate of 89.68%. According to UPGMA clustering analysis, the genetic similarity coefficient of 59 guava germplasm resource samples ranged from 0.50 to 0.96, and the average genetic similarity coefficient was 0.73. According to the genetic distance, the 59 germplasm resources could be divided into four groups, group 1 contained 34 germplasm resources, group 2 contained 6 germplasm resources, group 3 contained 18 germplasm resources, and the sample number C26 'strawberry' guava was the fourth group alone. The DNA fingerprints of 59 guava germplasm resources were successfully constructed, which could be used for the classification and identification of guava germplasm resources.

Key words: Psidium guajava L., ISSR molecular marker, fingerprint, DNA, clustering analysis

邵雪花, 赖多, 肖维强, 刘传和, 贺涵, 匡石滋. 番石榴遗传多样性的ISSR分析及指纹图谱构建[J]. 中国农学通报, 2023, 39(21): 39-47.

SHAO Xuehua, LAI Duo, XIAO Weiqiang, LIU Chuanhe, HE Han, KUANG Shizi. Psidium guajava L.: Genetic Diversity Analysis Based on ISSR Markers and Construction of Fingerprints[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2023, 39(21): 39-47.

图/表 8

参考文献 29

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品种编号	名称	采样地点	品种编号	名称	采样地点
C 1	珍珠	广东中山	C 31	泰国3号	广东潮州
C 2	西瓜红	广东汕尾	C 32	帝王	广东潮州
C 3	四季脆	广州增城	C 33	水晶	广东中山
C 4	小黄果	广州增城	C 34	木瓜	广东潮州
C 5	胭脂红	广州增城	C 35	满楼香	广东潮州
C 6	四季红	广州增城	C 36	水蜜	广东汕头
C 7	土种1号	广东揭阳	C 37	汕红	广东潮州
C 8	土种4号	广东揭阳	C 38	翡翠	广东白云
C 9	土种2号	广东揭阳	C 39	青皮红肉	广东东莞
C 10	大果白肉	广东潮州	C 40	红肉东莞	广东东莞
C 11	土种3号	广东揭阳	C 41	红肉实生	广东东莞
C 12	大果红肉	广东潮州	C 42	巴西1号	广东白云
C 13	外国红肉	广东潮州	C 43	巴西2号	广东白云
C 14	圆白少核	广东潮州	C 44	巴西3号	广东白云
C 15	普宁白肉	广东潮州	C 45	巴西4号	广东白云
C 16	金石宫	广东潮州	C 46	巴西5号	广东白云
C 17	白肉长拔	广东潮州	C 47	巴西6号	广东白云
C 18	红肉瓮拔	广东潮州	C 48	巴西7号	广东白云
C 19	红肉长拔	广东潮州	C 49	巴西S-50	广东白云
C 20	白肉瓮拔	广东潮州	C 50	细叶红肉	广东白云
C 21	潮州红	广东潮州	C 51	细叶白肉	广东白云
C 22	土种5号	广东揭阳	C 52	紫果1号	广东白云
C 23	金斗香	广东中山	C 53	紫果2号	广东白云
C 24	佳硕	广州南沙	C 54	紫果3号	广东白云
C 25	红宝石	广东汕尾	C 55	台红1	广东白云
C 26	草莓	广东佛山	C 56	台红2	广东白云
C 27	紫果	广东东莞	C 57	世纪红1	广东佛山
C 28	细叶小果	广东佛山	C 58	世纪红2	广东佛山
C 29	细叶大果	广东佛山	C 59	台湾珍珠	广东佛山
C 30	泰国2号	广东潮州

品种编号	名称	采样地点	品种编号	名称	采样地点
C 1	珍珠	广东中山	C 31	泰国3号	广东潮州
C 2	西瓜红	广东汕尾	C 32	帝王	广东潮州
C 3	四季脆	广州增城	C 33	水晶	广东中山
C 4	小黄果	广州增城	C 34	木瓜	广东潮州
C 5	胭脂红	广州增城	C 35	满楼香	广东潮州
C 6	四季红	广州增城	C 36	水蜜	广东汕头
C 7	土种1号	广东揭阳	C 37	汕红	广东潮州
C 8	土种4号	广东揭阳	C 38	翡翠	广东白云
C 9	土种2号	广东揭阳	C 39	青皮红肉	广东东莞
C 10	大果白肉	广东潮州	C 40	红肉东莞	广东东莞
C 11	土种3号	广东揭阳	C 41	红肉实生	广东东莞
C 12	大果红肉	广东潮州	C 42	巴西1号	广东白云
C 13	外国红肉	广东潮州	C 43	巴西2号	广东白云
C 14	圆白少核	广东潮州	C 44	巴西3号	广东白云
C 15	普宁白肉	广东潮州	C 45	巴西4号	广东白云
C 16	金石宫	广东潮州	C 46	巴西5号	广东白云
C 17	白肉长拔	广东潮州	C 47	巴西6号	广东白云
C 18	红肉瓮拔	广东潮州	C 48	巴西7号	广东白云
C 19	红肉长拔	广东潮州	C 49	巴西S-50	广东白云
C 20	白肉瓮拔	广东潮州	C 50	细叶红肉	广东白云
C 21	潮州红	广东潮州	C 51	细叶白肉	广东白云
C 22	土种5号	广东揭阳	C 52	紫果1号	广东白云
C 23	金斗香	广东中山	C 53	紫果2号	广东白云
C 24	佳硕	广州南沙	C 54	紫果3号	广东白云
C 25	红宝石	广东汕尾	C 55	台红1	广东白云
C 26	草莓	广东佛山	C 56	台红2	广东白云
C 27	紫果	广东东莞	C 57	世纪红1	广东佛山
C 28	细叶小果	广东佛山	C 58	世纪红2	广东佛山
C 29	细叶大果	广东佛山	C 59	台湾珍珠	广东佛山
C 30	泰国2号	广东潮州

引物编号	引物序列(5'→3')	扩增条带数	多态性条带数	多态率/%
UBC807	AGAGAGAGAGAGAGAGT	14	13	92.86
UBC808	AGAGAGAGAGAGAGAGC	12	10	83.33
UBC809	AGAGAGAGAGAGAGAGG	9	6	66.67
UBC810	GAGAGAGAGAGAGAGAT	10	7	70.00
UBC835	AGAGAGAGAGAGAGAGYC	12	11	91.67
UBC841	GAGAGAGAGAGAGAGAYC	13	13	100.00
UBC842	GAGAGAGAGAGAGAGAYG	14	12	85.71
UBC880	GGAGAGGAGAGGAGA	17	17	100.00
UBC881	GGGTGGGGTGGGGTG	10	9	90.00
UBC888	BDBCACACACACACACA	15	15	100.00
	总计	126	113	89.68

引物编号	引物序列(5'→3')	扩增条带数	多态性条带数	多态率/%
UBC807	AGAGAGAGAGAGAGAGT	14	13	92.86
UBC808	AGAGAGAGAGAGAGAGC	12	10	83.33
UBC809	AGAGAGAGAGAGAGAGG	9	6	66.67
UBC810	GAGAGAGAGAGAGAGAT	10	7	70.00
UBC835	AGAGAGAGAGAGAGAGYC	12	11	91.67
UBC841	GAGAGAGAGAGAGAGAYC	13	13	100.00
UBC842	GAGAGAGAGAGAGAGAYG	14	12	85.71
UBC880	GGAGAGGAGAGGAGA	17	17	100.00
UBC881	GGGTGGGGTGGGGTG	10	9	90.00
UBC888	BDBCACACACACACACA	15	15	100.00
	总计	126	113	89.68

项目	赋值
项目	1	2	3	4	5	6	7
UBC808扩增条带/bp	1900	1100	920	700	—	—	—
UBC810扩增条带/bp	920	860	800	—	—	—	—
UBC835扩增条带/bp	1800	1600	1400*	1300	1200*	750	550
UBC841扩增条带/bp	1900	1700	1500	800	300	—	—
UBC842扩增条带/bp	1700	1100	550	470	—	—	—
UBC880扩增条带/bp	1500	1200	1100	950	440	400	—
UBC888扩增条带/bp	1100	900	450	—	—	—	—

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品种	指纹图谱编码	品种	指纹图谱编码
C 1	23-13-7-235-34-3456-2	C 31	234-123-47-235-34-56-—
C 2	124-123-2467-3-34-36-—	C 32	23-123-7-235-34-56-2
C 3	134-123-12467-235-34-1345-23	C 33	124-123-1247-1235-13-145-2
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C 6	134-123-12467-235-34-3456-1	C 36	34-123-247-123-123-16-—
C 7	14-3-27-35-4-1236-1	C 37	134-3-12467-123-13-145-2
C 8	14-3-1247-234-4-1236-1	C 38	4-13-12467-123-3-46-2
C 9	2-1-267-234-34-3456-2	C 39	3-123-12467-123-3-56-3
C 10	34-12-12467-1234-123-126-1	C 40	34-123-12467-123-2-6-—
C 11	34-123-7-35-34-356-1	C 41	4-123-12467-123-24-6-—
C 12	134-12-12467-1234-123-16-1	C 42	234-123-12467-34-1234-1346-—
C 13	1234-13-1247-124-24-236-13	C 43	234-123-12467-234-1234-1346-2
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