利用SCoT对甜菜种质资源的鉴定及遗传多样性分析

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb20200100054

中国农学通报 ›› 2020, Vol. 36 ›› Issue (18): 119-123.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.casb20200100054

所属专题：资源与环境；园艺

利用SCoT对甜菜种质资源的鉴定及遗传多样性分析

朱尚明¹, 吴则东¹^,², 兴旺¹^,², 邳植¹^,²()

¹黑龙江大学生命科学学院,哈尔滨 150080
²黑龙江省普通高校甜菜遗传育种重点实验室/黑龙江大学,哈尔滨 150080

收稿日期:2020-01-16 修回日期:2020-03-09 出版日期:2020-06-25 发布日期:2020-07-10
通讯作者: 邳植
作者简介:朱尚明,男,1999年出生,陕西咸阳人,本科,主要从事甜菜分子生物学研究。通信地址：150080 黑龙江省哈尔滨市南岗区学府路74号黑龙江大学生命科学学院,Tel：0451-86604561,E-mail: 20174976@s.hlju.edu.cn。
基金资助:
国家糖料现代农业产业技术体系“甜菜高品质品种改良岗位专项基金”(cars-170111);黑龙江省省属高等学校基本科研业务费基础研究项目(RCCXYJ201810)

Beet Germplasm Resources: Identification and Genetic Diversity Analysis by SCoT

Zhu Shangming¹, Wu Zedong¹^,², Xing Wang¹^,², Pi Zhi¹^,²()

¹Life Science Department, Heilongjiang University, Harbin 150080
²Key Laboratory of Sugar Beet Genetic Breeding/Heilongjiang University, Harbin 150080

Received:2020-01-16 Revised:2020-03-09 Online:2020-06-25 Published:2020-07-10
Contact: Pi Zhi

摘要/Abstract

摘要：

为了研究SCoT分子标记技术对甜菜种质资源鉴定的可行性。利用80条SCoT引物对48份甜菜种质资源进行鉴别,同时对种质资源进行了遗传多样性分析和亲缘关系的鉴定。结果表明,80条SCoT引物中有6条能够扩增出清晰、且多态性高的条带,分别为SCoT1、SCoT12、SCoT13、SCoT14、SCoT17和SCoT23,其中引物SCoT1、SCoT12、SCoT14和SCoT23单独使用均可鉴别全部的48份种质资源,引物SCoT13和SCoT17共同使用可以鉴别48个种质资源;聚类分析结果表明,在遗传距离0.15处,95.8%的种质资源均聚为一类,从分子角度上表明甜菜种质资源遗传距离较小。本研究为利用SCoT分子标记技术鉴别甜菜种质资源、对种质资源进行亲缘关系鉴定、杂交组合亲本选配以及分子标记辅助育种等提供相关科学依据。

关键词: 甜菜, 目标起始密码子多态性, 种质资源, 指纹图谱

Abstract:

To study the feasibility of SCoT molecular marker for identifying beet germplasm resources, we designed 80 SCoT primers to identify 48 beet germplasm resources, and analyzed the genetic diversity and genetic relationship of the germplasm resources. The results showed that 6 of the 80 SCoT primers, namely SCoT1, SCoT12, SCoT13, SCoT14, SCoT17, and SCoT23, amplified clear and highly polymorphic bands. Among them, SCoT1, SCoT12, SCoT14 and SCoT23 could separately identify the 48 beet germplasm resources. The identification of the 48 beet germplasm resources could be distinguished by combining SCoT13 and SCoT17. The cluster analysis results showed that 95.8% of germplasm resources were clustered into the same clade at the genetic distance of 0.15, which indicated that there was close genetic relationship among the 48 beet germplasm resources. The study provided a scientific basis for the identification of beet germplasm resources, hybrid combination parent selection and molecular marker-assisted breeding by SCoT markers.

Key words: sugar beet, start codon targeted polymorphism, germplasm resources, fingerprint

中图分类号:

S556.3

朱尚明, 吴则东, 兴旺, 邳植. 利用SCoT对甜菜种质资源的鉴定及遗传多样性分析[J]. 中国农学通报, 2020, 36(18): 119-123.

Zhu Shangming, Wu Zedong, Xing Wang, Pi Zhi. Beet Germplasm Resources: Identification and Genetic Diversity Analysis by SCoT[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2020, 36(18): 119-123.

图/表 4

参考文献 21

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编号	资源名称	资源来源	编号	资源名称	资源来源	编号	资源名称	资源来源
1	CLR8103-9	中国	17	延寿中和公社	中国	33	96F-16	中国
2	CT34-洮	中国	18	双8-2A	中国	34	96F-17	中国
3	PR-5	中国	19	Aj1-4	中国	35	96F-18	中国
4	PO-15	中国	20	L62	中国	36	96F-20	中国
5	白甜菜	中国	21	7503/81-1	中国	37	96001/1	中国
6	红甜菜	中国	22	83461	中国	38	96001/2	中国
7	MS1	美国	23	87-83	中国	39	96001/3	中国
8	DeshremonoN	阿尔巴尼亚	24	92005-3	中国	40	96001-2/3	中国
9	CIKY-T2	捷克	25	92008	中国	41	96004-1/2	中国
10	内蒙八号	中国	26	92017-2	中国	42	MP212-1	中国
11	7301/134AB	中国	27	92017/2-6	中国	43	Z-6	中国
12	Ajanasz-Aj2	波兰	28	“X”半饲	波兰	44	tog-A	中国
13	Ajanasz-Aj4	波兰	29	Rogow-P	波兰	45	US-8916	美国
14	AjpolyⅡ	波兰	30	Л杂种	前苏联	46	X3	中国
15	PZHR1	波兰	31	Refer-z	法国	47	西鲜一号（X)	中国
16	PERLA	南斯拉夫	32	334辐（4x)	中国	48	M167黄	中国

编号	资源名称	资源来源	编号	资源名称	资源来源	编号	资源名称	资源来源
1	CLR8103-9	中国	17	延寿中和公社	中国	33	96F-16	中国
2	CT34-洮	中国	18	双8-2A	中国	34	96F-17	中国
3	PR-5	中国	19	Aj1-4	中国	35	96F-18	中国
4	PO-15	中国	20	L62	中国	36	96F-20	中国
5	白甜菜	中国	21	7503/81-1	中国	37	96001/1	中国
6	红甜菜	中国	22	83461	中国	38	96001/2	中国
7	MS1	美国	23	87-83	中国	39	96001/3	中国
8	DeshremonoN	阿尔巴尼亚	24	92005-3	中国	40	96001-2/3	中国
9	CIKY-T2	捷克	25	92008	中国	41	96004-1/2	中国
10	内蒙八号	中国	26	92017-2	中国	42	MP212-1	中国
11	7301/134AB	中国	27	92017/2-6	中国	43	Z-6	中国
12	Ajanasz-Aj2	波兰	28	“X”半饲	波兰	44	tog-A	中国
13	Ajanasz-Aj4	波兰	29	Rogow-P	波兰	45	US-8916	美国
14	AjpolyⅡ	波兰	30	Л杂种	前苏联	46	X3	中国
15	PZHR1	波兰	31	Refer-z	法国	47	西鲜一号（X)	中国
16	PERLA	南斯拉夫	32	334辐（4x)	中国	48	M167黄	中国

引物名称	引物序列(5′-3′)	GC/%
SCoT 1	CAACAATGGCTACCACCA	50
SCoT 12	ACGACATGGCGACCAACG	61
SCoT 13	ACGACATGGCGACCATCG	61
SCoT 14	ACGACATGGCGACCACGC	67
SCoT 17	ACCATGGCTACCACCGAG	61
SCoT 23	CACCATGGCTACCACCAG	61

引物名称	引物序列(5′-3′)	GC/%
SCoT 1	CAACAATGGCTACCACCA	50
SCoT 12	ACGACATGGCGACCAACG	61
SCoT 13	ACGACATGGCGACCATCG	61
SCoT 14	ACGACATGGCGACCACGC	67
SCoT 17	ACCATGGCTACCACCGAG	61
SCoT 23	CACCATGGCTACCACCAG	61

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Beet Germplasm Resources: Identification and Genetic Diversity Analysis by SCoT

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