32个甜菜品种指纹图谱构建与遗传多样性分析

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb14100098

中国农学通报 ›› 2015, Vol. 31 ›› Issue (12): 169-174.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.casb14100098

所属专题：园艺

32个甜菜品种指纹图谱构建与遗传多样性分析

吴则东^1,2,3,王茂芊^1,2,3,吴玉梅^1,2,3,王华忠^1,2,3,马龙彪^1,2,3

(¹黑龙江省普通高校甜菜遗传育种重点实验室/黑龙江大学,哈尔滨 150080；²黑龙江大学农作物研究院,哈尔滨 150080；³农业部糖料产品质量安全风险评估实验室(哈尔滨）/中国农业科学院甜菜研究所,哈尔滨 150080）

收稿日期:2014-10-24 修回日期:2015-04-03 接受日期:2014-12-09 出版日期:2015-05-06 发布日期:2015-05-06
通讯作者: 马龙彪
基金资助:
黑龙江省普通高校甜菜遗传育种重点实验室甜菜现代产业技术体系建设项目“甜菜丰产抗病种质创新及新品种选育”(CARS-210104-01)。
第一作者简介：吴则东，男，1972年出生，黑龙江依兰人，副研究员，博士，主要从事甜菜遗传及分子育种的研究。通信地址：150080 黑龙江省哈尔滨市南岗区学府路74号黑龙江大学农作物研究院，Tel：0451-86604561，E-mail：331056376@qq.com。

Construction of Fingerprinting and Analysis of Genetic Diversity for 32 Beet Varieties

Wu Zedong^1,2,3, Wang Maoqian^1,2,3, Wu Yumei^1,2,3 , Wang Huazhong^1,2,3, Ma Longbiao^1,2,3

(¹Key Laboratory of Sugar Beet Genetic Breeding/Heilongjiang University, Harbin 150080; ²Crop Academy of Heilongjiang University, Harbin 150080;³Laboratory of Quality & Safety Risk Assessment for Sugar Crops Products (Harbin), Ministry of Agriculture, P. R. China/Sugarbeet Research Institute of Chinese Academy of Agricultural Sciences, 150080)

Received:2014-10-24 Revised:2015-04-03 Accepted:2014-12-09 Online:2015-05-06 Published:2015-05-06

摘要/Abstract

摘要： 为了对国外引进的甜菜品种进行鉴别以及分析不同甜菜品种之间的亲缘关系，利用SSR标记构建了32份引进甜菜品种的指纹图谱并进行了遗传多样性分析。从101对SSR引物中筛选出了21对谱带清晰、易于识别的引物，这21对引物共检测出127个等位位点，其中多态性位点为107个，多态性比率为83.6%，每对SSR引物扩增出的等位位点数为2~11个，平均每对引物扩增出6.1个基因型，扩增的条带大小在90~500 bp之间。利用3对引物SB04，S6和S7的引物组合构建的指纹图谱就能够区分32个品种。聚类分析结果表明，在遗传距离0.17处，所有的供试品种被分为3类，从分子水平上说明甜菜品种之间的遗传基础比较狭窄。聚类分析结果与甜菜品种的来源具有很好的一致性，基本上是同一公司或者同一国别的品种被聚在了一起。

关键词: 云南, 云南, 烤烟, 海拔, 品种, 适宜性

Abstract: In order to identify introduced beet varieties and analyze the genetic relationship between different beet varieties, fingerprinting and genetic relationship analysis of 32 introduced beet varieties were made by SSR primers. 21 pairs of primers with distinct band and easy to identify were screened out of 101 pairs of SSR primers. From the 21 pairs of primers, a total of 127 allelic sites were detected, of which polymorphic site came to 107, with the polymorphism rate reaching 83.6%. The allelic site amplified from each pair of SSR primer amounted to 2-11. On average, each pair of primer amplified 6.1 genotypes, and the amplified stripe size ranged from 90 to 500 bp. The fingerprinting of 32 varieties was constructed by 3 pairs of primers of SB04, S6 and S7. UPGMA cluster analysis of genetic distance showed that all of the varieties were divided into three classes at the genetic distance of 0.17. It indicated that the genetic basis of introduced varieties was narrow. The cluster analysis result well accorded with the origin of the beet variety, which showed that the beet varieties which gathered together basically came from the same company or country.

吴则东,王茂芊,吴玉梅,王华忠,马龙彪. 32个甜菜品种指纹图谱构建与遗传多样性分析[J]. 中国农学通报, 2015, 31(12): 169-174.

Wu Zedong,Wang Maoqian,Wu Yumei,Wang Huazhong and Ma Longbiao. Construction of Fingerprinting and Analysis of Genetic Diversity for 32 Beet Varieties[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2015, 31(12): 169-174.

参考文献

[1] Russell B L, Rathinasabapathi B, Hanson A D. Osmotic stress induces expression of choline monooxygenase in sugar beet and amaranth[J].Plant Physiology,1998,116(2):859-865.
[2] Draycott P. Sugar beet, World Agriculture Series[M].Suffolk: Blackwell Pub.,2006.
[3] 王桂艳,鞠平.我国甜菜制糖工业五十年回眸[J].中国甜菜糖业.2001(02):28-30.
[4] 马亚怀,邱军,陈连江,等.我国甜菜品种引进工作的现状与分析[J].中国糖料,2013(01):72-75.
[5] 贾继增.分子标记种质资源鉴定和分子标记育种[J].中国农业科学,1996,29(04):2-11.
[6] 匡猛,杨伟华,许红霞,等.中国棉花主栽品种DNA指纹图谱构建及SSR标记遗传多样性分析[J].中国农业科学,2011,44(01):20-27.
[7] 吴渝生,杨文鹏,郑用琏.3个玉米杂交种和亲本SSR指纹图谱的构建[J].作物学报,2003(04):496-500.
[8] 段艳凤,刘杰,卞春松,等.中国88个马铃薯审定品种SSR指纹图谱构建与遗传多样性分析[J].作物学报,2009,35(08):1451-1457.
[9] 程保山,万志兵,洪德林.35个粳稻品种SSR指纹图谱的构建及遗传相似性分析[J].南京农业大学学报,2007(03):1-8.
[10] 王华忠,吴则东,王晓武,等.利用SRAP与SSR标记分析不同类型甜菜的遗传多样性[J].作物学报,2008,34(01):37-46.
[11] Grimmer M, Trybush S, Hanley S, et al. An anchored linkage map for sugar beet based on AFLP, SNP and RAPD markers and QTL mapping of a new source of resistance to Beet necrotic yellow vein virus[J].Theoretical and Applied Genetics,2007,114(7):1151-1160.
[12] Gidner S, Lennefors B L, Nilsson N O, et al. QTL mapping of BNYVV resistance from the WB41 source in sugar beet[J].Genome,2005,48(2):279-285.
[13] 孙利萍,贾芝琪,胡建斌, 等. 碱裂解法快速提取番茄DNA的研究[J].河南农业大学学报,2012, 46(02):136-138.
[14] M?rchen M, Cuguen J, Michaelis G, et al. Abundance and length polymorphism of microsatellite repeats in Beta vulgaris L[J]. Theoretical and Applied Genetics,1996,92(3):326-333.
[15] Cureton A, Burns M, Ford-Lloyd B, et al. Development of simple sequence repeat (SSR) markers for the assessment of gene flow between sea beet (Beta vulgaris ssp. maritima) populations[J].Molecular Ecology Notes,2002,2(4):402-403.
[16] Viard F, Bernard J, Desplanque B. Crop-weed interactions in the Beta vulgaris complex at a local scale: allelic diversity and gene flow within sugar beet fields[J].Theoretical and Applied Genetics,2002,104(4):688-697.
[17] Laurent V, Devaux P, Thiel T, et al. Comparative effectiveness of sugar beet microsatellite markers isolated from genomic libraries and GenBank ESTs to map the sugar beet genome[J].Theoretical and applied genetics,2007,115(6):793-805.
[18] Smulders M J, Esselink G D, Everaert I, et al. Characterisation of sugar beet (Beta vulgaris L. ssp. vulgaris) varieties using microsatellite markers[J].BMC genetics,2010(11):41.
[19] 牛泽如,杨文柱,庞磊,等.基于ISSR和AFLP标记开发甜菜SSR引物[J].中国农学通报,2010,26(21):147-151.
[20] 王凤格,赵久然,郭景伦,等一种改进的玉米SSR标记的PAGE/快速银染检测新方法[J].农业生物技术学报,2004,12(05):606-607.
[21] 刘巧红,程大友,杨林,等.甜菜品种(系)的ISSR标记数字指纹图谱构建及聚类分析(英文)[J].农业工程学报,2012,28(S2):280-284.
[22] 史树德,魏磊,张子义,等甜菜EST-SSR引物的开发与应用[J].中国糖料,2011(3):1-5.
[23] 于歆,徐德昌,崔杰,等.双丰系列甜菜品种(系)AFLP亲缘关系及系谱分析[J].分子植物育种, 2004,2(2):229-234.
[24] 田自华,张子义,张剑峰,等.甜菜细胞质雄性不育系与其保持系线粒体DNA的RAPD分析[J].分子植物育种,2004,2(6): 817-828.
[25] 张春来.我国甜菜杂交种的遗传基础[J].中国农业科学,1995,28(S1):81-89.

32个甜菜品种指纹图谱构建与遗传多样性分析

Construction of Fingerprinting and Analysis of Genetic Diversity for 32 Beet Varieties

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[2]	王雪娇, 李梁, 毛昭庆, 李隆伟, 陈良正. 云南构建区域粮食产业链及供应链对策研究[J]. 中国农学通报, 2022, 38(5): 157-164.
[3]	关罗浩, 杨欣, 李超, 张艳玲, 张广富, 李永亮, 周汉平, 王广山, 钟帅, 戴华鑫. 留叶数对腾冲烟叶产质量的影响[J]. 中国农学通报, 2022, 38(4): 10-15.
[4]	黄磊, 李艺萌, 钟帅, 金保锋, 高晋军, 王晓园, 关罗浩, 王初亮, 黄妧婷, 李敏. 低氧贮存片烟解封后理化指标和质量变化研究[J]. 中国农学通报, 2022, 38(4): 107-112.
[5]	韩敏, 杨鹏武, 何雨芩, 胡雪琼, 朱勇. 阴雨寡照灾害对云南烤烟的种植风险预测[J]. 中国农学通报, 2022, 38(4): 69-75.
[6]	孟玮, 张建国. 健康视阈下城市公园绿地休闲游憩适宜性评价——以杭州城北体育公园为例[J]. 中国农学通报, 2022, 38(34): 59-67.
[7]	尚卫琼, 段志芬, 邓少春, 孙承冕, 杨毅坚, 李金龙, 夏锐, 刘本英. 云南地方茶树种质资源特异性评价[J]. 中国农学通报, 2022, 38(34): 76-81.
[8]	侯建林, 李思军, 何铭钰, 肖汉乾, 向铁军, 黄杰, 李武进, 肖艳松, 江智敏, 徐均华, 邓小华. 不同施肥模式对稻茬烤烟生长和干物质积累及产质量的影响[J]. 中国农学通报, 2022, 38(33): 39-43.
[9]	赵凯丽, 李福龙, 罗灿, 吴繁花, 蔡泽坪, 于旭东. 儋州市黄皮产业现状及发展前景[J]. 中国农学通报, 2022, 38(33): 52-59.
[10]	伊嘉雯, 冯棣, 朱崴, 亓娜, 滕奉魁, 卢小引. 不同品种水稻发芽阶段耐盐性对比研究[J]. 中国农学通报, 2022, 38(33): 10-14.
[11]	张志灵, 林海滨, 王新旺, 林隆, 陈星峰, 高伟民, 林祖斌, 陈庆文. 福建烤烟淀粉含量与外观质量和感官质量的关系[J]. 中国农学通报, 2022, 38(31): 136-141.
[12]	王月敏, 柯玉琴, 谢榕榕, 李春英, 李文卿. 喷施微肥对定位施肥烟株成熟期生理代谢的影响[J]. 中国农学通报, 2022, 38(31): 24-30.
[13]	梅丽, 韩立红, 周继华, 周吉红, 祝宁, 王俊英, 曹彩红, 何秉青. 藜麦菜用品种筛选及刈割可行性初探[J]. 中国农学通报, 2022, 38(31): 31-37.
[14]	马悦梅, 王荣党. 基于比较优势理论的云南省主要粮食作物优势指数化测度[J]. 中国农学通报, 2022, 38(30): 141-150.
[15]	陈检锋, 赵文军, 付利波, 尹梅, 王志远, 王伟, 王应学, 杨艳鲜, 陈华. 适产养分临界值模型对玉溪烤烟产质量的影响[J]. 中国农学通报, 2022, 38(28): 1-6.