番茄根内生芽孢杆菌的多样性和系统发育研究

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb17050121

中国农学通报 ›› 2018, Vol. 34 ›› Issue (8): 37-45.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.casb17050121

所属专题：园艺

番茄根内生芽孢杆菌的多样性和系统发育研究

程志强,雷少楠,熊娟,马荣琴,陈优优,李容丹,路晶晶,吴寒,龚玉杰,田宝玉

福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心生命科学学院,福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心生命科学学院,福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心生命科学学院,福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心生命科学学院,福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心,福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心生命科学学院,福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心生命科学学院,福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心生命科学学院,福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心生命科学学院,福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心生命科学学院

收稿日期:2017-05-26 修回日期:2018-02-24 接受日期:2017-07-21 出版日期:2018-03-21 发布日期:2018-03-21
通讯作者: 田宝玉
基金资助:
国家自然科学(31670125)和福建省自然科学基金(2017J01625)资助。

Diversity and Phylogenetic Analysis of Root Endophytic Bacillus in Tomato

陈优优,李容丹,路晶晶,吴寒,龚玉杰 and 田宝玉

Received:2017-05-26 Revised:2018-02-24 Accepted:2017-07-21 Online:2018-03-21 Published:2018-03-21

摘要/Abstract

摘要： 旨在了解番茄根内生芽孢杆菌(Bacillus spp.)的分布和物种多样性。采用纯培养的方法从11 种不同的番茄栽培品种中分离纯化根内生芽孢杆菌，并通过16S rRNA基因序列的扩增、测序和分析进行分子鉴定及系统发育分析。从11 个样品中分离出芽孢杆菌65 株，分别鉴定为芽孢杆菌属(Bacillus)和短芽孢杆菌属(Brevibacterium)的18 个种。不同的番茄栽培品种分离的根内生芽孢杆菌的种类存在差异。系统发育分析表明分离的内生芽孢杆菌聚为几个小簇和不同种群，但是来源于不同番茄品种的同一种属的芽孢杆菌菌株的16S rRNA基因序列聚为同一分支，并且没有明显的差异。研究表明不同番茄栽培品种的根内生芽孢杆菌存在广泛的物种和分布多样性。

关键词: 富马酸二甲酯, 富马酸二甲酯, 柑橘, 贮藏品质

Abstract: The study aims to investigate the distribution and species diversity of tomato root endophytic Bacillus. The endophytic Bacillus strains were isolated from 11 tomato cultivars using the traditional pure culturing method, and the molecular identification and phylogenetic analysis were conducted with 16S rRNA amplification, sequencing and analysis. A total of 65 endophytic isolates were obtained and identified as 18 species of Bacillus and Brevibacterium. The types of endophytic Bacillus strains from different cultivars were different. Phylogenetic analysis indicated that Bacillus spp. were clustered into different branches and populations. However, there was no obvious sequence difference for the same species from different tomato cultivars. The study indicated that the root endophytic Bacillus from different tomato cultivars had extensive species and distribution diversity.

中图分类号:

Q939.96

程志强,雷少楠,熊娟,马荣琴,陈优优,李容丹,路晶晶,吴寒,龚玉杰,田宝玉. 番茄根内生芽孢杆菌的多样性和系统发育研究[J]. 中国农学通报, 2018, 34(8): 37-45.

陈优优,李容丹,路晶晶,吴寒,龚玉杰 and 田宝玉. Diversity and Phylogenetic Analysis of Root Endophytic Bacillus in Tomato[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2018, 34(8): 37-45.

参考文献

[1] Rosenberg E, Zilber-Rosenberg I. The hologenome concept: human, animal and plant microbiota[M]. Berlin Heidelberg: Springer, 2013.
[2] Hardoim PR, van Overbeek L S, van Elsas J D. Properties of bacterial endophytes and their proposed role in plant growth[J]. Trends in microbiology, 2008, 16(10): 463-471.
[3] Turner TR, James EK, Poole PS. The plant microbiome[J]. Genome biology, 2013, 14(6): 209.
[4] Bulgarelli D, Schlaeppi K, Spaepen S, et al. Structure and functions of the bacterial microbiota of plants[J]. Annual review of plant biology, 2013, 64: 807-838.
[5] Berg G. Plant–microbe interactions promoting plant growth and health: perspectives for controlled use of microorganisms in agriculture[J]. Applied microbiology and biotechnology, 2009, 84(1): 11–18.
[6] 许明双, 生吉萍, 郭顺堂, 等. 水稻内生菌 K12G2 菌株的鉴定及其促生特性研究[J]. 中国农学通报, 2014, 30(9): 66-70.
[7] Monta?ez A, Blanco AR, Barlocco C, et al. Characterization of cultivable putative endophytic plant growth promoting bacteria associated with maize cultivars (Zea mays L.) and their inoculation effects in vitro[J]. Applied Soil Ecology, 2012, 58: 21-28.
[8] Ma RQ, Cao Y, Cheng ZQ, et al. Identification and genomic analysis of antifungal property of a tomato root endophyte Pseudomonas sp. p21[J]. Antonie van Leeuwenhoek, 2017, 110: 387-397.
[9] 欧雄常, 柳凤, 詹儒林, 等. 拮抗辣椒疫病菌的红树内生细菌筛选及RS261菌株鉴定[J]. 微生物学通报, 2009, 36(2): 175-180.
[10] 王美琴, 刘慧平, 韩巨才, 等. 番茄内生细菌种群动态分析及拮抗菌株的筛选[J]. 中国农学通报, 2010, 26(9): 277-282.
[11] 陈兰, 张小平. 药用植物内生芽孢杆菌的多样性和系统发育研究[J]. 微生物学报, 2008, 48(4): 432-438.
[12] 葛慈斌, 刘波, 车建美, 等. 武夷山地衣表生和内生芽孢杆菌种群的多样性[J]. 微生物学报, 2015, 55(5): 551-563.
[13] 闫孟红, 蔡正求, 韩继刚, 等. 植物内生细菌在防治植物病害中的应用研究[J]. 生物技术通报, 2004, 3(8).
[14] 李晶, 张淑梅, 王玉霞, 等. 一种枯草芽孢杆菌B29菌株拌种剂对大豆根腐病的田间防效研究[J]. 微生物学通报, 2009 (6): 842-846.
[15] 王进, 黄艳飞, 汪汉成, 等. 烟草疫霉拮抗菌枯草芽孢杆菌21b菌株的分离鉴定及其生物学特性研究[J]. 微生物学通报, 2014, 41(12): 2481-2487.
[16] 曾大兴, 张晓阳, 贾书娟, 等. 枯草芽孢杆菌 C-D6对辣椒炭疽菌附着胞形成的抑制作用研究[J]. 微生物学通报, 2015, 42(12): 2377-2385.
[17] Zalila-Kolsi I, Mahmoud AB, Ali H, et al. Antagonist effects of Bacillus spp. strains against Fusarium graminearum for protection of durum wheat (Triticum turgidum L. subsp. durum)[J]. Microbiological Research, 2016, 192: 148-158.
[18] 齐爱勇, 赵绪生, 刘大群. 芽孢杆菌生物防治植物病害研究现状[J]. 中国农学通报, 2011, 27(12): 277-280.
[19] Bacon CW, Yates IE, Hinton DM, et al. Biological control of Fusarium moniliforme in maize[J]. Environmental Health Perspectives, 2001, 109(Suppl 2): 325-332.
[20] 陈中义, 张杰, 黄大昉. 植物病害生防芽孢杆菌抗菌机制与遗传改良研究[J]. 植物病理学报, 2003, 33(2): 97-103.
[21] 谢越盛, 许泉, 王大成, 等. 植物根际促生枯草芽孢杆菌 JC01筛选[J]. 微生物学通报, 2016, 10: 2187-2196.
[22] 武利勤, 顾海科, 王青, 等. 石斛内生甲基营养芽胞杆菌的拮抗和促生作用研究[J]. 生物技术通报, 2016, 32(8): 200-206.
[23] 李艳琴, 申泉, 刘彬彬, 等. 番茄内生菌分离及其 ERIC—PCR 指纹图谱分析[J]. 微生物学通报, 2003, 30(5).
[24] 胡青平, 徐建国, 刘会龙, 等. 番茄茎内生细菌的分离鉴定及青枯病拮抗菌的筛选[J]. 西北植物学报, 2006, 26(10): 2039-2043.
[25] 黎起秦, 谢义灵, 林纬, 等. 广西番茄内生细菌的多样性和数量动态[J]. 生物多样性, 2006, 14(6): 534-540.
[26] Moreno C, Romero J, Espejo RT. Polymorphism in repeated 16S rRNA genes is a common property of type strains and environmental isolates of the genus Vibrio[J]. Microbiology, 2002, 148(4): 1233-1239.
[27] Jeanmougin F, Thompson J D, Gouy M, et al. Multiple sequence alignment with Clustal X[J]. Trends in biochemical sciences, 1998, 23(10): 403-405.
[28] Hall BG. Building phylogenetic trees from molecular data with MEGA[J]. Molecular biology and evolution, 2013, 30(5): 1229-1235.
[29] Robert P. Ryan,SKieran Germaine,SAshley Franks, et, al. Bacterial endophytes: recent developments and applications[J]. FEMS Microbiology Letters, 2008, 278(1): 1–9.
[30] Tian BY, Yang JK, Zhang Ke-Qin. Bacteria used in the biological control of plant-parasitic nematodes: populations, mechanisms of action, and future prospects[J]. FEMS Microbiology Ecology, 2007, 61(2): 197–213.
[31] Tan SY, Jiang Y, Song S, et al. Two Bacillus amyloliquefaciens strains isolated using the competitive tomato root enrichment method and their effects on suppressing Ralstonia solanacearum and promoting tomato plant growth[J]. Crop Protection, 2013, 43: 134-140.

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[1]	郑碧霞, 戢小梅, 李长林, 龚林忠, 方林川. 不同复合保鲜处理对‘夏黑’果实贮藏效果的影响[J]. 中国农学通报, 2022, 38(7): 135-143.
[2]	王超, 杨长耀, 李菲菲, 马小川, 陈岳文, 肖志伟, 尹韬, 叶丽, 李云松, 卢晓鹏. 柑橘CsaccA基因功能鉴定[J]. 中国农学通报, 2022, 38(28): 28-35.
[3]	龚碧涯, 欧阳革成, 刘慧, 肖伏莲, 杨水芝, 侯柏华, 李先信, 罗琳. 湖南地区柑橘大实蝇幼虫入土化蛹规律研究[J]. 中国农学通报, 2022, 38(16): 119-124.
[4]	鲍远放, 张绿萍, 郑伟, 王彬. BTH处理对火龙果采后抗病性及贮藏品质的影响[J]. 中国农学通报, 2022, 38(10): 134-140.
[5]	徐明玉, 杜春梅. 柑橘青霉病防治的研究进展[J]. 中国农学通报, 2021, 37(9): 142-148.
[6]	刘武, 莫家尧, 李政, 王建东, 郑传伟, 张蕾. 广西柑橘气候适宜度模型[J]. 中国农学通报, 2021, 37(25): 109-114.
[7]	李亚, 蔡永军, 余沁涵, 孔少连, 周晓晴, 张颖荷. 柠檬叶片溃疡病菌的分离鉴定及室内防治药剂筛选[J]. 中国农学通报, 2021, 37(24): 146-153.
[8]	张莉, 王瑞庆, 赵刚, 王爱斌, 林国卫. 广丰马家柚与平和红柚果实品质比较研究[J]. 中国农学通报, 2021, 37(22): 126-130.
[9]	王迅, 熊博, 李启权, 廖玲, 邓红红, 邓群仙, 余东, 祝进, 汪志辉. 四川省晚熟柑橘生态气候适宜性区划研究[J]. 中国农学通报, 2021, 37(13): 94-101.
[10]	王晓荣, 唐万鹏, 付甜, 黄志霖, 何伟, 刘常富. 不同管理措施对三峡库区柑橘园土壤养分和径流氮磷流失的影响[J]. 中国农学通报, 2021, 37(11): 95-102.
[11]	刘涛, 王华玲, 吴伟, 余莉, 彭家清. 2018年十堰柑橘冻害气象条件分析及预防恢复措施[J]. 中国农学通报, 2020, 36(4): 90-94.
[12]	黄海洪,谭宗琨,罗永明,王莹. 基于气象要素影响的柑橘定量滴灌模型研究[J]. 中国农学通报, 2019, 35(9): 127-131.
[13]	蒲占湑,黄振东,鹿连明,杜丹超,胡秀荣. 浙江省柑橘黑点病菌对代森锰锌、咪鲜胺、王铜、嘧菌酯和甲基硫菌灵的敏感性[J]. 中国农学通报, 2019, 35(32): 115-120.
[14]	刘文静,潘葳. 柑橘属果实中类黄酮成分的高效液相色谱标准化测定方法[J]. 中国农学通报, 2018, 34(32): 157-164.
[15]	郭境颖,胡彧娴,赖添财,潘裕添. QuEChERS 结合HPLC-MS/MS 测定柑橘中5种杀螨剂残留[J]. 中国农学通报, 2018, 34(24): 64-70.