利用DAMD分子标记构建甜菜品种的分子身份证

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb2022-0186

摘要/Abstract

摘要：

为了根据遗传背景快速区分和鉴定甜菜品种的真实性和特异性,补充和打破形态学鉴定法的短板和局限,以96份甜菜登记品种为试材,采用DAMD分子标记技术构建了甜菜品种的分子身份证。结果显示,有7条扩增条带清晰、多态性较好的DAMD引物可用于鉴别甜菜品种,这7条引物共检测出103条带,其中多态性条带101条,多态性98.1%;96个品种间的最小遗传距离为0.039,最大为0.485,平均遗传距离0.237。通过聚类分析,96个甜菜品种被分为两类群,类群I仅有54号品种,类群II包含其余95个品种,类群II进一步又分两个亚群。仅利用URP1F、URP17R和URP2R这3条引物组合将96个供试甜菜品种完全区分。利用DAMD引物构建甜菜品种的分子身份证,为快速、高效地鉴定甜菜品种提供了一种新的途径,也为保护育种家和农民的利益提供了保障。

关键词: 甜菜, DAMD, 分子标记, 分子身份证, 指纹图谱, 聚类分析

Abstract:

In order to quickly distinguish and identify the authenticity and specificity of sugar beet varieties according to their genetic backgrounds, and to replenish the shortcoming and break the limitation of morphological identification, using 96 registered sugar beet varieties as test materials, the molecular identity of varieties was constructed by DAMD molecular marker technology. The results showed that 7 DAMD primers with clear amplification bands and good polymorphism could be used to identify sugar beet varieties. A total of 103 bands were detected, including 101 polymorphic bands, and the polymorphism was 98.1%. The minimum genetic distance among the 96 varieties was 0.039, the maximum was 0.485, and the average genetic distance was 0.237. Through cluster analysis, the 96 sugar beet varieties were divided into two groups, group I only had variety number 54, group II contained the rest 95 varieties, and group II was further divided into two subgroups. After that, the 96 sugar beet varieties were completely distinguished by the combination of three primers URP1F, URP17R and URP2R. The establishment of molecular identity of sugar beet varieties based on DAMD primers provided a new way for rapid and efficient identification of sugar beet varieties, and also provided a guarantee for protecting the interests of breeders and farmers.

Key words: sugar beet, DAMD, molecular marker, molecular identity, fingerprint, clustering analysis

中图分类号:

S566

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图/表 4

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品种编号		名称		来源	品种编号		名称		来源
01		HI0936		先正达参股股份有限公司	49		SV1752		荷兰安地国际有限公司
02		VF3019		荷兰威菲尔德农业科技有限公司	50		KUHN1277		荷兰安地国际有限公司
03		SS1532		石河子农业科学研究院	51		SX1517		荷兰安地国际有限公司
04		BETA796		美国BETASEED公司	52		KWS3410		KWS SAAT SE
05		BETA468		美国BETASEED公司	53		KUHN4092		荷兰安地国际有限公司
06		BETA176		美国BETASEED公司	54		KWS7125		KWS SAAT SE
07		KUHN8060		荷兰安地国际有限公司	55		KTA1118		Kutnowska Hodowla Buraka Cukrowego Sp.zo.o
08		KUHN1178		荷兰安地国际有限公司	56		KWS5599		KWS SAAT SE
09		KUHN9046		荷兰安地国际有限公司	57		KWS6661		KWS SAAT SE
10		SV1375		荷兰安地国际有限公司	58		HDTY02		黑龙江大学
11		HX910		荷兰安地国际有限公司	59		航甜单0919		黑龙江大学
12		H003		荷兰安地国际有限公司	60		LS1805		英国莱恩种业
13	LS1210		英国莱恩种业		61	LN1708		英国莱恩种业
14	LS1321		英国莱恩种业		62	LN17101		英国莱恩种业
15	AK3018		荷兰威菲尔德农业科技有限公司		63	IM1162		荷兰安地国际有限公司
16	RIVAL		荷兰安地国际有限公司		64	KUHN5012		荷兰安地国际有限公司
17	GGR1609		WIELKOPOLSKA HODOWLA BURAKA CUKROWEGO公司		65	MK4044		荷兰安地国际有限公司
18	Flores		MariboHilleshog ApS麦瑞博西索科有限公司		66	H7IM15		荷兰安地国际有限公司
19	MK4062		荷兰安地国际有限公司		67	SR496		荷兰安地国际有限公司
20	H004		荷兰安地国际有限公司		68	IM802		荷兰安地国际有限公司
21	LS1216		英国莱恩种业		69	SV1555		荷兰安地国际有限公司
22	SX181		荷兰安地国际有限公司		70	SR-411		荷兰安地国际有限公司
23	KUHN1001		荷兰安地国际有限公司		71	SV1433		荷兰安地国际有限公司
24	MA10-6		MariboHilleshog ApS		72	HI0479		先正达（中国）投资有限公司
25	MA11-8		MariboHilleshog ApS		73	HI0474		先正达（中国）投资有限公司
26	LS1318		英国莱恩种业		74	HI1003		先正达（中国）投资有限公司
27	LN80891		英国莱恩种业		75	HI1059		先正达（中国）投资有限公司
28	SV1434		荷兰安地国际有限公司		76	H809		荷兰安地国际有限公司
29	KWS1231		KWS SAAT SE		77	KWS1176		KWS SAAT SE
30	BTS2730		美国BETASEED公司		78	KWS4502		KWS SAAT SE
31	BTS5950		美国BETASEED公司		79	KWS9147		KWS SAAT SE
32	BTS8840		美国BETASEED公司		80	KWS1197		KWS SAAT SE
33	KWS2314		KWS SAAT SE		81	MA097		MariboHilleshog ApS
34	SV1366		荷兰安地国际有限公司		82	MA104		MariboHilleshog ApS
35	SX1511		荷兰安地国际有限公司		83	MA3005		MariboHilleshog ApS
36	SX1512		荷兰安地国际有限公司		84	MA3001		MariboHilleshog ApS
37	XJT9907		新疆农业科学院经济作物研究所		85	MA2070		MariboHilleshog ApS
38	KUHN1387		荷兰安地国际有限公司		86	BETA240		美国BETASEED公司
39	SV893		荷兰安地国际有限公司		87	PJ1		荷兰安地国际有限公司
40	MK4162		荷兰安地国际有限公司		88	爱丽斯		荷兰安地国际有限公司
41	MK4085		荷兰安地国际有限公司		89	KUHN8062		荷兰安地国际有限公司
42	SV1588		荷兰安地国际有限公司		90	LN90910		英国莱恩种业
43	KUHN1260		荷兰安地国际有限公司		91	甘糖7号		武威三农种业科技有限公司
44	KUHN1357		荷兰安地国际有限公司		92	CH0612		荷兰安地国际有限公司
45	BTS2860		美国BETASEED公司		93	KUHN814		荷兰安地国际有限公司
46	NT39106		内蒙古自治区农牧业科学院特色作物研究所		94	新甜15号		新疆农业科学院经济作物研究所
47	KUHN1280		荷兰安地国际有限公司		95	新甜14号		新疆农业科学院经济作物研究所
48	KWS3354		KWS SAAT SE		96	Elma1214		英国莱恩种业

品种编号		名称		来源	品种编号		名称		来源
01		HI0936		先正达参股股份有限公司	49		SV1752		荷兰安地国际有限公司
02		VF3019		荷兰威菲尔德农业科技有限公司	50		KUHN1277		荷兰安地国际有限公司
03		SS1532		石河子农业科学研究院	51		SX1517		荷兰安地国际有限公司
04		BETA796		美国BETASEED公司	52		KWS3410		KWS SAAT SE
05		BETA468		美国BETASEED公司	53		KUHN4092		荷兰安地国际有限公司
06		BETA176		美国BETASEED公司	54		KWS7125		KWS SAAT SE
07		KUHN8060		荷兰安地国际有限公司	55		KTA1118		Kutnowska Hodowla Buraka Cukrowego Sp.zo.o
08		KUHN1178		荷兰安地国际有限公司	56		KWS5599		KWS SAAT SE
09		KUHN9046		荷兰安地国际有限公司	57		KWS6661		KWS SAAT SE
10		SV1375		荷兰安地国际有限公司	58		HDTY02		黑龙江大学
11		HX910		荷兰安地国际有限公司	59		航甜单0919		黑龙江大学
12		H003		荷兰安地国际有限公司	60		LS1805		英国莱恩种业
13	LS1210		英国莱恩种业		61	LN1708		英国莱恩种业
14	LS1321		英国莱恩种业		62	LN17101		英国莱恩种业
15	AK3018		荷兰威菲尔德农业科技有限公司		63	IM1162		荷兰安地国际有限公司
16	RIVAL		荷兰安地国际有限公司		64	KUHN5012		荷兰安地国际有限公司
17	GGR1609		WIELKOPOLSKA HODOWLA BURAKA CUKROWEGO公司		65	MK4044		荷兰安地国际有限公司
18	Flores		MariboHilleshog ApS麦瑞博西索科有限公司		66	H7IM15		荷兰安地国际有限公司
19	MK4062		荷兰安地国际有限公司		67	SR496		荷兰安地国际有限公司
20	H004		荷兰安地国际有限公司		68	IM802		荷兰安地国际有限公司
21	LS1216		英国莱恩种业		69	SV1555		荷兰安地国际有限公司
22	SX181		荷兰安地国际有限公司		70	SR-411		荷兰安地国际有限公司
23	KUHN1001		荷兰安地国际有限公司		71	SV1433		荷兰安地国际有限公司
24	MA10-6		MariboHilleshog ApS		72	HI0479		先正达（中国）投资有限公司
25	MA11-8		MariboHilleshog ApS		73	HI0474		先正达（中国）投资有限公司
26	LS1318		英国莱恩种业		74	HI1003		先正达（中国）投资有限公司
27	LN80891		英国莱恩种业		75	HI1059		先正达（中国）投资有限公司
28	SV1434		荷兰安地国际有限公司		76	H809		荷兰安地国际有限公司
29	KWS1231		KWS SAAT SE		77	KWS1176		KWS SAAT SE
30	BTS2730		美国BETASEED公司		78	KWS4502		KWS SAAT SE
31	BTS5950		美国BETASEED公司		79	KWS9147		KWS SAAT SE
32	BTS8840		美国BETASEED公司		80	KWS1197		KWS SAAT SE
33	KWS2314		KWS SAAT SE		81	MA097		MariboHilleshog ApS
34	SV1366		荷兰安地国际有限公司		82	MA104		MariboHilleshog ApS
35	SX1511		荷兰安地国际有限公司		83	MA3005		MariboHilleshog ApS
36	SX1512		荷兰安地国际有限公司		84	MA3001		MariboHilleshog ApS
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38	KUHN1387		荷兰安地国际有限公司		86	BETA240		美国BETASEED公司
39	SV893		荷兰安地国际有限公司		87	PJ1		荷兰安地国际有限公司
40	MK4162		荷兰安地国际有限公司		88	爱丽斯		荷兰安地国际有限公司
41	MK4085		荷兰安地国际有限公司		89	KUHN8062		荷兰安地国际有限公司
42	SV1588		荷兰安地国际有限公司		90	LN90910		英国莱恩种业
43	KUHN1260		荷兰安地国际有限公司		91	甘糖7号		武威三农种业科技有限公司
44	KUHN1357		荷兰安地国际有限公司		92	CH0612		荷兰安地国际有限公司
45	BTS2860		美国BETASEED公司		93	KUHN814		荷兰安地国际有限公司
46	NT39106		内蒙古自治区农牧业科学院特色作物研究所		94	新甜15号		新疆农业科学院经济作物研究所
47	KUHN1280		荷兰安地国际有限公司		95	新甜14号		新疆农业科学院经济作物研究所
48	KWS3354		KWS SAAT SE		96	Elma1214		英国莱恩种业

序号	引物	正向序列(5'-3')
1	URP32F	TACACGTCTCGATCTACAGG
2	URP6R	GGCAAGCTGGTGGGAGGTAC
3	URP13R	TACATCGCAAGTGACACAGG
4	URP2R	CCCAGCAACTGATCGCACAC
5	URP1F	ATCCAAGGTCAGTTGCTGGG
6	URP4R	AGGACTCGATAACAGGCTCC
7	URP17R	AATGTGGGCAAGCTGGTGGT

序号	引物	正向序列(5'-3')
1	URP32F	TACACGTCTCGATCTACAGG
2	URP6R	GGCAAGCTGGTGGGAGGTAC
3	URP13R	TACATCGCAAGTGACACAGG
4	URP2R	CCCAGCAACTGATCGCACAC
5	URP1F	ATCCAAGGTCAGTTGCTGGG
6	URP4R	AGGACTCGATAACAGGCTCC
7	URP17R	AATGTGGGCAAGCTGGTGGT