基于ISSR标记的龙眼种质资源遗传多样性及亲缘关系分析

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb2021-1199

摘要/Abstract

摘要：

为明确收集的龙眼种质资源遗传多样性水平和亲缘关系,以20份龙眼种质资源为研究对象,采用ISSR分子标记进行遗传多样性及亲缘关系分析。11条引物共扩增出113条DNA片段,其中多态性片段90条,占总扩增片段数的79.65%。供试龙眼材料的遗传相似系数介于0.5487~0.8673之间,平均遗传相似系数0.7758。20份龙眼资源材料的ISSR聚类结果表明,供试龙眼材料间的亲缘关系较近,聚类结果受亲本关系影响,一定程度上反映了品种的地理分布情况,与传统分类方法较为一致。研究结果为龙眼种质资源的分类、遗传进化研究及杂交组合选配提供一定的理论和技术支持。

关键词: 龙眼, 简单序列重复区间, 分子标记, 遗传多样性, 亲缘关系

Abstract:

In order to clarify the genetic diversity level and genetic relationship of the collected longan germplasm resources, ISSR molecular markers were used to analyze the genetic characterization of 20 longan germplasm resources. The results showed that 113 DNA fragments were amplified from 11 ISSR primers, of which 90 fragments (79.65%) were polymorphic. The genetic similarity coefficient ranged from 0.5487 to 0.8673, and the average value was 0.7758. The ISSR clustering results of the 20 longan germplasm resources showed that the genetic relationship of the tested longan materials was close. The clustering results were affected by the parental relationship and the geographical distribution to a certain extent, which was more consistent with the traditional classification methods. The results provided theoretical and technical support for the classification, conservation and utilization, genetic evolution research and hybrid combination selection of the longan resources.

Key words: longan, inter-simple sequence repeat, molecular marker, genetic diversity, genetic relationship

中图分类号:

S667.2

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图/表 6

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编号	品种（品系）	选育途径	来源地
1	水南1号	实生选育	莆田荔城区
2	美国1号	引种	美国夏威夷
3	泉龙103	实生选育	泉州鲤城区
4	泉龙104	芽变选种	泉州鲤城区
5	泉龙157	实生选育	福州福清市
6	泉龙207	实生选育	泉州泉港区
7	泉龙222	实生选育	漳州龙海市
8	泉龙223	实生选育	漳州龙海市
9	美国2号	引种	美国夏威夷
10	石硖	引种	广西平南县
11	四季蜜	引种	广西
12	晚香	实生选育	不详
13	斑叶龙眼	实生选育	福建莆田市
14	凤梨穗	实生选育	厦门同安区
15	白皮龙眼	引种	马来西亚
16	松风本	实生选育	福建莆田市
17	软枝乌龙岭	实生选育	莆田城厢区
18	翠香	杂交育种	福建福州市
19	福晚3号	杂交育种	福建福州市
20	福晚8号	杂交育种	福建福州市

编号	品种（品系）	选育途径	来源地
1	水南1号	实生选育	莆田荔城区
2	美国1号	引种	美国夏威夷
3	泉龙103	实生选育	泉州鲤城区
4	泉龙104	芽变选种	泉州鲤城区
5	泉龙157	实生选育	福州福清市
6	泉龙207	实生选育	泉州泉港区
7	泉龙222	实生选育	漳州龙海市
8	泉龙223	实生选育	漳州龙海市
9	美国2号	引种	美国夏威夷
10	石硖	引种	广西平南县
11	四季蜜	引种	广西
12	晚香	实生选育	不详
13	斑叶龙眼	实生选育	福建莆田市
14	凤梨穗	实生选育	厦门同安区
15	白皮龙眼	引种	马来西亚
16	松风本	实生选育	福建莆田市
17	软枝乌龙岭	实生选育	莆田城厢区
18	翠香	杂交育种	福建福州市
19	福晚3号	杂交育种	福建福州市
20	福晚8号	杂交育种	福建福州市

引物	引物序列(5’- 3’)	扩增条带/条	多态性条带/条	多态性比例/%	Tm/℃	实验T值/℃
UBC807	AGAGAGAGAGAGAGAGT	12	9	75.00	46.4	49.9
UBC810	GAGAGAGAGAGAGAGAT	8	7	87.50	44.9	48.8
UBC812	GAGAGAGAGAGAGAGAA	15	11	73.33	45.1	47.1
UBC825	ACACACACACACACACT	8	6	75.00	50.8	52.8
UBC835	AGAGAGAGAGAGAGAGYC	12	10	83.33	50.2	52.8
UBC841	GAGAGAGAGAGAGAGAYC	10	6	60.00	48.5	50.5
UBC855	ACACACACACACACACYT	7	7	100.00	47.0	56.3
UBC857	ACACACACACACACACYG	8	7	87.50	54.3	56.3
UBC873	GACAGACAGACAGACA	7	5	71.43	46.9	46.8
UBC878	GGATGGATGGATGGAT	13	9	69.23	47.0	48.7
UBC881	GGGTGGGGTGGGGTG	13	13	100.00	60.6	58.6
总计		113	90
平均		10.27	8.18	79.65

引物	引物序列(5’- 3’)	扩增条带/条	多态性条带/条	多态性比例/%	Tm/℃	实验T值/℃
UBC807	AGAGAGAGAGAGAGAGT	12	9	75.00	46.4	49.9
UBC810	GAGAGAGAGAGAGAGAT	8	7	87.50	44.9	48.8
UBC812	GAGAGAGAGAGAGAGAA	15	11	73.33	45.1	47.1
UBC825	ACACACACACACACACT	8	6	75.00	50.8	52.8
UBC835	AGAGAGAGAGAGAGAGYC	12	10	83.33	50.2	52.8
UBC841	GAGAGAGAGAGAGAGAYC	10	6	60.00	48.5	50.5
UBC855	ACACACACACACACACYT	7	7	100.00	47.0	56.3
UBC857	ACACACACACACACACYG	8	7	87.50	54.3	56.3
UBC873	GACAGACAGACAGACA	7	5	71.43	46.9	46.8
UBC878	GGATGGATGGATGGAT	13	9	69.23	47.0	48.7
UBC881	GGGTGGGGTGGGGTG	13	13	100.00	60.6	58.6
总计		113	90
平均		10.27	8.18	79.65

	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20
1	1.0000
2	0.7434	1.0000
3	0.8407	0.7434	1.0000
4	0.8053	0.7257	0.8407	1.0000
5	0.7876	0.7788	0.8407	0.8407	1.0000
6	0.8053	0.7434	0.8407	0.8053	0.8053	1.0000
7	0.7788	0.7345	0.8319	0.8319	0.8319	0.8142	1.0000
8	0.8496	0.7345	0.8319	0.8142	0.8319	0.7965	0.8230	1.0000
9	0.7788	0.8053	0.7611	0.7611	0.7434	0.7611	0.7522	0.7522	1.0000
10	0.7788	0.7876	0.7434	0.7788	0.7965	0.7965	0.7876	0.7699	0.7699	1.0000
11	0.7965	0.7876	0.8142	0.8142	0.8319	0.7611	0.8230	0.7876	0.7699	0.8407	1.0000
12	0.7965	0.8230	0.7434	0.7965	0.8142	0.7434	0.7345	0.7522	0.8053	0.8230	0.7876	1.0000
13	0.7611	0.7522	0.7434	0.7611	0.7611	0.7611	0.7876	0.7876	0.7876	0.7699	0.7522	0.7876	1.0000
14	0.7611	0.6991	0.7611	0.6372	0.7434	0.7611	0.6991	0.7345	0.7345	0.7168	0.6991	0.6991	0.6637	1.0000
15	0.6814	0.6903	0.6637	0.6637	0.6814	0.6814	0.6372	0.6549	0.7434	0.6549	0.6726	0.7257	0.7257	0.6726	1.0000
16	0.8053	0.7257	0.8053	0.7876	0.8053	0.8053	0.8496	0.8673	0.7965	0.7788	0.7611	0.7434	0.8673	0.7257	0.6814	1.0000
17	0.7434	0.7168	0.7434	0.7257	0.7434	0.7257	0.7168	0.7168	0.7345	0.7168	0.7345	0.7345	0.6991	0.6991	0.6549	0.7257	1.0000
18	0.7434	0.7168	0.7611	0.7257	0.7257	0.7965	0.7699	0.7168	0.6991	0.7168	0.6991	0.6991	0.7522	0.7168	0.5841	0.7965	0.6991	1.0000
19	0.7611	0.7699	0.8142	0.7965	0.8319	0.7965	0.7699	0.7699	0.7345	0.7168	0.7345	0.7522	0.7699	0.7168	0.6018	0.7965	0.7876	0.8230	1.0000
20	0.6726	0.7168	0.6903	0.7080	0.7434	0.6549	0.7345	0.6991	0.6814	0.6814	0.6991	0.6991	0.6991	0.6637	0.5487	0.6726	0.7345	0.7168	0.8053	1.0000