中国农学通报 ›› 2024, Vol. 40 ›› Issue (5): 27-33.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.casb2023-0123
王佳1(), 周德宝2, 张军生2, 钱莹莹1, Mansoor HAYAT1, 王占斌1()
收稿日期:
2023-02-21
修回日期:
2023-05-23
出版日期:
2024-02-01
发布日期:
2024-02-01
通讯作者:
作者简介:
王佳,女,1999年出生,内蒙古赤峰人,研究生,研究方向:森林病理学研究。通信地址:150040 黑龙江省哈尔滨市香坊区东北林业大学,E-mail:2020038391@qq.com。
基金资助:
WANG Jia1(), ZHOU Debao2, ZHANG Junsheng2, QIAN Yingying1, Mansoor HAYAT1, WANG Zhanbin1()
Received:
2023-02-21
Revised:
2023-05-23
Published-:
2024-02-01
Online:
2024-02-01
摘要:
本文通过探究樟子松针叶不同发病程度的真菌群落多样性,为叶部病害的鉴定与防治提供有价值的信息。对樟子松针叶进行采样,通过高通量测序技术对所采集的样本进行真菌群落多样性分析。对相对丰度最高的真菌进行BLAST比对,构建系统发育树并进行分析。9个针叶样本中物种相对丰度主要分布于子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)之中,罗兹菌门(Rozellomycota)的真菌也极少量存在于针叶内。其中“门”水平上子囊菌门是相对丰度占比最大的优势门。优势科为球腔菌科,该科在3个不同林区重病样本W3-3、T78-3、T87-3中的占比分别为92%、92%、29%。研究发现,不同林区群落组成结构有一定差异,并且不同发病程度引起物种组成均匀度不同,表明发病后真菌的相对丰度既受到发病程度的影响也受到地理环境的影响。随着发病程度提升,D.septosporum占比提高。基于病原菌的ITS序列构建发育树,确认引起3个林区樟子松叶部病害松针红斑病的病原菌为松穴褥盘孢菌。
王佳, 周德宝, 张军生, 钱莹莹, Mansoor HAYAT, 王占斌. 基于高通量测序的樟子松叶部病害分析及叶际真菌群落多样性研究[J]. 中国农学通报, 2024, 40(5): 27-33.
WANG Jia, ZHOU Debao, ZHANG Junsheng, QIAN Yingying, Mansoor HAYAT, WANG Zhanbin. High-throughput Sequencing Analysis of Leaf Disease of Pinus sylvestris var. mongolica and Diversity of Interleaf Fungal Communities[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2024, 40(5): 27-33.
序号 | 种名 | 登录号 | 寄主植物 | 备注 |
---|---|---|---|---|
1 | Dothistroma septosporum | MT256139.1 | P. sylvestris | 白俄罗斯 |
2 | Dothistroma septosporum | MT256138.1 | P. sylvestris | 白俄罗斯 |
3 | Dothistroma septosporum | MT256137.1 | P. sylvestris | 白俄罗斯 |
4 | Dothistroma septosporum | KR995125.1 | P. sylvestris | 立陶宛共和国 |
5 | Dothistroma septosporum | MK622273.1 | Pinus mugo | 白俄罗斯 |
6 | Dothistroma septosporum | MT256135.1 | P. sylvestris | 白俄罗斯 |
7 | Sydowia polyspora | FR717223.1 | Picea abies | 捷克 |
8 | Sydowia polyspora | GQ412722.1 | Abies nordmanniana | 丹麦 |
9 | Sydowia polyspora | GQ412728.1 | Abies nordmanniana | 斯洛伐克 |
10 | Sydowia polyspora | GQ412724.1 | Abies nordmanniana | 德国 |
11 | Sphaeropsis sapinea | AY244403.1 | Pinus patula | 埃塞俄比亚 |
12 | Sphaeropsis sapinea | DQ458863.1 | Pinus nigra | 荷兰 |
13 | Sphaeropsis sapinea | AY244402.1 | Pinus patula | 埃塞俄比亚 |
14 | Diplodia italica | MT592504.1 | Pinus pinea | 法国 |
15 | Dothistroma pini | MW720600.1 | Pinus nigra | 加拿大 |
16 | Dothistroma pini | MH864735.1 | — | 俄罗斯 |
17 | Sydowia polyspora | KU516591.1 | Abies alba | 波兰 |
序号 | 种名 | 登录号 | 寄主植物 | 备注 |
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1 | Dothistroma septosporum | MT256139.1 | P. sylvestris | 白俄罗斯 |
2 | Dothistroma septosporum | MT256138.1 | P. sylvestris | 白俄罗斯 |
3 | Dothistroma septosporum | MT256137.1 | P. sylvestris | 白俄罗斯 |
4 | Dothistroma septosporum | KR995125.1 | P. sylvestris | 立陶宛共和国 |
5 | Dothistroma septosporum | MK622273.1 | Pinus mugo | 白俄罗斯 |
6 | Dothistroma septosporum | MT256135.1 | P. sylvestris | 白俄罗斯 |
7 | Sydowia polyspora | FR717223.1 | Picea abies | 捷克 |
8 | Sydowia polyspora | GQ412722.1 | Abies nordmanniana | 丹麦 |
9 | Sydowia polyspora | GQ412728.1 | Abies nordmanniana | 斯洛伐克 |
10 | Sydowia polyspora | GQ412724.1 | Abies nordmanniana | 德国 |
11 | Sphaeropsis sapinea | AY244403.1 | Pinus patula | 埃塞俄比亚 |
12 | Sphaeropsis sapinea | DQ458863.1 | Pinus nigra | 荷兰 |
13 | Sphaeropsis sapinea | AY244402.1 | Pinus patula | 埃塞俄比亚 |
14 | Diplodia italica | MT592504.1 | Pinus pinea | 法国 |
15 | Dothistroma pini | MW720600.1 | Pinus nigra | 加拿大 |
16 | Dothistroma pini | MH864735.1 | — | 俄罗斯 |
17 | Sydowia polyspora | KU516591.1 | Abies alba | 波兰 |
样品 | Chao1指数 | Coverage指数 | Observed_species指数 | Pielou_e指数 | Shannon指数 | Simpson指数 |
---|---|---|---|---|---|---|
W3-1 | 104 | 0.999996 | 104 | 0.491390 | 3.29253 | 0.801241 |
W3-2 | 214.382 | 0.999888 | 212.1 | 0.408085 | 3.15392 | 0.730805 |
W3-3 | 76.018 | 0.999956 | 75.3 | 0.106146 | 0.66176 | 0.178211 |
T78-1 | 187.205 | 0.999966 | 186.7 | 0.453478 | 3.42130 | 0.783830 |
T78-2 | 125.419 | 0.999968 | 124.8 | 0.265315 | 1.84751 | 0.531299 |
T78-3 | 101.081 | 0.999895 | 98.4 | 0.137231 | 0.90853 | 0.213016 |
T87-1 | 110.167 | 0.999985 | 110 | 0.508909 | 3.45110 | 0.750695 |
T87-2 | 137.976 | 0.999959 | 136.9 | 0.425954 | 3.02298 | 0.770563 |
T87-3 | 228.680 | 0.999842 | 224.1 | 0.424614 | 3.15370 | 0.776497 |
样品 | Chao1指数 | Coverage指数 | Observed_species指数 | Pielou_e指数 | Shannon指数 | Simpson指数 |
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W3-1 | 104 | 0.999996 | 104 | 0.491390 | 3.29253 | 0.801241 |
W3-2 | 214.382 | 0.999888 | 212.1 | 0.408085 | 3.15392 | 0.730805 |
W3-3 | 76.018 | 0.999956 | 75.3 | 0.106146 | 0.66176 | 0.178211 |
T78-1 | 187.205 | 0.999966 | 186.7 | 0.453478 | 3.42130 | 0.783830 |
T78-2 | 125.419 | 0.999968 | 124.8 | 0.265315 | 1.84751 | 0.531299 |
T78-3 | 101.081 | 0.999895 | 98.4 | 0.137231 | 0.90853 | 0.213016 |
T87-1 | 110.167 | 0.999985 | 110 | 0.508909 | 3.45110 | 0.750695 |
T87-2 | 137.976 | 0.999959 | 136.9 | 0.425954 | 3.02298 | 0.770563 |
T87-3 | 228.680 | 0.999842 | 224.1 | 0.424614 | 3.15370 | 0.776497 |
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