中国农学通报 ›› 2023, Vol. 39 ›› Issue (30): 54-60.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.casb2022-0862
蔡一鸣1(), 蒋双丰1, 毛光志2, 李梦笛2, 刁海龙2, 吴鹏飞2, 李俊玲1
收稿日期:
2022-10-23
修回日期:
2023-01-15
出版日期:
2023-10-19
发布日期:
2023-10-19
作者简介:
蔡一鸣,女,1988年出生,河南信阳人,助理研究员,硕士,主要从事茶树种质资源、育种等方面研究。通信地址:464000 河南省信阳市浉河区民权南街20号 信阳市农业科学院,Tel:18837631303,E-mail:775196361@qq.com。
基金资助:
CAI Yiming1(), JIANG Shuangfeng1, MAO Guangzhi2, LI Mengdi2, DIAO Hailong2, WU Pengfei2, LI Junling1
Received:
2022-10-23
Revised:
2023-01-15
Published-:
2023-10-19
Online:
2023-10-19
摘要:
为了对豫南茶树种质资源进行初步鉴定和评价,以豫南茶树种质资源圃内41份无性系品种为材料,利用SSR分子标记技术进行遗传多样性及亲缘关系分析。结果表明:从33对引物中筛选出26对扩增较好的引物,26对引物共扩增出102条谱带,平均每对引物扩增条带4条,最少为2条,最多为7条,检测的平均观测等位基因数2个,平均有效等位基因数1.8664个,平均Nei’s遗传多样性0.4626,平均Shannon信息指数0.6550,引物多态信息量最大值0.80,最小值0.23,平均值0.62。聚类分析结果显示,在相似系数为0.5处,将41份材料分为4大类群,地理来源和遗传背景相近的大都聚在一起,供试品种的遗传距离为0.08~1.87,说明资源圃内品种间遗传基础较宽。
蔡一鸣, 蒋双丰, 毛光志, 李梦笛, 刁海龙, 吴鹏飞, 李俊玲. 基于SSR分子标记的41份茶树种质资源遗传多样性及亲缘关系分析[J]. 中国农学通报, 2023, 39(30): 54-60.
CAI Yiming, JIANG Shuangfeng, MAO Guangzhi, LI Mengdi, DIAO Hailong, WU Pengfei, LI Junling. 41 Tea Germplasm Resources: Genetic Diversity and Relationship Analysis Based on SSR Molecular Markers[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2023, 39(30): 54-60.
编号 | 品种名称 | 来源 | 编号 | 品种名称 | 来源 | 编号 | 品种名称 | 来源 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 白毫早 | 湖南 | 15 | 白叶一号 | 浙江 | 29 | 春雨2号 | 浙江 |
2 | 苏玉黄 | 江苏 | 16 | 豫研06 | 河南 | 30 | 槠叶齐 | 湖南 |
3 | 岚里香 | 安徽 | 17 | 狗牯脑 | 江西 | 31 | 薮北种 | 日本 |
4 | 鄂茶11 | 湖北 | 18 | 鄂茶12 | 湖北 | 32 | 苏茶120 | 江苏 |
5 | 茶农98 | 安徽 | 19 | TRI-19 | 浙江 | 33 | 平阳特早 | 浙江 |
6 | 玉露一号 | 湖北 | 20 | 崂山3号 | 山东 | 34 | 奥绿 | 日本 |
7 | 黟选一号 | 安徽 | 21 | 越香早 | 浙江 | 35 | 鸠20 | 浙江 |
8 | 鸟王106 | 贵州 | 22 | 舒茶早 | 安徽 | 36 | 金镶玉 | 湖南 |
9 | 乌牛早 | 浙江 | 23 | 漕溪1号 | 安徽 | 37 | 中茶108 | 浙江 |
10 | 陕茶1号 | 陕西 | 24 | 黄金芽 | 浙江 | 38 | 金萱 | 台湾 |
11 | 中黄1号 | 浙江 | 25 | 紫鹃 | 云南 | 39 | 碧香早 | 湖南 |
12 | 福鼎大白茶 | 福建 | 26 | 木荷201 | 浙江 | 40 | 龙井长叶 | 浙江 |
13 | 信阳10号 | 河南 | 27 | 中黄2号 | 浙江 | 41 | 鄂黄 | 湖北 |
14 | 御金香 | 浙江 | 28 | 香山早 | 浙江 |
编号 | 品种名称 | 来源 | 编号 | 品种名称 | 来源 | 编号 | 品种名称 | 来源 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 白毫早 | 湖南 | 15 | 白叶一号 | 浙江 | 29 | 春雨2号 | 浙江 |
2 | 苏玉黄 | 江苏 | 16 | 豫研06 | 河南 | 30 | 槠叶齐 | 湖南 |
3 | 岚里香 | 安徽 | 17 | 狗牯脑 | 江西 | 31 | 薮北种 | 日本 |
4 | 鄂茶11 | 湖北 | 18 | 鄂茶12 | 湖北 | 32 | 苏茶120 | 江苏 |
5 | 茶农98 | 安徽 | 19 | TRI-19 | 浙江 | 33 | 平阳特早 | 浙江 |
6 | 玉露一号 | 湖北 | 20 | 崂山3号 | 山东 | 34 | 奥绿 | 日本 |
7 | 黟选一号 | 安徽 | 21 | 越香早 | 浙江 | 35 | 鸠20 | 浙江 |
8 | 鸟王106 | 贵州 | 22 | 舒茶早 | 安徽 | 36 | 金镶玉 | 湖南 |
9 | 乌牛早 | 浙江 | 23 | 漕溪1号 | 安徽 | 37 | 中茶108 | 浙江 |
10 | 陕茶1号 | 陕西 | 24 | 黄金芽 | 浙江 | 38 | 金萱 | 台湾 |
11 | 中黄1号 | 浙江 | 25 | 紫鹃 | 云南 | 39 | 碧香早 | 湖南 |
12 | 福鼎大白茶 | 福建 | 26 | 木荷201 | 浙江 | 40 | 龙井长叶 | 浙江 |
13 | 信阳10号 | 河南 | 27 | 中黄2号 | 浙江 | 41 | 鄂黄 | 湖北 |
14 | 御金香 | 浙江 | 28 | 香山早 | 浙江 |
引物 | 序列信息(5'→ 3') |
---|---|
14 | F: GTCAAGAAAGCTCAAGGC,R: AAGACCCATACAAAAGATACT |
79 | F: TTGCCATTTCCTTCCTG,R: AAAACAAGCCACCTCTA |
108 | F: ATCCACCGTATGATGCT,R: TGTCTTGTGACCAAATTGAC |
228 | F:GAATCAGTGAATAAAGCGTGTA,R: TGAAGTGGCGGCGGAAGA |
234 | F: CTCCGATTACTTTCTTCC,R: GCAGGTTAGCGGTGGTTA |
288 | F: CATAGTAGAGAAGACCACCA,R: GTCAAGTCAAAAACGCCG |
395 | F:TTCAGGCACCTCACAA,R: AAGTAACCCGAAACAT |
463 | F: CACTAAGAGCCAAGGTCG,R: CACATTGATTGAAAGGGAT |
478 | F: CAACACCACCAACAAGA,R: GATATGAGATCCGTCCC |
496 | F: GAAAGTGCGAAACCAAAC,R: CTGCGAACCCTCTTGACC |
588 | F: TGACAGCAGAACACACAT,R: ACTGAACCCAACACCACA |
630 | F: ATGAGAAGGAGGACGATG,R: CATTTATGGACCTGTTCG |
641 | F: CAAGCAATACATACACACA,R: AACAGAGCATACCCAGAAG |
663 | F: CTCTTGATTGGTGCCTTTA,R: TTGGTAGCCTCTTCTTTTG |
685 | F: TAGGGTTTTAGTTTCAG,R: AACATCCTTGCCTCGTC |
687 | F: GAGGCGTTTTCAAGGTT,R: GTAGGTGTGTCGTCCAG |
699 | F: GAAGAAAAGGGAGGAG,R: GAAGATGCGATGACAA |
710 | F:AGACTAAGAGAACAACTGGT,R:GAGCAACATAAGATGAAACA |
788 | F: TCTCTCGCTTTGTCTCC,R: AAAAATAGGGTTGTCAC |
802 | F: GCAGAAAACCCTGTCAAT,R: ATCACCACCCCACCATAC |
1036 | F: TCCCTTTTACTGATTGTGAT,R: CGTGCAAATAATGTGCTGAA |
1110 | F: CATTGCCTTGATGCTGA,R: GATGACGATGGAGTGGG |
A5 | F: ATGCTATTCCTCCGTCTC,R: TTCAGGGATTGGTTTCTC |
A63 | F: CGATACCCTTCGCTCACC,R: AGCCCATTCCCTTTGTCC |
A74 | F:TTTCAATATATACAATTGTTCTCTC,R:TTACTCCTACTGGGCTTT |
C5 | F: ATCAAACCCTAACCCTTCC,R: GTGTTGGTGGCTTACCTT |
G3 | F: TCCAAGCCTCAAGACCAA,R:CAAGGACGAATAAGCAAAA |
G23 | F: AAACCCTTCACTTCCTTC,R: AGCCATTCCCATACACTT |
G74 | F:CTCTGATTCTAGACCATTCGAAGAC,R:TATCCCTACCTCAACTATCA |
P03 | F:GCGTCGTCCCTTCTTTCTAA,R:GGGCAGCCATAACCACTACT |
P01 | F:GGAGCATTGAAGCGAGAAAT,R:ACGCTTCGAGTACTCCCTGA |
Q6 | F: CATTACCTCCAATCTCCG,R: CACGCTCATCTCCTCTTT |
SSR1 | F: TTAAGCAAAGAAGTCGCG,R: CTAAAATCTCCACTCAGCT |
引物 | 序列信息(5'→ 3') |
---|---|
14 | F: GTCAAGAAAGCTCAAGGC,R: AAGACCCATACAAAAGATACT |
79 | F: TTGCCATTTCCTTCCTG,R: AAAACAAGCCACCTCTA |
108 | F: ATCCACCGTATGATGCT,R: TGTCTTGTGACCAAATTGAC |
228 | F:GAATCAGTGAATAAAGCGTGTA,R: TGAAGTGGCGGCGGAAGA |
234 | F: CTCCGATTACTTTCTTCC,R: GCAGGTTAGCGGTGGTTA |
288 | F: CATAGTAGAGAAGACCACCA,R: GTCAAGTCAAAAACGCCG |
395 | F:TTCAGGCACCTCACAA,R: AAGTAACCCGAAACAT |
463 | F: CACTAAGAGCCAAGGTCG,R: CACATTGATTGAAAGGGAT |
478 | F: CAACACCACCAACAAGA,R: GATATGAGATCCGTCCC |
496 | F: GAAAGTGCGAAACCAAAC,R: CTGCGAACCCTCTTGACC |
588 | F: TGACAGCAGAACACACAT,R: ACTGAACCCAACACCACA |
630 | F: ATGAGAAGGAGGACGATG,R: CATTTATGGACCTGTTCG |
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710 | F:AGACTAAGAGAACAACTGGT,R:GAGCAACATAAGATGAAACA |
788 | F: TCTCTCGCTTTGTCTCC,R: AAAAATAGGGTTGTCAC |
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1110 | F: CATTGCCTTGATGCTGA,R: GATGACGATGGAGTGGG |
A5 | F: ATGCTATTCCTCCGTCTC,R: TTCAGGGATTGGTTTCTC |
A63 | F: CGATACCCTTCGCTCACC,R: AGCCCATTCCCTTTGTCC |
A74 | F:TTTCAATATATACAATTGTTCTCTC,R:TTACTCCTACTGGGCTTT |
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SSR1 | F: TTAAGCAAAGAAGTCGCG,R: CTAAAATCTCCACTCAGCT |
位点 | 等位基因数 | 有效等位基因数 | Nei氏遗传多样性 | Shannon信息指数 | 多态性信息含量 | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
14 | 2.0000 | 1.8657 | 0.4640 | 0.6567 | 0.60 | |||
108 | 2.0000 | 1.9081 | 0.4759 | 0.6689 | 0.53 | |||
228 | 2.0000 | 1.9081 | 0.4759 | 0.6689 | 0.72 | |||
234 | 2.0000 | 1.9081 | 0.4759 | 0.6689 | 0.77 | |||
395 | 2.0000 | 1.9434 | 0.4854 | 0.6785 | 0.48 | |||
463 | 2.0000 | 1.9707 | 0.4926 | 0.6857 | 0.70 | |||
478 | 2.0000 | 1.9434 | 0.4854 | 0.6785 | 0.78 | |||
588 | 2.0000 | 1.9707 | 0.4926 | 0.6857 | 0.67 | |||
630 | 2.0000 | 1.7639 | 0.4331 | 0.6246 | 0.76 | |||
641 | 2.0000 | 1.9081 | 0.4759 | 0.6689 | 0.71 | |||
663 | 2.0000 | 1.8173 | 0.4497 | 0.6420 | 0.78 | |||
685 | 2.0000 | 1.9434 | 0.4854 | 0.6785 | 0.57 | |||
687 | 2.0000 | 1.7066 | 0.4140 | 0.6045 | 0.23 | |||
699 | 2.0000 | 1.9893 | 0.4973 | 0.6905 | 0.59 | |||
788 | 2.0000 | 1.9707 | 0.4926 | 0.6857 | 0.45 | |||
802 | 2.0000 | 1.7639 | 0.4331 | 0.6246 | 0.50 | |||
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1110 | 2.0000 | 1.8173 | 0.4497 | 0.6420 | 0.50 | |||
A5 | 2.0000 | 1.7639 | 0.4331 | 0.6246 | 0.69 | |||
A74 | 2.0000 | 1.6464 | 0.3926 | 0.5816 | 0.57 | |||
G23 | 2.0000 | 1.8173 | 0.4497 | 0.6420 | 0.70 | |||
G74 | 2.0000 | 1.9434 | 0.4854 | 0.6785 | 0.68 | |||
P03 | 2.0000 | 1.8657 | 0.4640 | 0.6567 | 0.56 | |||
P01 | 2.0000 | 1.9081 | 0.4759 | 0.6689 | 0.49 | |||
SSR1 | 2.0000 | 1.8657 | 0.4640 | 0.6567 | 0.68 | |||
Mean | 2.0000 | 1.8664 | 0.4626 | 0.6550 | 0.62 |
位点 | 等位基因数 | 有效等位基因数 | Nei氏遗传多样性 | Shannon信息指数 | 多态性信息含量 | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
14 | 2.0000 | 1.8657 | 0.4640 | 0.6567 | 0.60 | |||
108 | 2.0000 | 1.9081 | 0.4759 | 0.6689 | 0.53 | |||
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234 | 2.0000 | 1.9081 | 0.4759 | 0.6689 | 0.77 | |||
395 | 2.0000 | 1.9434 | 0.4854 | 0.6785 | 0.48 | |||
463 | 2.0000 | 1.9707 | 0.4926 | 0.6857 | 0.70 | |||
478 | 2.0000 | 1.9434 | 0.4854 | 0.6785 | 0.78 | |||
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687 | 2.0000 | 1.7066 | 0.4140 | 0.6045 | 0.23 | |||
699 | 2.0000 | 1.9893 | 0.4973 | 0.6905 | 0.59 | |||
788 | 2.0000 | 1.9707 | 0.4926 | 0.6857 | 0.45 | |||
802 | 2.0000 | 1.7639 | 0.4331 | 0.6246 | 0.50 | |||
1036 | 2.0000 | 1.9707 | 0.4926 | 0.6857 | 0.66 | |||
1110 | 2.0000 | 1.8173 | 0.4497 | 0.6420 | 0.50 | |||
A5 | 2.0000 | 1.7639 | 0.4331 | 0.6246 | 0.69 | |||
A74 | 2.0000 | 1.6464 | 0.3926 | 0.5816 | 0.57 | |||
G23 | 2.0000 | 1.8173 | 0.4497 | 0.6420 | 0.70 | |||
G74 | 2.0000 | 1.9434 | 0.4854 | 0.6785 | 0.68 | |||
P03 | 2.0000 | 1.8657 | 0.4640 | 0.6567 | 0.56 | |||
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SSR1 | 2.0000 | 1.8657 | 0.4640 | 0.6567 | 0.68 | |||
Mean | 2.0000 | 1.8664 | 0.4626 | 0.6550 | 0.62 |
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