叶籽银杏trnS-trnG序列测定与分析

中国农学通报 ›› 2008, Vol. 24 ›› Issue (12): 168-172.

叶籽银杏trnS-trnG序列测定与分析

董雷雷,邢世岩,李际红,王京梅

收稿日期:2008-09-08 修回日期:2008-10-14 出版日期:2008-12-05 发布日期:2008-12-05

Sequencing and analysis of trnS-trnG on Ginkgo biloba var. epiphylla Mak

Dong Leilei, Xing Shiyan, Li Jihong, Wang Jingmei

Received:2008-09-08 Revised:2008-10-14 Online:2008-12-05 Published:2008-12-05

摘要/Abstract

摘要： 利用叶绿体基因trnS-trnG基因间隔区的通用引物，扩增并分析了不同地区的14株叶籽银杏和2株银杏的trnS-trnG基因间隔区序列，结果表明，14株叶籽银杏和2株银杏的trnS-trnG序列长度均为1005bp，A+T的含量为62.19%—62.39%。各样品之间变异小，14株叶籽银杏和2株银杏共有23个可变位点，1个信息位点，这些变异都以碱基的置换发生。除这些变异位点外的核苷酸序列完全相同，说明各样品序列之间具有高度同源性。YZ1变异位点较多，与其它样品的同源性较低。所测序列Blast检验后发现叶籽银杏trnS-trnG序列与银杏的相似度最高，苏铁类次之。用DNASTAR软件对14株叶籽银杏和2株银杏的trnS-trnG基因间隔区序列进行同源性和差异性分析，建立了系统进化树。

关键词: 烤烟, 烤烟, 淀粉, 糖, 含量, 因素

Abstract: The cpDNA trnS-trnG intergenic spacer sequence of 14Ginkgo biloba var. epiphylla trees and 2 Ginkgo biloba trees were amplified and analyzed successfully.The results indicated that the size of trnS-trnG sequences was 1005bp and the content of A+T was 62.19%—62.39%.There were 23 variable sizes and one information size in this 14 Ginkgo biloba var. epiphylla trees and 2 Ginkgo biloba trees.There were little difference among the trnS-trnG sequences.YZ1 had more variable sizes and lower different areas with other samples.All the sequences through Blast found that it had a highly similar with Ginkgo biloba and cycas another.DNASTAR software was used to analysis indentity and diver gence and construct phylogenetic tree based on all the trnS-trnG sequences of 14Ginkgo biloba var. epiphylla trees and 2 Ginkgo biloba trees.

董雷雷,邢世岩,李际红,王京梅. 叶籽银杏trnS-trnG序列测定与分析[J]. 中国农学通报, 2008, 24(12): 168-172.

Dong Leilei, Xing Shiyan, Li Jihong, Wang Jingmei. Sequencing and analysis of trnS-trnG on Ginkgo biloba var. epiphylla Mak[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2008, 24(12): 168-172.

[1]	王芳, 乔帅, 杨松涛, 宋伟, 廖安忠, 谭文芳. 淀粉型甘薯‘川薯231’的选育和优势特性鉴定[J]. 中国农学通报, 2023, 39(1): 16-21.
[2]	高文瑞, 孙艳军, 韩冰, 费聪, 王显生, 徐刚. 弱光对西瓜果实品质及蔗糖代谢的影响[J]. 中国农学通报, 2023, 39(1): 56-61.
[3]	马元花, 印彩霞, 王红玉, 刘宇轩, 刘前通, 张泽. 基于高光谱的棉花叶片磷含量估测模型[J]. 中国农学通报, 2023, 39(1): 123-132.
[4]	武迪, 张锋, 隋春莹, 师君慧, 万雪洁, 刘义国, 韩伟, 师长海. 外源活性物质对小麦苗期抗逆性的影响[J]. 中国农学通报, 2022, 38(9): 14-19.
[5]	陈英花, 白如霄, 王娟, 张新疆, 刘玲慧, 刘小龙, 冯国瑞, 危常州. 叶面喷施烯效唑和硼对塔额盆地甜菜产量和含糖率的影响[J]. 中国农学通报, 2022, 38(9): 41-48.
[6]	周小红. 基于多元回归分析的农作物产量估测模型研究[J]. 中国农学通报, 2022, 38(8): 152-156.
[7]	黄浩, 谢晋, 袁文彬, 王初亮, 陈坤华, 曾繁东, 梁增发, 苏诏, 王维. 不同有机物料对烤烟根系特征及氮磷钾积累量的影响[J]. 中国农学通报, 2022, 38(8): 51-57.
[8]	李星星, 韩芳, 周雪, 苏乐平, 袁宏安. 富硒谷子研究进展[J]. 中国农学通报, 2022, 38(7): 1-6.
[9]	濮永瑜, 包玲凤, 何翔, 刘芮, 张庆, 施竹凤, 何永宏, 杨佩文. 烟草青枯病和黑胫病拮抗细菌的筛选、鉴定及防效研究[J]. 中国农学通报, 2022, 38(7): 116-123.
[10]	姚金保, 杨学明, 周淼平, 张鹏. 江苏省小麦参试品种（系）产量与产量构成因素分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(6): 15-19.
[11]	周忠文, 张谋草, 刘英, 柳东慧, 张红妮, 张俊林, 韩博. 气象要素对陇东塬区春玉米灌浆速度影响分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(5): 94-98.
[12]	韩敏, 杨鹏武, 何雨芩, 胡雪琼, 朱勇. 阴雨寡照灾害对云南烤烟的种植风险预测[J]. 中国农学通报, 2022, 38(4): 69-75.
[13]	关罗浩, 杨欣, 李超, 张艳玲, 张广富, 李永亮, 周汉平, 王广山, 钟帅, 戴华鑫. 留叶数对腾冲烟叶产质量的影响[J]. 中国农学通报, 2022, 38(4): 10-15.
[14]	黄磊, 李艺萌, 钟帅, 金保锋, 高晋军, 王晓园, 关罗浩, 王初亮, 黄妧婷, 李敏. 低氧贮存片烟解封后理化指标和质量变化研究[J]. 中国农学通报, 2022, 38(4): 107-112.
[15]	李乐, 张晓虎, 杨澜. 黄芩茎叶没食子酸-KGM复合保鲜膜在鸡蛋保鲜中的应用研究[J]. 中国农学通报, 2022, 38(35): 125-133.