短芒披碱草SRAP-PCR 体系的建立和优化

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.2014-1190

中国农学通报 ›› 2014, Vol. 30 ›› Issue (30): 259-264.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.2014-1190

短芒披碱草SRAP-PCR 体系的建立和优化

顾晓燕,马啸

四川农业大学,四川农业大学

收稿日期:2014-04-23 修回日期:2014-04-23 接受日期:2014-08-06 出版日期:2014-10-31 发布日期:2014-10-31
通讯作者: 马啸
基金资助:
国家科技支撑计划“南方优质饲草高效生产加工利用关键技术研究与集成示范”（2011BAD17B03）；四川省科技支撑计划“川西北短芒披碱草分子生态学及抗旱生理研究”(2011SZ0162)

Establishment and Optimization of SRAP-PCR Reaction System for Elymus breviaristatus

Received:2014-04-23 Revised:2014-04-23 Accepted:2014-08-06 Online:2014-10-31 Published:2014-10-31

摘要/Abstract

摘要： 通过单因子和正交设计两种试验方法，对短芒披碱草SRAP-PCR体系进行优化，得到短芒披碱草20 μL SRAP-PCR 最优反应体系为：Mg²⁺ 2.00 mmol/L、引物0.40 μmol/L、Taq DNA聚合酶1.0 U、dNTPs 250 μmol/L、DNA 30 ng 和10×buffer 2 μL；各因素水平变化对PCR 反应影响从大到小依次是：Mg²⁺、引物、Taq 酶、dNTPs 和模板DNA。运用该优化体系对6 份短芒披碱草材料进行验证，电泳结果显示扩增条带多态性高，清晰无杂带。该优化体系的建立有助于将SRAP标记技术用于短芒披碱草的遗传育种等研究。

关键词: 相关性, 相关性

Abstract: The SRAP- PCR for Elymus breviaristatus was optimized using the single factor test and the orthogonal design test in the study. The optimized SRAP- PCR system for E. breviaristatus was: 2.00 mmol/L MgCl₂, 0.40μmol/L primers, 1.0 U Taq DNA polymerase, 250μmol/L dNTPs, 30 ng DNA template, 2μL 10×PCR buffer in the total volume of 20μL. The results showed that the order for the most influenced factor to the least influenced factor was: Mg²⁺ , primer, Taq polymerase, dNTPs and DNA template. The optimized PCR system was confirmed using six E. breviaristatus accessions. The electrophoresis results showed that the amplified bands were highly polymorphic and clear, further indicating that the optimized system was reliable. The optimized SRAP- PCR system could be used for genetics and breeding studies in E. breviaristatus or other Elymus species.

顾晓燕,马啸. 短芒披碱草SRAP-PCR 体系的建立和优化[J]. 中国农学通报, 2014, 30(30): 259-264.

参考文献

[1] 周永红,郑有良,杨俊良,等.10种披碱草属植物的 RAPD分析及其系统学意义[J].植物分类学报,1999,37(5):425-432.
[2] 郭本兆.中国植物志[M].北京:科学出版社,1987,9(3):7-104.
[3] 曾植虎.短芒披碱草与老芒麦、垂穗披碱草的对比试验[J].青海草业,2012,21(1):20-23.
[4] 张桥英,何兴金.四川省珍稀濒危植物及其保护[J].武汉植物学研究,2002,20(5):387-394.
[5] Ma X., Zhang X Q, Zhou Y H, et al. Assessing genetic diversity of Elymus sibiricus (Poaceae: Triticeae) populations from QinghaiTibet Plateau by ISSR markers[J]. Biochemical Systematics and Ecology, 2008, 365: 514-522.
[6] Gaudett M., Salomon B., and Sun G. Molecular variation and population structure in Elymus trachycaulus and comparison with its morphologically similar E. alaskanus[J]. Plant Systematics and Evolution, 2005, 250: 81-91.
[7] Stevens Laci, Salomon Bj?rn, Sun Genlou. Microsatellite variability and heterozygote excess in Elymus trachycaulus populations from British Columbia in Canada[J]. Biochemical Systematics and Ecology, 2007, 35: 725-736.
[8] Mizianty M., Bieniek W., Czech A., et al. Variability and structure of natural populations of Elymus caninus (L.) L. and their possible relationship with Hordelymus europaeus (L.) Jess. ex Harz as revealed by AFLP analysis[J]. Plant Systematics and Evolution, 2005, 256: 193-200.
[9] Li G, Quiros C. F. Sequence- related amplified polymorphism (SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction: Its application to mapping and gene tagging in Brassica[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2001, 103(3): 455-461.
[10] Budak H., Shearman R.C., Parmaksiz I., et al. Molecular characterization of Buffalograss germplasm using sequence related amplified polymorphism markers[J]. Theor. Appl. Genet, 2004, 108: 328-334.
[11] 陈智华,苗佳敏,钟金城,等.野生垂穗披碱草种质遗传多样性的SRAP研究[J].草业学报,2009,18(5):192-200.
[12] 苗佳敏,张新全,陈智华,等.青藏高原和新疆地区垂穗披碱草种质的 SRAP及 RAPD分析[J].草地学报,2011,19(2):127-134.
[13] 鄢家俊,白史且,张新全,等.青藏高原老芒麦种质基于 SRAP标记的遗传多样性研究[J].草业学报,2010,19(1):173-183.
[14] Dong P., Wei Y. M., Chen G. Y., Li W., Wang J. R., Eviatar Nevo, Zheng Y. L. Sequence-related amplified polymorphism (SRAP) of wild emmer wheat (Triticum dicoccoides) in Israel and its ecological association[J]. Biochemical Systematics and Ecology, 2010, 38: 1-11.
[15] 许绍斌,陶玉,杨昭庆,等.简单快速的 DNA银染和胶保存方法[J].遗传,2002,24(3):335-336.
[16] 薛丹丹,郑轶琦,王志勇,等.结缕草属植物 SRAP-PCR体系的建立和优化[J].草业学报,2008,17(6):93-101.
[17] 郑轶琦,王志勇,郭海林,等.正交设计优化假俭草 SRAP-PCR反应体系及引物筛选[J].草业学报,2008,17(4):110-117.
[18] 王志勇,袁学军,刘建秀,等.狗牙根 SRAP-PCR反应体系优化及引物筛选[J].草业学报,2008,17(3):79-85.
[19] 何正文,刘运生,陈立华,等.正交设计直观分析法优化 PCR 条件[J].湖南医科大学学报,1998,23(4):403-404

短芒披碱草SRAP-PCR 体系的建立和优化

Establishment and Optimization of SRAP-PCR Reaction System for Elymus breviaristatus

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

关于本刊

作者中心

审者中心

在线期刊

联系我们

[1]	卢倩倩, 冯琳骄, 王爽, 古力扎提·包尔汗, 褚韧, 周龙. 复合盐碱胁迫对鲜食葡萄生理生化指标的影响[J]. 中国农学通报, 2023, 39(1): 62-70.
[2]	次旺顿珠, 杜军, 次旺, 平措桑旦. 1981—2020年西藏“一江两河”主要农区负积温的时空变化特征[J]. 中国农学通报, 2022, 38(5): 99-105.
[3]	郭玉林, 张立果, 郑重, 王春伟, 徐全忠, 武云喜, 李光鹏, 苏小虎, 张立. 戴瑞奶绵羊血清中生殖激素含量与超排效果相关性研究[J]. 中国农学通报, 2022, 38(35): 90-96.
[4]	赵丽娟, 只佳增, 张建春, 杜浩, 周劲松, 刘学敏, 张荣琴. 香蕉种质资源叶片表型性状多样性分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(30): 56-64.
[5]	李涌泉, 金赟, 李佳月, 孙学良, 陈树俊. 晋北谷子农艺和营养品质性状的相关性分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(29): 22-30.
[6]	罗静静, 王贺亚, 柳延涛. 不同食葵品种间农艺性状及产量的比较研究[J]. 中国农学通报, 2022, 38(28): 7-12.
[7]	白苇, 胡杨, 李峰, 张宝英, 崔金丽, 杨素梅. 食葵氮磷钾肥对产量相关性状的影响及经济效益分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(26): 62-68.
[8]	宋钊, 梁栌丹, 黄文茵, 陈潇, 曹健, 何裕志, 张白鸽. 涝渍胁迫下辣椒叶绿素含量与SPAD值相关性模型建立及应用[J]. 中国农学通报, 2022, 38(25): 30-37.
[9]	王志强, 杜慧莹, 李程, 郭松, 田梅, 杨万邦, 于蓉. 西瓜数量性状遗传距离及杂种优势分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(25): 47-51.
[10]	史芮林, 张庆芬, 李铭, 李全起, 张明明. 植物碳同位素分馏在水分利用效率研究中的应用[J]. 中国农学通报, 2022, 38(23): 15-20.
[11]	张含, 龚敏, 石汝杰. 重庆市蔬菜地土壤硒含量及其影响因素分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(19): 114-119.
[12]	戴前莉, 朱恒星, 黄飞逸, 卢敏, 陈本文, 陈琴, 管运峰, 尹思琴, 祝元春. 油橄榄叶果营养元素动态及其相关性[J]. 中国农学通报, 2022, 38(18): 153-158.
[13]	王德美, 刘桂华, 范成五, 柴冠群, 罗沐欣键, 秦松. 黔产红托竹荪基地土壤-红托竹荪体系矿质元素含量及相关性分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(14): 72-76.
[14]	何雪娇, 史国强, 张天翔, 谢南松, 林金水. 温度和光周期对姜荷花生长的影响[J]. 中国农学通报, 2022, 38(10): 53-60.
[15]	郭岩, 何毅, 张立峰, 邱丽莎, 张国强, 张志华. 2000—2017年中亚地区植被变化遥感监测[J]. 中国农学通报, 2021, 37(8): 123-131.