油葵SSR-PCR反应体系的优化及引物筛选

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.2014-2456

中国农学通报 ›› 2015, Vol. 31 ›› Issue (12): 205-209.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.2014-2456

所属专题：油料作物

油葵SSR-PCR反应体系的优化及引物筛选

房冬梅,吕品,侯建华

(内蒙古农业大学农学院,呼和浩特 010019）

收稿日期:2014-09-10 修回日期:2014-09-10 接受日期:2014-11-05 出版日期:2015-05-06 发布日期:2015-05-06
通讯作者: 侯建华
基金资助:
内蒙古自然科学基金重点项目“油用向日葵抗旱性相关性状的QTL分析研究”(2010zd06)；国家自然科学基金项目“向日葵抗（耐）旱相关性状基因QTL定位及分析”(31160288)。

Optimization of SSR-PCR Reaction System and Primer Screening in Oil Sunflower

Fang Dongmei, Lv Pin, Hou Jianhua

(College of Agronomy, Inner Mongolia Agricultural University, Huhhot 010019)

Received:2014-09-10 Revised:2014-09-10 Accepted:2014-11-05 Online:2015-05-06 Published:2015-05-06

摘要/Abstract

摘要： 为了获得适合油葵的SSR-PCR反应体系，通过采用控制变量法对影响SSR反应体系的主要因素进行优化，研究Mg²⁺浓度、dNTPs浓度、Taq酶浓度、引物浓度、退火温度等因素。结果表明各因素的终浓度分别在Mg²⁺浓度2.5 mmol/L、dNTPs浓度0.2 mmol/L、Taq酶量0.5 U、引物浓度0.4 μmol/L及退火温度为53.9℃时最为适合。通过试验优化后的体系筛选引物，最终从50对引物筛得19对多态性好的引物可进行下一步的研究。

关键词: 芝麻, 芝麻, 施肥水平, 品种, 干物质积累与分配

Abstract: In order to obtain the SSR-PCR reaction system for oil sunflower, the method of control variable had been used to optimize the main factors influencing the SSR reaction system, which include the concentration of Mg², dNTPs, Taq enzyme, primer, and annealing temperature. Results showed that the optimized SSR reaction system was Mg² 2.5 mmol/L, dNTPs 0.2 mmol/L, Taq polymerase 0.5 U, primer 0.4 μmol/L and the annealing temperature 53.9℃. Through the testing system after optimization, 19 pairs of polymorphic good primer could be used for the next research from 50 pairs of primers screening.

房冬梅,吕品,侯建华. 油葵SSR-PCR反应体系的优化及引物筛选[J]. 中国农学通报, 2015, 31(12): 205-209.

Fang Dongmei,Lv Pin and Hou Jianhua. Optimization of SSR-PCR Reaction System and Primer Screening in Oil Sunflower[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2015, 31(12): 205-209.

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Optimization of SSR-PCR Reaction System and Primer Screening in Oil Sunflower

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