新疆野扁桃的TP-M13-SSR 荧光标记引物的筛选

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb18070067

中国农学通报 ›› 2019, Vol. 35 ›› Issue (1): 45-49.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.casb18070067

所属专题：园艺

新疆野扁桃的TP-M13-SSR 荧光标记引物的筛选

曾斌, 马鑫鑫, 余镇蕃, 阿布都卡尤木.阿依麦提

新疆农业大学林学与园艺学院/新疆农业大学果树学新疆特色果树研究中心

收稿日期:2018-07-14 修回日期:2018-09-28 接受日期:2018-10-12 出版日期:2019-01-02 发布日期:2019-01-02
通讯作者: 曾斌
基金资助:
国家自然科学基金“基于S-核酸酶的新疆野生扁桃自交不亲和性泛素化特性的分子机制研究”(31660557)；新疆维吾尔自治区园艺学重点学科项目“新疆特色果树种质资源开发利用与优良品种选育推广”(2016-10758-3)。

Wild Almond (Prunus tenella Batsch.) in Xinjiang: Screening of TP-M13-SSR Primers in Capillary Fluorescent Electrophoresis

Received:2018-07-14 Revised:2018-09-28 Accepted:2018-10-12 Online:2019-01-02 Published:2019-01-02

摘要/Abstract

摘要： 为对毛细管荧光电泳检测过程中出现的非特异性峰进行观察，探讨其形态及发生原因，笔者从新疆野扁桃的5 个居群中分别挑选2 份叶片提取基因组DNA，PCR产物使用毛细管电泳荧光检测。结果表明：在毛细管电泳荧光检测中，共选用4 种荧光引物，其中荧光引物FAM峰型最为正常且特异峰清晰，不常发生非特异性峰。与之相反，荧光引物ROX的非特异峰种类数量最多，且特异峰不易辨认。在6 种异常情况中，N+1 峰出现次数最多，高低峰出现次数最少。荧光引物FAM更适合于新疆野扁桃进行扩增。

关键词: 肥料, 肥料, 羊草草原, 地上生物量, 群落特征

Abstract: The paper aims to observe the non-special peak appeared in capillary fluorescent electrophoresis and discuss its shape and the occurrence reason. We selected 2 samples of leaves from 5 populations of wild almond respectively to extract the genome DNA, and analyzed the amplification production by using the capillary fluorescent electrophoresis. The results showed that: there were 4 kinds of fluorescent primers in the capillary fluorescent electrophoresis; the peak of fluorescent primer FAM was within a normal range, with the special peak being obvious and the non-special peak did not occur frequently; by contrast, the non-special peak of fluorescent primer ROX had the most varieties, and the special peak was difficult to discern; in 6 exceptional cases, N+1 peak occurred the most and different peaks occurred the least. The fluorescent primer FAM is more suitable for wild almond to amplify.

曾斌,马鑫鑫,余镇蕃,阿布都卡尤木.阿依麦提. 新疆野扁桃的TP-M13-SSR 荧光标记引物的筛选[J]. 中国农学通报, 2019, 35(1): 45-49.

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新疆野扁桃的TP-M13-SSR 荧光标记引物的筛选

Wild Almond (Prunus tenella Batsch.) in Xinjiang: Screening of TP-M13-SSR Primers in Capillary Fluorescent Electrophoresis

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