中国农学通报 ›› 2020, Vol. 36 ›› Issue (34): 148-159.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.casb20200300216
所属专题: 现代农业发展与乡村振兴
收稿日期:
2020-03-17
修回日期:
2020-10-20
出版日期:
2020-12-05
发布日期:
2020-12-15
通讯作者:
张学福
作者简介:
李楠,女,1983年出生,河北唐山人,副编审,博士研究生,从事文献计量学研究。通信地址:100081 北京市海淀区中关村南大街12号 中国农业科学院图书馆楼4106房间,Tel:010-82109903,E-mail: 基金资助:
Li Nan(), Li Xiaoman, Zhang Xuefu(
)
Received:
2020-03-17
Revised:
2020-10-20
Online:
2020-12-05
Published:
2020-12-15
Contact:
Zhang Xuefu
摘要:
基于农业科技创新的发展需求,为农业科技资源的有效配置提供支撑,从文献计量角度对全球植物科学领域研究现状及态势进行分析。利用定性、定量相结合的方法构建检索策略,基于Web of Science数据库及文献计量分析工具,对文献发表量、文献主要贡献国家、机构、期刊及发文量较高的作者H指数进行统计分析。结果表明,1995—2018年植物科学领域的文章发表量整体上呈现稳定增长趋势,学科呈现蓬勃发展的整体势头。美国和中国是文献主要贡献国家,文献量和总被引频次显著高于其他国家,但美国及欧洲国家的篇均被引数量高于中国。从全球来看,中国科研机构在发文数量占有绝对优势,而德国马克思普朗克的文章篇均被引数量高,达到10以上。对2016—2018年的高被引文献(Top10)进行内容分析,并通过高频词共现主题聚类可视化分析。从论文影响力及主题词规模2个维度表征领域内研究方向。结果表明,“植物应对生物及非生物胁迫”、“基因编辑技术”、“基因组学分析”、“植物生殖发育调控”是近年来植物科学的高关注度研究方向,主题内容与前期的需求调研相符,初步预测这些研究方向将对农业创新发展起到重要推动作用。
中图分类号:
李楠, 李晓曼, 张学福. 全球植物科学领域发展态势分析[J]. 中国农学通报, 2020, 36(34): 148-159.
Li Nan, Li Xiaoman, Zhang Xuefu. Trend and Topic Analysis of Global Plant Science Research[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2020, 36(34): 148-159.
年份 | 入选“中国科学十大进展”成果 | 入选“中国生命科学领域十大进展”成果 |
---|---|---|
2014 | 阐明独脚金内酯调控水稻分蘖和株型的信号途径 | |
2015 | (1)高等植物光系统I光合膜蛋白超分子复合物晶体结构解析; (2)水稻耐寒机制研究 | |
2016 | 水稻(Oryza sativa)产量性状杂种优势的分子遗传机制解析入 | (1)植物受精过程中雌雄配子体信号识别机制的研究; (2)独脚金内酯的受体感知机制 |
2017 | (1)水稻广谱持久抗病与产量平衡的遗传与表观调控机制; (2)水稻新型广谱抗病遗传基础发现与机制解析 | |
2018 | 调控植物生长-代谢平衡实现可持续农业发展 | 中国被子植物区系进化历史研究 |
年份 | 入选“中国科学十大进展”成果 | 入选“中国生命科学领域十大进展”成果 |
---|---|---|
2014 | 阐明独脚金内酯调控水稻分蘖和株型的信号途径 | |
2015 | (1)高等植物光系统I光合膜蛋白超分子复合物晶体结构解析; (2)水稻耐寒机制研究 | |
2016 | 水稻(Oryza sativa)产量性状杂种优势的分子遗传机制解析入 | (1)植物受精过程中雌雄配子体信号识别机制的研究; (2)独脚金内酯的受体感知机制 |
2017 | (1)水稻广谱持久抗病与产量平衡的遗传与表观调控机制; (2)水稻新型广谱抗病遗传基础发现与机制解析 | |
2018 | 调控植物生长-代谢平衡实现可持续农业发展 | 中国被子植物区系进化历史研究 |
国家 | 发文量 | 发文量占比 | 总被引频次 | 篇均被引频次 |
---|---|---|---|---|
中国 | 14846 | 0.31 | 77113 | 5.19 |
美国 | 9494 | 0.20 | 67190 | 7.08 |
印度 | 3472 | 0.07 | 15852 | 4.57 |
德国 | 3229 | 0.07 | 26578 | 8.23 |
日本 | 2223 | 0.05 | 13655 | 6.14 |
法国 | 2221 | 0.05 | 18891 | 8.51 |
澳大利亚 | 2212 | 0.05 | 16521 | 7.47 |
巴西 | 2177 | 0.05 | 6699 | 3.08 |
英国 | 1978 | 0.04 | 18250 | 9.23 |
西班牙 | 1899 | 0.04 | 13499 | 7.11 |
韩国 | 1724 | 0.04 | 8999 | 5.22 |
加拿大 | 1616 | 0.03 | 11068 | 6.85 |
意大利 | 1591 | 0.03 | 10372 | 6.52 |
巴基斯坦 | 1337 | 0.03 | 5553 | 4.15 |
伊朗 | 988 | 0.02 | 3048 | 3.09 |
荷兰 | 920 | 0.02 | 9172 | 9.97 |
波兰 | 863 | 0.02 | 3496 | 4.05 |
墨西哥 | 792 | 0.02 | 3873 | 4.89 |
瑞士 | 753 | 0.02 | 7473 | 9.92 |
比利时 | 716 | 0.02 | 6095 | 8.51 |
国家 | 发文量 | 发文量占比 | 总被引频次 | 篇均被引频次 |
---|---|---|---|---|
中国 | 14846 | 0.31 | 77113 | 5.19 |
美国 | 9494 | 0.20 | 67190 | 7.08 |
印度 | 3472 | 0.07 | 15852 | 4.57 |
德国 | 3229 | 0.07 | 26578 | 8.23 |
日本 | 2223 | 0.05 | 13655 | 6.14 |
法国 | 2221 | 0.05 | 18891 | 8.51 |
澳大利亚 | 2212 | 0.05 | 16521 | 7.47 |
巴西 | 2177 | 0.05 | 6699 | 3.08 |
英国 | 1978 | 0.04 | 18250 | 9.23 |
西班牙 | 1899 | 0.04 | 13499 | 7.11 |
韩国 | 1724 | 0.04 | 8999 | 5.22 |
加拿大 | 1616 | 0.03 | 11068 | 6.85 |
意大利 | 1591 | 0.03 | 10372 | 6.52 |
巴基斯坦 | 1337 | 0.03 | 5553 | 4.15 |
伊朗 | 988 | 0.02 | 3048 | 3.09 |
荷兰 | 920 | 0.02 | 9172 | 9.97 |
波兰 | 863 | 0.02 | 3496 | 4.05 |
墨西哥 | 792 | 0.02 | 3873 | 4.89 |
瑞士 | 753 | 0.02 | 7473 | 9.92 |
比利时 | 716 | 0.02 | 6095 | 8.51 |
机构 | 发文量 | 总被引频次 | 篇均被引频次 | 发文量占比 |
---|---|---|---|---|
中国科学院 | 2295 | 16829 | 7.33 | 0.05 |
中国农业科学院 | 1646 | 9758 | 5.93 | 0.03 |
美国农业部 | 1419 | 8396 | 5.92 | 0.03 |
法国国家农业科学院 | 1257 | 10956 | 8.72 | 0.03 |
美国加州大学系统 | 1194 | 11813 | 9.89 | 0.03 |
南京农业大学 | 1145 | 6569 | 5.74 | 0.02 |
法国国家科学研究中心 | 1086 | 9356 | 8.62 | 0.02 |
印度农业研究委员会 | 976 | 3509 | 3.60 | 0.02 |
中国农业大学 | 866 | 4854 | 5.61 | 0.02 |
西北农林科技大学 | 860 | 4582 | 5.33 | 0.02 |
华中农业大学 | 824 | 6138 | 7.45 | 0.02 |
西班牙科学研究委员会 | 816 | 6554 | 8.03 | 0.02 |
中国科学院大学 | 799 | 5634 | 7.05 | 0.02 |
马克斯普朗克学会 | 638 | 6837 | 10.72 | 0.01 |
浙江大学 | 590 | 3823 | 6.48 | 0.01 |
佛罗里达州立大学 | 539 | 2829 | 5.25 | 0.01 |
瓦赫宁根大学 | 527 | 4893 | 9.28 | 0.01 |
巴基斯坦费萨拉巴德农业大学 | 524 | 2364 | 4.51 | 0.01 |
加州大学戴维思分校 | 516 | 4381 | 8.49 | 0.01 |
机构 | 发文量 | 总被引频次 | 篇均被引频次 | 发文量占比 |
---|---|---|---|---|
中国科学院 | 2295 | 16829 | 7.33 | 0.05 |
中国农业科学院 | 1646 | 9758 | 5.93 | 0.03 |
美国农业部 | 1419 | 8396 | 5.92 | 0.03 |
法国国家农业科学院 | 1257 | 10956 | 8.72 | 0.03 |
美国加州大学系统 | 1194 | 11813 | 9.89 | 0.03 |
南京农业大学 | 1145 | 6569 | 5.74 | 0.02 |
法国国家科学研究中心 | 1086 | 9356 | 8.62 | 0.02 |
印度农业研究委员会 | 976 | 3509 | 3.60 | 0.02 |
中国农业大学 | 866 | 4854 | 5.61 | 0.02 |
西北农林科技大学 | 860 | 4582 | 5.33 | 0.02 |
华中农业大学 | 824 | 6138 | 7.45 | 0.02 |
西班牙科学研究委员会 | 816 | 6554 | 8.03 | 0.02 |
中国科学院大学 | 799 | 5634 | 7.05 | 0.02 |
马克斯普朗克学会 | 638 | 6837 | 10.72 | 0.01 |
浙江大学 | 590 | 3823 | 6.48 | 0.01 |
佛罗里达州立大学 | 539 | 2829 | 5.25 | 0.01 |
瓦赫宁根大学 | 527 | 4893 | 9.28 | 0.01 |
巴基斯坦费萨拉巴德农业大学 | 524 | 2364 | 4.51 | 0.01 |
加州大学戴维思分校 | 516 | 4381 | 8.49 | 0.01 |
作者 | 机构 | 2010—2012年 | 2013—2015年 | 2016—2018年 | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
发文量 | H指数 | 发文量 | H指数 | 发文量 | H指数 | ||||
Fernie Alisdair R | 德国马克普朗克分子植物生理研究所 | 77 | 43 | 89 | 36 | 90 | 18 | ||
Shinozaki Kazuo | 日本理化研究所植物科学中心 | 61 | 44 | 38 | 23 | 33 | 13 | ||
Saito Kazuki | 日本千叶大学 | 39 | 27 | 32 | 20 | 40 | 13 | ||
Zhu Jian-Kang | 美国普度大学、中国科学院植物生理生态研究所 | 24 | 21 | 37 | 24 | 64 | 19 | ||
Tohge Takayuki | 德国马克斯普朗克分子植物生理研究所 | 19 | 18 | 35 | 22 | 30 | 12 | ||
Li Xianghua | 华中农业大学 | 24 | 19 | 19 | 15 | 13 | 8 | ||
Zhang Xianlong | 华中农业大学 | 15 | 11 | 22 | 17 | 29 | 12 | ||
Wan Jianmin | 中国农业科学院作物科学研究所、南京农业大学 | 18 | 11 | 23 | 15 | 33 | 10 | ||
Yamaguchi-Shinozaki Kazuko | 日本东京大学 | 30 | 28 | 32 | 24 | 17 | 9 | ||
Qian Qian | 中国水稻研究所 | 19 | 15 | 26 | 18 | 28 | 9 | ||
Li Xin | 不列颠哥伦比亚大学 | 21 | 17 | 14 | 11 | 20 | 8 | ||
Wang Yuanchao | 南京农业大学 | 14 | 13 | 21 | 13 | 18 | 7 | ||
Li Jiayang | 中国科学院遗传与发育生物学研究所 | 9 | 9 | 17 | 16 | 21 | 13 | ||
Ma Fengwang | 西北农林科技大学 | 11 | 11 | 30 | 12 | 42 | 10 | ||
Wang,Yucheng | 东北林业大学 | 15 | 10 | 13 | 8 | 20 | 6 | ||
Liu Bao | 东北师范大学 | 17 | 11 | 16 | 10 | 13 | 6 |
作者 | 机构 | 2010—2012年 | 2013—2015年 | 2016—2018年 | |||||
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发文量 | H指数 | 发文量 | H指数 | 发文量 | H指数 | ||||
Fernie Alisdair R | 德国马克普朗克分子植物生理研究所 | 77 | 43 | 89 | 36 | 90 | 18 | ||
Shinozaki Kazuo | 日本理化研究所植物科学中心 | 61 | 44 | 38 | 23 | 33 | 13 | ||
Saito Kazuki | 日本千叶大学 | 39 | 27 | 32 | 20 | 40 | 13 | ||
Zhu Jian-Kang | 美国普度大学、中国科学院植物生理生态研究所 | 24 | 21 | 37 | 24 | 64 | 19 | ||
Tohge Takayuki | 德国马克斯普朗克分子植物生理研究所 | 19 | 18 | 35 | 22 | 30 | 12 | ||
Li Xianghua | 华中农业大学 | 24 | 19 | 19 | 15 | 13 | 8 | ||
Zhang Xianlong | 华中农业大学 | 15 | 11 | 22 | 17 | 29 | 12 | ||
Wan Jianmin | 中国农业科学院作物科学研究所、南京农业大学 | 18 | 11 | 23 | 15 | 33 | 10 | ||
Yamaguchi-Shinozaki Kazuko | 日本东京大学 | 30 | 28 | 32 | 24 | 17 | 9 | ||
Qian Qian | 中国水稻研究所 | 19 | 15 | 26 | 18 | 28 | 9 | ||
Li Xin | 不列颠哥伦比亚大学 | 21 | 17 | 14 | 11 | 20 | 8 | ||
Wang Yuanchao | 南京农业大学 | 14 | 13 | 21 | 13 | 18 | 7 | ||
Li Jiayang | 中国科学院遗传与发育生物学研究所 | 9 | 9 | 17 | 16 | 21 | 13 | ||
Ma Fengwang | 西北农林科技大学 | 11 | 11 | 30 | 12 | 42 | 10 | ||
Wang,Yucheng | 东北林业大学 | 15 | 10 | 13 | 8 | 20 | 6 | ||
Liu Bao | 东北师范大学 | 17 | 11 | 16 | 10 | 13 | 6 |
序号 | 期刊名称 | 影响因子 | 3年影响因子增长/ % | 领域 论文量 | 刊载论文 总量 | 占比/% | 出版国家 | |||||||||
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2015年 | 2016年 | 2017年 | ||||||||||||||
1 | Frontiers in Plant Science | 4.495 | 4.291 | 3.677 | -18.20 | 2766 | 5260 | 52.59 | 瑞士 | |||||||
2 | Journal of Experimental Botany | 5.677 | 5.83 | 5.354 | -5.69 | 804 | 1477 | 54.43 | 英国 | |||||||
3 | Plant Physiology | 6.28 | 6.456 | 5.949 | -5.27 | 762 | 1515 | 50.30 | 美国 | |||||||
4 | Plant Physiology and Biochemistry | 2.928 | 2.724 | 2.718 | -7.17 | 485 | 952 | 50.95 | 法国 | |||||||
5 | BMC Plant Biology | 3.631 | 3.964 | 3.93 | 8.23 | 472 | 819 | 57.63 | 英国 | |||||||
6 | Plant Journal | 5.468 | 5.901 | 5.775 | 5.61 | 469 | 906 | 51.77 | 英国 | |||||||
7 | Plant Science | 3.362 | 3.437 | 3.712 | 10.41 | 326 | 612 | 53.27 | 爱尔兰 | |||||||
8 | Plant Cell | 8.438 | 8.726 | 8.228 | -2.49 | 306 | 576 | 53.13 | 美国 | |||||||
9 | Plant Cell Reports | 3.088 | 2.869 | 2.989 | -3.21 | 271 | 513 | 52.83 | 德国 | |||||||
10 | Plant Biotechnology Journal | 6.09 | 7.443 | 6.305 | 3.53 | 243 | 447 | 54.36 | 英国 | |||||||
11 | Plant Molecular Biology | 3.905 | 3.356 | 3.543 | -9.27 | 232 | 406 | 57.14 | 荷兰 | |||||||
12 | Molecular Plant | 7.142 | 8.827 | 9.326 | 30.58 | 217 | 313 | 69.33 | 中国 | |||||||
13 | Plant Growth Regulation | 2.333 | 2.646 | 2.081 | -10.80 | 205 | 381 | 53.81 | 荷兰 | |||||||
14 | Genetics and Molecular Research | 1.341 | 1.147 | 1.493 | 11.33 | 195 | 232 | 84.05 | 巴西 | |||||||
15 | Molecular Plant Pathology | 4.335 | 4.697 | 4.188 | -3.39 | 182 | 311 | 58.52 | 英国 | |||||||
16 | Plant Molecular Biology Reporter | 2.304 | 1.932 | 1.844 | -19.97 | 164 | 316 | 51.90 | 美国 | |||||||
17 | Molecular Plant Microbe Interactions | 4.145 | 4.332 | 3.588 | -13.44 | 160 | 285 | 56.14 | 美国 |
序号 | 期刊名称 | 影响因子 | 3年影响因子增长/ % | 领域 论文量 | 刊载论文 总量 | 占比/% | 出版国家 | |||||||||
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2015年 | 2016年 | 2017年 | ||||||||||||||
1 | Frontiers in Plant Science | 4.495 | 4.291 | 3.677 | -18.20 | 2766 | 5260 | 52.59 | 瑞士 | |||||||
2 | Journal of Experimental Botany | 5.677 | 5.83 | 5.354 | -5.69 | 804 | 1477 | 54.43 | 英国 | |||||||
3 | Plant Physiology | 6.28 | 6.456 | 5.949 | -5.27 | 762 | 1515 | 50.30 | 美国 | |||||||
4 | Plant Physiology and Biochemistry | 2.928 | 2.724 | 2.718 | -7.17 | 485 | 952 | 50.95 | 法国 | |||||||
5 | BMC Plant Biology | 3.631 | 3.964 | 3.93 | 8.23 | 472 | 819 | 57.63 | 英国 | |||||||
6 | Plant Journal | 5.468 | 5.901 | 5.775 | 5.61 | 469 | 906 | 51.77 | 英国 | |||||||
7 | Plant Science | 3.362 | 3.437 | 3.712 | 10.41 | 326 | 612 | 53.27 | 爱尔兰 | |||||||
8 | Plant Cell | 8.438 | 8.726 | 8.228 | -2.49 | 306 | 576 | 53.13 | 美国 | |||||||
9 | Plant Cell Reports | 3.088 | 2.869 | 2.989 | -3.21 | 271 | 513 | 52.83 | 德国 | |||||||
10 | Plant Biotechnology Journal | 6.09 | 7.443 | 6.305 | 3.53 | 243 | 447 | 54.36 | 英国 | |||||||
11 | Plant Molecular Biology | 3.905 | 3.356 | 3.543 | -9.27 | 232 | 406 | 57.14 | 荷兰 | |||||||
12 | Molecular Plant | 7.142 | 8.827 | 9.326 | 30.58 | 217 | 313 | 69.33 | 中国 | |||||||
13 | Plant Growth Regulation | 2.333 | 2.646 | 2.081 | -10.80 | 205 | 381 | 53.81 | 荷兰 | |||||||
14 | Genetics and Molecular Research | 1.341 | 1.147 | 1.493 | 11.33 | 195 | 232 | 84.05 | 巴西 | |||||||
15 | Molecular Plant Pathology | 4.335 | 4.697 | 4.188 | -3.39 | 182 | 311 | 58.52 | 英国 | |||||||
16 | Plant Molecular Biology Reporter | 2.304 | 1.932 | 1.844 | -19.97 | 164 | 316 | 51.90 | 美国 | |||||||
17 | Molecular Plant Microbe Interactions | 4.145 | 4.332 | 3.588 | -13.44 | 160 | 285 | 56.14 | 美国 |
序号 | 题名 | 通讯作者 | 通讯作者所在机构 | 期刊 | 文献 类型 | 参考 文献 | ||||||
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1 | Abiotic Stress Signaling and Responses in Plants | Zhu Jian-kang | 中国科学院、普度大学 | Cell | 综述 | |||||||
2 | g:Profiler-a web server for functional interpretation of gene lists (2016 update) | Reimand J、 Vilo Jaak | 塔尔图大学、多伦多大学 | Nucleic Acids Research | 研究论文 | |||||||
3 | Ensembl Genomes 2016: more genomes, more complexity | Kersey P J | 欧洲生物信息研究所 | Nucleic Acids Research | 研究论文 | |||||||
4 | Taxonomy, Physiology, and Natural Products of Actinobacteria | van Wezel Gilles P | 荷兰莱顿大学 | Microbiology and Molecular Biology Reviews | 综述 | |||||||
5 | Applications of CRISPR technologies in research and beyond | Doudna Jennifer A | 美国劳伦斯伯克利实验室、 加州大学伯克利分校 | Nature Biotechnology | 综述 | |||||||
6 | Regulation of pattern recognition receptor signaling in plants | Zipfel Cyril | 英国剑桥大学塞恩斯伯里实验室 | Nature Reviews Immunology | 综述 | |||||||
7 | Plant hormone-mediated regulation of stress responses | Zipfel Cyril | 新加坡国立大学 | BMC Plant Biology | 综述 | |||||||
8 | Natural product discovery: past, present, and future | Baltz Richard H | CognoGen Biotechnol Consulting | Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology | 综述 | |||||||
9 | Evolution of Gene Duplication in Plants | Shiu Shin-Han | 密西根州立大学 | Plant Physiology | 综述 | |||||||
10 | Abscisic Acid and Abiotic Stress Tolerance in Crop Plants | Li Jiaxu | 密西西比州立大学 | Frontiers in Plant Science | 综述 |
序号 | 题名 | 通讯作者 | 通讯作者所在机构 | 期刊 | 文献 类型 | 参考 文献 | ||||||
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1 | Abiotic Stress Signaling and Responses in Plants | Zhu Jian-kang | 中国科学院、普度大学 | Cell | 综述 | |||||||
2 | g:Profiler-a web server for functional interpretation of gene lists (2016 update) | Reimand J、 Vilo Jaak | 塔尔图大学、多伦多大学 | Nucleic Acids Research | 研究论文 | |||||||
3 | Ensembl Genomes 2016: more genomes, more complexity | Kersey P J | 欧洲生物信息研究所 | Nucleic Acids Research | 研究论文 | |||||||
4 | Taxonomy, Physiology, and Natural Products of Actinobacteria | van Wezel Gilles P | 荷兰莱顿大学 | Microbiology and Molecular Biology Reviews | 综述 | |||||||
5 | Applications of CRISPR technologies in research and beyond | Doudna Jennifer A | 美国劳伦斯伯克利实验室、 加州大学伯克利分校 | Nature Biotechnology | 综述 | |||||||
6 | Regulation of pattern recognition receptor signaling in plants | Zipfel Cyril | 英国剑桥大学塞恩斯伯里实验室 | Nature Reviews Immunology | 综述 | |||||||
7 | Plant hormone-mediated regulation of stress responses | Zipfel Cyril | 新加坡国立大学 | BMC Plant Biology | 综述 | |||||||
8 | Natural product discovery: past, present, and future | Baltz Richard H | CognoGen Biotechnol Consulting | Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology | 综述 | |||||||
9 | Evolution of Gene Duplication in Plants | Shiu Shin-Han | 密西根州立大学 | Plant Physiology | 综述 | |||||||
10 | Abscisic Acid and Abiotic Stress Tolerance in Crop Plants | Li Jiaxu | 密西西比州立大学 | Frontiers in Plant Science | 综述 |
序号 | 题名 | 通讯作者 | 通讯作者所在机构 | 期刊 | 论文 类型 | 参考 文献 | |||||
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1 | Programmable base editing of A.T to G.C in genomic DNA without DNA cleavage | Liu David R | 哈佛大学、 麻省理工-哈佛博德研究所 | Nature | 研究论文 | ||||||
2 | PlantTFDB 4.0: toward a central hub for transcription factors and regulatory interactions in plants | Luo Jingchu、 Gao Ge | 北京大学 | Nucleic Acids Research | 研究论文 | ||||||
3 | RNA targeting with CRISPR-Cas13 | Zhang Feng | 麻省理工-哈佛博德研究所、 哈佛医学院、麻省理工大学 | Nature | 研究论文 | ||||||
4 | Precise base editing in rice, wheat and maize with a Cas9-cytidine deaminase fusion | Gao Caixia | 中国科学院遗传与 发育生物学研究所 | Nature Biotechnology | 研究论文 | ||||||
5 | Improved maize reference genome with single-molecule technologies | Ware Doreen | BioNano Genom、 冷泉港实验室、康奈尔大学 | Nature | 研究论文 | ||||||
6 | Insights into Land Plant Evolution Garnered from the Marchantia polymorpha Genome | Bowman John L、 Kohchi Takayuki、 Yamato Katsuyuki T | 莫奈什大学、京都大学 | Cell | 研究论文 | ||||||
7 | Efficient DNA-free genome editing of bread wheat using CRISPR/Cas9 ribonucleoprotein complexes | Gao Caixia | 中国科学院遗传与 发育生物学研究所 | Nature Communications | 研究论文 | ||||||
8 | Plant signalling in symbiosis and immunity | Zipfel C、 Oldroyd Giles E D | 塞恩斯伯里实验室、 英国约翰内英尼斯中心 | Nature | 综述 | ||||||
9 | Abscisic Acid Signaling and Abiotic Stress Tolerance in Plants: A Review on Current Knowledge and Future Prospects | Sharma Shivesh | 莫蒂拉尔尼印度赫鲁 国家理工学院 | Frontiers in Plant Science | 综述 | ||||||
10 | High-quality de novo assembly of the apple genome and methylome dynamics of early fruit development | Bucher Etienne | 法国西布列塔尼大学 | Nature Genetics | 研究论文 |
序号 | 题名 | 通讯作者 | 通讯作者所在机构 | 期刊 | 论文 类型 | 参考 文献 | |||||
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1 | Programmable base editing of A.T to G.C in genomic DNA without DNA cleavage | Liu David R | 哈佛大学、 麻省理工-哈佛博德研究所 | Nature | 研究论文 | ||||||
2 | PlantTFDB 4.0: toward a central hub for transcription factors and regulatory interactions in plants | Luo Jingchu、 Gao Ge | 北京大学 | Nucleic Acids Research | 研究论文 | ||||||
3 | RNA targeting with CRISPR-Cas13 | Zhang Feng | 麻省理工-哈佛博德研究所、 哈佛医学院、麻省理工大学 | Nature | 研究论文 | ||||||
4 | Precise base editing in rice, wheat and maize with a Cas9-cytidine deaminase fusion | Gao Caixia | 中国科学院遗传与 发育生物学研究所 | Nature Biotechnology | 研究论文 | ||||||
5 | Improved maize reference genome with single-molecule technologies | Ware Doreen | BioNano Genom、 冷泉港实验室、康奈尔大学 | Nature | 研究论文 | ||||||
6 | Insights into Land Plant Evolution Garnered from the Marchantia polymorpha Genome | Bowman John L、 Kohchi Takayuki、 Yamato Katsuyuki T | 莫奈什大学、京都大学 | Cell | 研究论文 | ||||||
7 | Efficient DNA-free genome editing of bread wheat using CRISPR/Cas9 ribonucleoprotein complexes | Gao Caixia | 中国科学院遗传与 发育生物学研究所 | Nature Communications | 研究论文 | ||||||
8 | Plant signalling in symbiosis and immunity | Zipfel C、 Oldroyd Giles E D | 塞恩斯伯里实验室、 英国约翰内英尼斯中心 | Nature | 综述 | ||||||
9 | Abscisic Acid Signaling and Abiotic Stress Tolerance in Plants: A Review on Current Knowledge and Future Prospects | Sharma Shivesh | 莫蒂拉尔尼印度赫鲁 国家理工学院 | Frontiers in Plant Science | 综述 | ||||||
10 | High-quality de novo assembly of the apple genome and methylome dynamics of early fruit development | Bucher Etienne | 法国西布列塔尼大学 | Nature Genetics | 研究论文 |
序号 | 题名 | 通讯作者 | 通讯作者所在机构 | 期刊 | 文献 类型 | 参考 文献 | ||||
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1 | Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome | Rudi Appels、 Kellye Eversole、 Nils Stein | 国际小麦基因组测序联盟 (IWGSC)等 | Science | 研究论文 | |||||
2 | BUSCO Applications from Quality Assessments to Gene Prediction and Phylogenomics | Zdobnov Evgeny M | 瑞士生物信息研究所 | Molecular Biology and Evolution | 研究论文 | |||||
3 | Genomic variation in 3,010 diverse accessions of Asian cultivated rice | Wing Rod A、Ruan Jue、 Zhang Gengyun、 Chaochun Wei等 | 中国农业科学院 作物科学研究所、国际水稻所、 上海交通大学等 | Nature | 研究论文 | |||||
4 | Systematic discovery of antiphage defense systems in the microbial pangenome | Sorek Rotem | 以色列魏茨曼科学研究所 | Science | 研究论文 | |||||
5 | Speed breeding is a powerful tool to accelerate crop research and breeding | Wulff Brande B H、 Hicke Lee T | 英国约翰内英尼斯中心、 昆士兰大学 | Nature Plants | 研究论文 | |||||
6 | ROS-related redox regulation and signaling in plants | Noctor Graham | 法国国家科学研究中心、 法国国家农业科学院、 巴黎萨克雷大学 | Seminars in Cell & Developmental Biology | 综述 | |||||
7 | Plants send small RNAs in extracellular vesicles to fungal pathogen to silence virulence genes | Jin Hailing | 加州大学河滨分校 | Science | 研究论文 | |||||
8 | Dynamic root exudate chemistry and microbial substrate preferences drive patterns in rhizosphere microbial community assembly | Northen Trent R、 Brodie Eoin L | 美国劳伦斯伯克利实验室、 加州大学伯克利分校 | Nature Microbiology | 研究论文 | |||||
9 | Elucidating the molecular mechanisms mediating plant salt-stress responses | Guo Yan | 中国农业大学 | New Phytologist | 综述 | |||||
10 | Draft genome sequence of Camellia sinensis var. sinensis provides insights into the evolution of the tea genome and tea quality | Zhao Shancen、 Wan Xiaochun | 安徽农业大学、华大基因 | Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America | 研究论文 |
序号 | 题名 | 通讯作者 | 通讯作者所在机构 | 期刊 | 文献 类型 | 参考 文献 | ||||
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1 | Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome | Rudi Appels、 Kellye Eversole、 Nils Stein | 国际小麦基因组测序联盟 (IWGSC)等 | Science | 研究论文 | |||||
2 | BUSCO Applications from Quality Assessments to Gene Prediction and Phylogenomics | Zdobnov Evgeny M | 瑞士生物信息研究所 | Molecular Biology and Evolution | 研究论文 | |||||
3 | Genomic variation in 3,010 diverse accessions of Asian cultivated rice | Wing Rod A、Ruan Jue、 Zhang Gengyun、 Chaochun Wei等 | 中国农业科学院 作物科学研究所、国际水稻所、 上海交通大学等 | Nature | 研究论文 | |||||
4 | Systematic discovery of antiphage defense systems in the microbial pangenome | Sorek Rotem | 以色列魏茨曼科学研究所 | Science | 研究论文 | |||||
5 | Speed breeding is a powerful tool to accelerate crop research and breeding | Wulff Brande B H、 Hicke Lee T | 英国约翰内英尼斯中心、 昆士兰大学 | Nature Plants | 研究论文 | |||||
6 | ROS-related redox regulation and signaling in plants | Noctor Graham | 法国国家科学研究中心、 法国国家农业科学院、 巴黎萨克雷大学 | Seminars in Cell & Developmental Biology | 综述 | |||||
7 | Plants send small RNAs in extracellular vesicles to fungal pathogen to silence virulence genes | Jin Hailing | 加州大学河滨分校 | Science | 研究论文 | |||||
8 | Dynamic root exudate chemistry and microbial substrate preferences drive patterns in rhizosphere microbial community assembly | Northen Trent R、 Brodie Eoin L | 美国劳伦斯伯克利实验室、 加州大学伯克利分校 | Nature Microbiology | 研究论文 | |||||
9 | Elucidating the molecular mechanisms mediating plant salt-stress responses | Guo Yan | 中国农业大学 | New Phytologist | 综述 | |||||
10 | Draft genome sequence of Camellia sinensis var. sinensis provides insights into the evolution of the tea genome and tea quality | Zhao Shancen、 Wan Xiaochun | 安徽农业大学、华大基因 | Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America | 研究论文 |
[1] | 重康. 中国植物科学基础研究概览[J].植物学报2015,50(4):412-459. |
[2] |
杨淑华, 王台, 钱前, 等. 2015年中国植物科学若干领域重要研究进展[J]. 植物学报, 2016,51(4):416-472.
doi: 10.11983/CBB16160 URL |
[3] |
王小菁, 萧浪涛, 董爱武, 等. 2016年中国植物科学若干领域重要研究进展[J]. 植物学报, 2017,52(4):394-452.
doi: 10.11983/CBB17147 URL |
[4] |
陈凡, 钱前, 王台, 等. 2017年中国植物科学若干领域重要研究进展[J]. 植物学报, 2018,53(4):391-440.
doi: 10.11983/CBB18177 URL |
[5] |
钱前, 漆小泉, 林荣呈, 等. 2018年中国植物科学若干领域重要研究进展[J]. 植物学报, 2019,54(4):405-440.
doi: 10.11983/CBB19165 URL |
[6] | 李楠. 基于文献计量的水稻基因组学研究趋势以及热点分析[J]. 中国农学通报, 2016,32(5):184-193. |
[7] | 李晓曼, 孙巍. 领域主题动态演进分析——以动物资源与育种领域为例[J].数字图书管论坛 2015(12):29-33. |
[8] | 吴笑臣. 国内STEM教育研究热点领域及特点——基于2011—2016年CNKI文献的共词分析[J]. 赣南师范学院学报, 2019,40(4):54-58. |
[9] |
Zhu J K. Abiotic Stress Signaling and Responses in Plants[J]. Cell, 2016,167(2):313-324.
doi: 10.1016/j.cell.2016.08.029 URL pmid: 27716505 |
[10] |
Barrangou R, Doudna J A. Applications of CRISPR technologies in research and beyond[J]. Nat Biotechnol, 2016,34(9):933-941.
doi: 10.1038/nbt.3659 URL pmid: 27606440 |
[11] |
Kersey P J, Allen J E, Armean I, et al. Ensembl Genomes 2016: more genomes, more complexity[J]. Nucleic Acids Res, 2016,44(D1):D574-580.
doi: 10.1093/nar/gkv1209 URL pmid: 26578574 |
[12] |
Reimand J, Arak T, Vilo J. g:Profiler--a web server for functional interpretation of gene lists (2011 update)[J]. Nucleic Acids Res, 2011,39(Web Server issue):W307-315.
doi: 10.1093/nar/gkr378 URL pmid: 21646343 |
[13] |
Barka E A, Vatsa P, Sanchez L, et al. Taxonomy, Physiology, and Natural Products of Actinobacteria[J]. Microbiol Mol Biol Rev, 2016,80(1):1-43.
doi: 10.1128/MMBR.00019-15 URL pmid: 26609051 |
[14] |
Couto D, Zipfel C. Regulation of pattern recognition receptor signalling in plants[J]. Nat Rev Immunol, 2016,16(9):537-552.
doi: 10.1038/nri.2016.77 URL pmid: 27477127 |
[15] |
Verma V, Ravindran P, Kumar P P. Plant hormone-mediated regulation of stress responses[J]. BMC Plant Biol, 2016,16:86.
doi: 10.1186/s12870-016-0771-y URL pmid: 27079791 |
[16] |
Katz L, Baltz R H. Natural product discovery: past, present, and future[J]. J Ind Microbiol Biotechnol, 2016,43(2-3):155-76.
doi: 10.1007/s10295-015-1723-5 URL pmid: 26739136 |
[17] |
Panchy N, Lehti-Shiu M, Shiu S H. Evolution of Gene Duplication in Plants[J]. Plant Physiol, 2016,171(4):2294-316.
doi: 10.1104/pp.16.00523 URL pmid: 27288366 |
[18] |
Sah S K, Reddy K R, Li J. Abscisic Acid and Abiotic Stress Tolerance in Crop Plants[J]. Front Plant Sci, 2016,7:571.
doi: 10.3389/fpls.2016.00571 URL pmid: 27200044 |
[19] |
Gaudelli N M, Komor A C, Rees H A, et al. Programmable base editing of A*T to G*C in genomic DNA without DNA cleavage[J]. Nature, 2017,551:464-471.
URL pmid: 29160308 |
[20] |
Zong Y, Wang Y, Li C, et al. Precise base editing in rice, wheat and maize with a Cas9-cytidine deaminase fusion[J]. Nat Biotechnol, 2017,35(5):438-440.
URL pmid: 28244994 |
[21] |
Liang Z, Chen K, Li T, et al. Efficient DNA-free genome editing of bread wheat using CRISPR/Cas9 ribonucleoprotein complexes[J]. Nat Commun, 2017,8:14261.
doi: 10.1038/ncomms14261 URL pmid: 28098143 |
[22] |
Jin J, Tian F, Yang D C, et al. PlantTFDB 4.0: toward a central hub for transcription factors and regulatory interactions in plants[J]. Nucleic Acids Res, 2017,45(D1):D1040-D1045.
doi: 10.1093/nar/gkw982 URL pmid: 27924042 |
[23] |
Jiao Y, Peluso P, Shi J, et al. Improved maize reference genome with single-molecule technologies[J]. Nature, 2017,546:524-527.
doi: 10.1038/nature22971 URL pmid: 28605751 |
[24] |
Daccord N, Celton J M, Linsmith G, et al. High-quality de novo assembly of the apple genome and methylome dynamics of early fruit development[J]. Nat Genet, 2017. 49(7):1099-1106.
doi: 10.1038/ng.3886 URL pmid: 28581499 |
[25] |
Vishwakarma K, Upadhyay N, Kumar N, et al. Abscisic Acid Signaling and Abiotic Stress Tolerance in Plants: A Review on Current Knowledge and Future Prospects[J]. Front Plant Sci, 2017,8:161.
doi: 10.3389/fpls.2017.00161 URL pmid: 28265276 |
[26] |
Zipfel C, Oldroyd G E. Plant signalling in symbiosis and immunity[J]. Nature, 2017,543:328-336.
doi: 10.1038/nature22009 URL pmid: 28300100 |
[27] |
Abudayyeh O O, Gootenberg J S, Essletzbichler P, et al. RNA targeting with CRISPR-Cas13[J]. Nature, 2017,550:280-284.
doi: 10.1038/nature24049 URL pmid: 28976959 |
[28] |
Bowman J L, Kohchi T, Yamato K T, et al. Insights into Land Plant Evolution Garnered from the Marchantia polymorpha Genome[J]. Cell, 2017,171(2):287-304.
doi: 10.1016/j.cell.2017.09.030 URL pmid: 28985561 |
[29] |
International Wheat Genome Sequencing. Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome[J]. Science, 2018,361.
doi: 10.1126/science.aav0887 URL pmid: 30262485 |
[30] |
Wang W, Mauleon R, Hu Z, et al. Genomic variation in 3010 diverse accessions of Asian cultivated rice[J]. Nature, 2018,557:43-49.
doi: 10.1038/s41586-018-0063-9 URL pmid: 29695866 |
[31] |
Waterhouse R M, Seppey M, Simao F A, et al. BUSCO applications from quality assessments to gene prediction and phylogenomics[J]. Mol Biol Evol, 2017,35(3):543-548.
doi: 10.1093/molbev/msx319 URL pmid: 29220515 |
[32] |
Doron S, Melamed S, Ofir G, et al. Systematic discovery of antiphage defense systems in the microbial pangenome[J]. Science, 2018,359.
doi: 10.1126/science.aat3764 URL pmid: 29599229 |
[33] |
Watson A, Ghosh S, Williams M J, et al. Speed breeding is a powerful tool to accelerate crop research and breeding[J]. Nat Plants, 2018,4(1):23-29.
doi: 10.1038/s41477-017-0083-8 URL pmid: 29292376 |
[34] |
Noctor G, Reichheld J P, Foyer C H. ROS-related redox regulation and signaling in plants[J]. Semin Cell Dev Biol, 2018,80:3-12.
doi: 10.1016/j.semcdb.2017.07.013 URL pmid: 28733165 |
[35] |
Cai Q, Qiao L, Wang M, et al. Plants send small RNAs in extracellular vesicles to fungal pathogen to silence virulence genes[J]. Science, 2018,360:1126-1129.
doi: 10.1126/science.aar4142 URL pmid: 29773668 |
[36] |
Zhalnina K, Louie K B, Hao Z, et al. Dynamic root exudate chemistry and microbial substrate preferences drive patterns in rhizosphere microbial community assembly[J]. Nat Microbiol, 2018,3(4):470-480.
doi: 10.1038/s41564-018-0129-3 URL pmid: 29556109 |
[37] |
Yang Y, Guo Y. Elucidating the molecular mechanisms mediating plant salt-stress responses[J]. New Phytol, 2018,217(2):523-539.
doi: 10.1111/nph.14920 URL pmid: 29205383 |
[38] |
Wei C, Yang H, Wang S, et al. Draft genome sequence of Camellia sinensis var. sinensis provides insights into the evolution of the tea genome and tea quality[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 2018,115(18):E4151-E4158.
doi: 10.1073/pnas.1719622115 URL pmid: 29678829 |
[1] | 吴松, 周甜, 杨立宾, 江云兵, 潘虹, 刘永志, 杜君. 基于VOSviewer的叶际微生物研究现状可视化分析[J]. 中国农学通报, 2023, 39(1): 142-150. |
[2] | 陈和敏, 肖文芳, 陈和明, 吕复兵, 朱根发, 李宗艳, 李佐. 基于CiteSpace的兰花保鲜研究进展及可视化分析[J]. 中国农学通报, 2023, 39(1): 151-164. |
[3] | 汪小飞, 张家伟, 刘铁宁, 任小龙, 贾志宽, 蔡铁. 小麦抗倒伏研究动态追踪——基于WoS和CNKI数据库的文献计量分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(5): 132-142. |
[4] | 张欣蕊, 冯启鑫, 安绮沄, 程丽, 李冲伟. 基于Web of Science紫苏研究进展与态势分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(4): 144-152. |
[5] | 王爱姣, 叶春蕾, 牛为民, 车发展. 2002—2022年国内外虎杖研究态势的文献计量分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(35): 134-140. |
[6] | 王琰, 胥美美, 单连慧, 苟欢, 童俞嘉, 安新颖. 基于文献专利计量的重大植物疫情领域态势分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(34): 144-154. |
[7] | 孙铭阳, 徐世强, 张闻婷, 顾艳, 梅瑜, 李静宇, 周芳, 王继华. 国内外穿心莲研究态势分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(34): 155-164. |
[8] | 王洋, 张瑞, 周雨晴, 刘永昊, 刘高生, 戴其根. 基于文献计量的国内水稻耐盐性研究态势分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(31): 147-153. |
[9] | 马笑, 张世浩, 张芬, 刘发波, 梁涛, 王孝忠, 陈新平. 基于Web of Science对蔬菜系统活性氮损失研究的文献计量分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(26): 124-132. |
[10] | 管宏友. 土壤污染防治研究的文献计量分析及可视化表达[J]. 中国农学通报, 2022, 38(26): 133-138. |
[11] | 金涛涛, 赵明, 毛洁莹, 罗天宇, 刘玮, 王琼. 基于CiteSpace的球囊霉素相关土壤蛋白知识图谱分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(24): 100-108. |
[12] | 吴松, 刘永志, 杨立宾, 江云兵, 周甜. 森林温室气体排放的研究态势分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(19): 99-108. |
[13] | 陈莹, 吴繁琦, 耿业业, 白钰, 王桂荣, 杨慧婕, 孙志蓉. 基于文献计量学的根瘤固氮对豆科植物影响研究可视化分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(18): 35-43. |
[14] | 翁晓虹, 隋心. 基于Web of Science的森林土壤微生物多样性研究趋势分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(10): 157-164. |
[15] | 吴曼, 孟翠萍, 梁海燕, 杨丽玉, 吴琪, 慈敦伟, 郑永美, 李新国. 国内外根瘤菌研究的文献计量学分析[J]. 中国农学通报, 2022, 38(1): 155-164. |
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