Isolation, Identification and Antibiotics Susceptibility Test of Exiguobacterium profundum from Procambarus clarkii

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb2022-0066

Abstract

Abstract:

To identify the disease and mortality cause of Procambarus clarkii, a dominant strain isolated from hepatopancreas of the dying crayfish was identified as Exiguobacterium profundum by colony morphology observation, Gram staining, physiological and biochemical identification, 16srRNA sequencing analysis and phylogenetic tree construction. The resistance of this strain to 30 kinds of antibacterial drugs, including mycin G, ampicillin, cephalexin, amikacin, gentamicin, kanamycin, norfloxacin, cotrimoxazole and so on, was determined by disc diffusion method, and the results showed that the strain was sensitive to all the 30 kinds of drugs. After the regression infection experiment, it was inferred that the strain might be involved in the pathogenic process of P. clarkii. The current study could provide certain reference and a theoretical basis for the pathogen identification, drug diagnosis and treatment of E. profundum in P. clarkii.

Key words: Procambarus clarkii, Exiguobacterium profundum, pathogen identification, 16srRNA gene, drug susceptibility test, regression infection experiment

SHI Ruixue, LI Yanhe. Isolation, Identification and Antibiotics Susceptibility Test of Exiguobacterium profundum from Procambarus clarkii[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2023, 39(2): 123-129.

Figures/Tables 7

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测定项目	反应结果	测定项目	反应结果
氧化酶	－	硝酸盐还原	＋
过氧化氢酶	＋	蔗糖发酵	＋
硫化氢	－	0% NaCl生长	＋
吲哚	－	3% NaCl生长	＋
V-P	－	6% NaCl生长	＋
甲基红	－	8% NaCl生长	＋
运动性	＋	10% NaCl生长	＋
淀粉水解	－	12% NaCl生长	＋

测定项目	反应结果	测定项目	反应结果
氧化酶	－	硝酸盐还原	＋
过氧化氢酶	＋	蔗糖发酵	＋
硫化氢	－	0% NaCl生长	＋
吲哚	－	3% NaCl生长	＋
V-P	－	6% NaCl生长	＋
甲基红	－	8% NaCl生长	＋
运动性	＋	10% NaCl生长	＋
淀粉水解	－	12% NaCl生长	＋

药物	抑菌圈直径判断标准/mm				药物含量/(μg/disc)	抑菌圈直径/mm	敏感性
药物	耐药R		中介I	敏感S	药物含量/(μg/disc)	抑菌圈直径/mm	敏感性
青霉素G	≤17		18~20	≥21	10U	36±0.71	S
苯唑西林（苯唑青霉素）	≤10		11~12	≥13	1	27.67±0.47	S
氨苄西林	≤13		14~16	≥17	10	34.73±0.52	S
羧苄西林	≤19		20~22	≥23	100	37.5±0.41	S
哌拉西林/他唑巴坦（特治星）	≤17		18~20	≥21	100/10	38	S
头孢氨苄	≤14		15~17	≥18	30	31.33±0.24	S
头孢唑啉	≤14		15~17	≥18	30	32±0.82	S
头孢拉定	≤14		15~17	≥18	30	32±0.71	S
头孢呋辛（头孢肤）肟（西力欣）	≤14		15~22	≥23	30	29	S
头孢他啶	≤14		15~17	≥18	30	25.83±0.24	S
头孢曲松	≤13		14~20	≥21	30	29.33±0.47	S
头孢哌酮	≤15		16~20	≥21	75	34.17±0.24	S
阿米卡星（丁胺卡那）	≤14		15~16	≥17	30	22.67±0.47	S
庆大霉素	≤12		13~14	≥15	10	22±0.82	S
卡那霉素	≤13		14~17	≥18	30	21.67±0.62	S
新霉素	≤12		13~16	≥17	30	21	S
四环素	≤14		15~18	≥19	30	23.5±0.41	S
多西环素	≤12		13~15	≥16	30	25.83±0.62	S
米诺环素(美满霉素)		≤14	15~18	≥19	30	26.33±0.47		S
红霉素		≤13	14~22	≥23	15	21.67±0.24		S
麦迪霉素		≤13	14~17	≥18	30	20.83±0.24		S
诺氟沙星		≤12	13~16	≥17	10	25.67±0.47		S
氧氟沙星		≤12	13~15	≥16	5	28.33±0.24		S
环丙氟哌酸（环丙沙星）		≤15	16~20	≥21	5	28.33±0.47		S
万古霉素		≤14	15~16	≥17	30	18.83±0.24		S
多粘菌素B		≤8	8~11	≥12	300	14.17±0.24		S
复方新诺明		≤14	15~20	≥21	23.75	21		S
痢特灵		≤14	15~16	≥17	300	21.5±0.41		S
氯霉素		≤12	13~17	≥18	30	24.5±0.71		S
克林霉素（氯洁霉素）		≤14	15~20	≥21	2	23.33±0.24		S

药物	抑菌圈直径判断标准/mm				药物含量/(μg/disc)	抑菌圈直径/mm	敏感性
药物	耐药R		中介I	敏感S	药物含量/(μg/disc)	抑菌圈直径/mm	敏感性
青霉素G	≤17		18~20	≥21	10U	36±0.71	S
苯唑西林（苯唑青霉素）	≤10		11~12	≥13	1	27.67±0.47	S
氨苄西林	≤13		14~16	≥17	10	34.73±0.52	S
羧苄西林	≤19		20~22	≥23	100	37.5±0.41	S
哌拉西林/他唑巴坦（特治星）	≤17		18~20	≥21	100/10	38	S
头孢氨苄	≤14		15~17	≥18	30	31.33±0.24	S
头孢唑啉	≤14		15~17	≥18	30	32±0.82	S
头孢拉定	≤14		15~17	≥18	30	32±0.71	S
头孢呋辛（头孢肤）肟（西力欣）	≤14		15~22	≥23	30	29	S
头孢他啶	≤14		15~17	≥18	30	25.83±0.24	S
头孢曲松	≤13		14~20	≥21	30	29.33±0.47	S
头孢哌酮	≤15		16~20	≥21	75	34.17±0.24	S
阿米卡星（丁胺卡那）	≤14		15~16	≥17	30	22.67±0.47	S
庆大霉素	≤12		13~14	≥15	10	22±0.82	S
卡那霉素	≤13		14~17	≥18	30	21.67±0.62	S
新霉素	≤12		13~16	≥17	30	21	S
四环素	≤14		15~18	≥19	30	23.5±0.41	S
多西环素	≤12		13~15	≥16	30	25.83±0.62	S
米诺环素(美满霉素)		≤14	15~18	≥19	30	26.33±0.47		S
红霉素		≤13	14~22	≥23	15	21.67±0.24		S
麦迪霉素		≤13	14~17	≥18	30	20.83±0.24		S
诺氟沙星		≤12	13~16	≥17	10	25.67±0.47		S
氧氟沙星		≤12	13~15	≥16	5	28.33±0.24		S
环丙氟哌酸（环丙沙星）		≤15	16~20	≥21	5	28.33±0.47		S
万古霉素		≤14	15~16	≥17	30	18.83±0.24		S
多粘菌素B		≤8	8~11	≥12	300	14.17±0.24		S
复方新诺明		≤14	15~20	≥21	23.75	21		S
痢特灵		≤14	15~16	≥17	300	21.5±0.41		S
氯霉素		≤12	13~17	≥18	30	24.5±0.71		S
克林霉素（氯洁霉素）		≤14	15~20	≥21	2	23.33±0.24		S

组别	感染浓度/(cfu/mL)	感染后不同时间死亡数							死亡率/%
组别	感染浓度/(cfu/mL)	1 d	2 d	3 d	4 d	5 d	6 d	7 d	死亡率/%
阴性对照	0	0	1	0	0	1	0	0	10
1	1.808×10⁸	0	1	0	0	1	0	1	15
2	1.808×10⁷	0	0	0	1	1	0	0	10
3	1.808×10⁵	0	0	1	0	1	0	0	10
4	1.808×10³	0	1	3	1	0	0	2	35
5	1.808×10¹	0	0	0	0	1	0	1	10