Typing Methods of Bacillus cereus: Research Progress

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb2021-1029

Abstract

Abstract:

Bacillus cereus is an opportunistic pathogen which can cause food poisoning, and it is widely distributed in nature. The pathogenic strain and Bacillus anthracis have similar toxins, and the strains that cause poisoning are divided into two categories of vomiting and diarrhea. The study on Bacillus cereus typing has important implications for the tracing and the epidemiological investigation. At present, the popular methods for typing this bacterium are traditional typing methods and molecular typing methods. The traditional typing methods include phage typing, biochemical typing, etc.; and the molecular typing methods include repetitive-element PCR, amplified fragment length polymorphism, whole genome sequencing and so on. This paper took the Bacillus cereus as the test object, reviewed and expounded all the typing methods and the advantages and disadvantages of them, with the aim of providing reference for prevention and control of bacterial disease caused by this bacterium.

Key words: Bacillus cereus, traditional typing methods, molecular typing methods, PCR, matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry

CLC Number:

Q93-31

MENG Qinglei, ZHANG Yuliang, ZHAO Donghui, JIA Weijuan, HE Yunjiang, CHI Shanshan, CHEN Yunjiao, WANG Xueli. Typing Methods of Bacillus cereus: Research Progress[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2022, 38(29): 61-66.

Figures/Tables 1

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序号	分型方法	优点	缺点
1	多位点序列分型	分辨率较高	不宜用于持家基因高度相似的菌株的分型
2	重复序列PCR分型	应用范围广、操作简单、结果准确	对相同来源菌株的分型效果不好
3	扩增片段长度多态性分型	重复性好,多态性强	需片段两端与相应接头片段连接方能有效扩增
4	随机扩增多态性DNA分型	操作最简单、经济成本低	稳定性差、重复性差
5	脉冲场凝胶电泳分型	重复性高、分辨力强、可进行菌株溯源	耗时长、经济成本高
6	全基因组测序分型	发展潜力大	成本高、通量低、错误率高
7	基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分型	通量高、鉴定速度快、结果准确	易受客观因素干扰、有局限性

序号	分型方法	优点	缺点
1	多位点序列分型	分辨率较高	不宜用于持家基因高度相似的菌株的分型
2	重复序列PCR分型	应用范围广、操作简单、结果准确	对相同来源菌株的分型效果不好
3	扩增片段长度多态性分型	重复性好,多态性强	需片段两端与相应接头片段连接方能有效扩增
4	随机扩增多态性DNA分型	操作最简单、经济成本低	稳定性差、重复性差
5	脉冲场凝胶电泳分型	重复性高、分辨力强、可进行菌株溯源	耗时长、经济成本高
6	全基因组测序分型	发展潜力大	成本高、通量低、错误率高
7	基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分型	通量高、鉴定速度快、结果准确	易受客观因素干扰、有局限性