Chinese Agricultural Science Bulletin ›› 2025, Vol. 41 ›› Issue (19): 95-102.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.casb2024-0804
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GU Pengkun1,2,3(), QIN Lide1,3, TIAN Tongxu1,2, XIANG Wenjun1,3, CAO Xumin1,3, GAO Yubin1,3, ZHAO Jianmei1,3, HAO Xiaojing4, ZHAO Ge1,3(
), WANG Junwei1,3(
)
Received:
2024-12-23
Revised:
2025-05-19
Online:
2025-07-05
Published:
2025-07-10
GU Pengkun, QIN Lide, TIAN Tongxu, XIANG Wenjun, CAO Xumin, GAO Yubin, ZHAO Jianmei, HAO Xiaojing, ZHAO Ge, WANG Junwei. Research on Attenuation Dynamics of Common Antibiotic Resistance Genes in Agricultural Soils During Poultry Manure Return Experiment[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2025, 41(19): 95-102.
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URL: https://www.casb.org.cn/EN/10.11924/j.issn.1000-6850.casb2024-0804
抗菌药 | 目的基因 | 引物序列(5'→3') | 退火温度/℃ | 产物大小/bp | 参考文献 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
β-内酰胺类 | blaNDM | CTGAGCACCGCATTAGCCG | 59 | 214 | [ | ||||||
CGCCATCCCTGACG-ATCAAA | |||||||||||
blaTEM | ATAAAATTCTTGAAGACGAAA | 48 | 1086 | [ | |||||||
GACACTTACCAATGCTTAATC | |||||||||||
blaCTX-M | ACGCTGTTGTTAGGAAGTG | 58 | 759 | [ | |||||||
TTGAGGCTGGGTGAAGT | |||||||||||
四环素类 | tetA | GCGCGATCTGGTTCACTCG | 61 | 164 | [ | ||||||
AGTCGACAGYRGCGCCGGC | |||||||||||
tetM | ACAGAAAGCTTATTATATAAC | 50 | 171 | [ | |||||||
TGGCGTGTCTATGATGTTCAC | |||||||||||
磺胺类 | sul1 | CGCACCGGAAACATCGCTGCAC | 55.9 | 163 | [ | ||||||
TGAAGTTCCGCCGCAAGGCTCG | |||||||||||
sul2 | TCCGGTGGAGGCCGGTATCTGG | 55.9 | 191 | [ | |||||||
CGGGAATGCCATCTGCCTTGAG | |||||||||||
sul3 | TCCGTTCAGCGAATTGGTGCAG | 60.8 | 128 | [ | |||||||
TTCGTTCACGCCTTACACCAGC | |||||||||||
氯霉素类 | fexA | GTACTTGTAGGTGCAATTACGGCTGA | 58 | 1272 | [ | ||||||
CGCATCTGAGTAGGACATAGCGTC | |||||||||||
cfr | GGTGAAACTGTTGTGGAGAT | 58 | 722 | [ | |||||||
AGTTTCCGTAACTGTCGTTT | |||||||||||
floR | GTCGAGAAATCCCATGAGTTCA | 58 | 1645 | [ | |||||||
CAGACAGGATACCGACATTCAC | |||||||||||
大环内酯类 | ermA | TCTAAAAAGCATGTAAAAGAA | 48 | 732 | [ | ||||||
CTTCGATAGTTTATTAATATTAGT | |||||||||||
ermB | GAAAAAGTACTCAACCAAATA | 50 | 639 | [ | |||||||
AGTAACGGTACTTAAATTGTTTAC | |||||||||||
氨基糖苷类 | aadA | GGTTATCGCCGAAGTATCAACTC | 56 | 151 | [ | ||||||
CACCGTAACCAGCAAATCAATATC |
抗菌药 | 目的基因 | 引物序列(5'→3') | 退火温度/℃ | 产物大小/bp | 参考文献 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
β-内酰胺类 | blaNDM | CTGAGCACCGCATTAGCCG | 59 | 214 | [ | ||||||
CGCCATCCCTGACG-ATCAAA | |||||||||||
blaTEM | ATAAAATTCTTGAAGACGAAA | 48 | 1086 | [ | |||||||
GACACTTACCAATGCTTAATC | |||||||||||
blaCTX-M | ACGCTGTTGTTAGGAAGTG | 58 | 759 | [ | |||||||
TTGAGGCTGGGTGAAGT | |||||||||||
四环素类 | tetA | GCGCGATCTGGTTCACTCG | 61 | 164 | [ | ||||||
AGTCGACAGYRGCGCCGGC | |||||||||||
tetM | ACAGAAAGCTTATTATATAAC | 50 | 171 | [ | |||||||
TGGCGTGTCTATGATGTTCAC | |||||||||||
磺胺类 | sul1 | CGCACCGGAAACATCGCTGCAC | 55.9 | 163 | [ | ||||||
TGAAGTTCCGCCGCAAGGCTCG | |||||||||||
sul2 | TCCGGTGGAGGCCGGTATCTGG | 55.9 | 191 | [ | |||||||
CGGGAATGCCATCTGCCTTGAG | |||||||||||
sul3 | TCCGTTCAGCGAATTGGTGCAG | 60.8 | 128 | [ | |||||||
TTCGTTCACGCCTTACACCAGC | |||||||||||
氯霉素类 | fexA | GTACTTGTAGGTGCAATTACGGCTGA | 58 | 1272 | [ | ||||||
CGCATCTGAGTAGGACATAGCGTC | |||||||||||
cfr | GGTGAAACTGTTGTGGAGAT | 58 | 722 | [ | |||||||
AGTTTCCGTAACTGTCGTTT | |||||||||||
floR | GTCGAGAAATCCCATGAGTTCA | 58 | 1645 | [ | |||||||
CAGACAGGATACCGACATTCAC | |||||||||||
大环内酯类 | ermA | TCTAAAAAGCATGTAAAAGAA | 48 | 732 | [ | ||||||
CTTCGATAGTTTATTAATATTAGT | |||||||||||
ermB | GAAAAAGTACTCAACCAAATA | 50 | 639 | [ | |||||||
AGTAACGGTACTTAAATTGTTTAC | |||||||||||
氨基糖苷类 | aadA | GGTTATCGCCGAAGTATCAACTC | 56 | 151 | [ | ||||||
CACCGTAACCAGCAAATCAATATC |
耐药基因 | 基底 | 施用有机肥 | 施用鲜鸡粪 | |||||||||
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样品 | 试验前 | 样品 | 初期 | 中期 | 后期 | 样品 | 初期 | 中期 | 后期 | |||
blaNDM、tetM、sul1、sul2、sul3、aadA | 基底土 | 6/6 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | ||
低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||||
有机肥 | 6/6 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
鲜鸡粪 | 6/6 | 高剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 高剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 |
耐药基因 | 基底 | 施用有机肥 | 施用鲜鸡粪 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
样品 | 试验前 | 样品 | 初期 | 中期 | 后期 | 样品 | 初期 | 中期 | 后期 | |||
blaNDM、tetM、sul1、sul2、sul3、aadA | 基底土 | 6/6 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | ||
低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||||
有机肥 | 6/6 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
鲜鸡粪 | 6/6 | 高剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 高剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 |
基因 | 基底 | 施用有机肥 | 施用鲜鸡粪 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
样品 | 试验前 | 样品 | 初期 | 中期 | 后期 | 样品 | 初期 | 中期 | 后期 | |||
fexA | 基底土 | 0/6 | 对照土 | 0/3 | 0/3 | 0/3 | 对照土 | 0/3 | 0/3 | 0/3 | ||
低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 低剂量 | 3/3 | 2/3 | 2/3 | |||||
有机肥 | 6/6 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 2/3 | 中剂量 | 3/3 | 2/3 | 2/3 | |||
鲜鸡粪 | 6/6 | 高剂量 | 2/3 | 1/3 | 0/3 | 高剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
cfr | 基底土 | 0/6 | 对照土 | 0/3 | 0/3 | 0/3 | 对照土 | 0/3 | 0/3 | 0/3 | ||
低剂量 | 0/3 | 0/3 | 0/3 | 低剂量 | 2/3 | 0/3 | 0/3 | |||||
有机肥 | 0/6 | 中剂量 | 0/3 | 0/3 | 0/3 | 中剂量 | 3/3 | 0/3 | 0/3 | |||
鲜鸡粪 | 6/6 | 高剂量 | 0/3 | 0/3 | 0/3 | 高剂量 | 0/3 | 0/3 | 0/3 |
基因 | 基底 | 施用有机肥 | 施用鲜鸡粪 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
样品 | 试验前 | 样品 | 初期 | 中期 | 后期 | 样品 | 初期 | 中期 | 后期 | |||
fexA | 基底土 | 0/6 | 对照土 | 0/3 | 0/3 | 0/3 | 对照土 | 0/3 | 0/3 | 0/3 | ||
低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 低剂量 | 3/3 | 2/3 | 2/3 | |||||
有机肥 | 6/6 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 2/3 | 中剂量 | 3/3 | 2/3 | 2/3 | |||
鲜鸡粪 | 6/6 | 高剂量 | 2/3 | 1/3 | 0/3 | 高剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
cfr | 基底土 | 0/6 | 对照土 | 0/3 | 0/3 | 0/3 | 对照土 | 0/3 | 0/3 | 0/3 | ||
低剂量 | 0/3 | 0/3 | 0/3 | 低剂量 | 2/3 | 0/3 | 0/3 | |||||
有机肥 | 0/6 | 中剂量 | 0/3 | 0/3 | 0/3 | 中剂量 | 3/3 | 0/3 | 0/3 | |||
鲜鸡粪 | 6/6 | 高剂量 | 0/3 | 0/3 | 0/3 | 高剂量 | 0/3 | 0/3 | 0/3 |
基因 | 基底 | 施用有机肥 | 施用鲜鸡粪 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
样品 | 试验前 | 样品 | 初期 | 中期 | 后期 | 样品 | 初期 | 中期 | 后期 | |||
blaTEM | 基底土 | 6/6 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | ||
低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||||
有机肥 | 0/6 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 2/3 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
鲜鸡粪 | 0/6 | 高剂量 | 2/3 | 1/3 | 0/3 | 高剂量 | 3/3 | 3/3 | 2/3 | |||
blaCTX-M | 基底土 | 6/6 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | ||
低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||||
有机肥 | 0/6 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
鲜鸡粪 | 6/6 | 高剂量 | 2/3 | 1/3 | 1/3 | 高剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 |
基因 | 基底 | 施用有机肥 | 施用鲜鸡粪 | |||||||||
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样品 | 试验前 | 样品 | 初期 | 中期 | 后期 | 样品 | 初期 | 中期 | 后期 | |||
blaTEM | 基底土 | 6/6 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | ||
低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||||
有机肥 | 0/6 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 2/3 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
鲜鸡粪 | 0/6 | 高剂量 | 2/3 | 1/3 | 0/3 | 高剂量 | 3/3 | 3/3 | 2/3 | |||
blaCTX-M | 基底土 | 6/6 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | ||
低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||||
有机肥 | 0/6 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
鲜鸡粪 | 6/6 | 高剂量 | 2/3 | 1/3 | 1/3 | 高剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 |
基因 | 基底 | 施用有机肥 | 施用鲜鸡粪 | |||||||||
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样品 | 试验前 | 样品 | 初期 | 中期 | 后期 | 样品 | 初期 | 中期 | 后期 | |||
ermA | 基底土 | 6/6 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | ||
低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||||
有机肥 | 6/6 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
鲜鸡粪 | 6/6 | 高剂量 | 3/3 | 2/3 | 1/3 | 高剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
ermB | 基底土 | 6/6 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | ||
低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||||
有机肥 | 6/6 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
鲜鸡粪 | 6/6 | 高剂量 | 2/3 | 2/3 | 1/3 | 高剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
floR | 基底土 | 6/6 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | ||
低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||||
有机肥 | 6/6 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 2/3 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
鲜鸡粪 | 6/6 | 高剂量 | 2/3 | 1/3 | 0/3 | 高剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 |
基因 | 基底 | 施用有机肥 | 施用鲜鸡粪 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
样品 | 试验前 | 样品 | 初期 | 中期 | 后期 | 样品 | 初期 | 中期 | 后期 | |||
ermA | 基底土 | 6/6 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | ||
低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||||
有机肥 | 6/6 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
鲜鸡粪 | 6/6 | 高剂量 | 3/3 | 2/3 | 1/3 | 高剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
ermB | 基底土 | 6/6 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | ||
低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||||
有机肥 | 6/6 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
鲜鸡粪 | 6/6 | 高剂量 | 2/3 | 2/3 | 1/3 | 高剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
floR | 基底土 | 6/6 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 对照土 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | ||
低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | 低剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||||
有机肥 | 6/6 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 2/3 | 中剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 | |||
鲜鸡粪 | 6/6 | 高剂量 | 2/3 | 1/3 | 0/3 | 高剂量 | 3/3 | 3/3 | 3/3 |
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