Research Status of Soil Microbial Metagenomics: Based on Citespace Bibliometric Analysis

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb2020-0811

Abstract

Abstract:

This research used China National Knowledge Network (CNKI) and Web of Science database from 2005 to 2020 as the document source, and bibliometric method was used to analyze the current status of soil microbial metagenomics research field. The results show that the studies on soil microbial metagenomics conducted by Chinese and foreign scholars using high-throughput technology increase continuously. The research objects are mainly about bacteria and fungi. The research habitats involve rhizosphere, sediment, and etc. There is close cooperation between research institutions and authors of English publications, while the cooperation between institutions and authors of Chinese publications is mainly centered on the Chinese Academy of Sciences system. In terms of publication quality, the citation rate of the literature published by American scholars is the highest, while the citation rate of literature published by Chinese scholars is relatively low. Based on the results of literature analysis, we suggest that the future high-throughput sequencing-based soil microbial metagenomics research should focus on interdisciplinary study, further strengthen cooperation among institutions and researchers, and use innovative thinking to comprehensively analyze soil microbial at different levels such as gene and function level, thus deeply exploring the ecological functions of soil microorganisms and providing services for the sustainable development of the ecosystem.

Key words: soil microorganism, metagenomic, bibliometric analysis, CNKI, Web of Science

CLC Number:

Q938.1

Li Jingchao, She Rong, Yang Xiaoyan. Research Status of Soil Microbial Metagenomics: Based on Citespace Bibliometric Analysis[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2021, 37(28): 142-152.

Figures/Tables 16

References 37

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排名	国家	发文量/篇	WOS发文占比/%	被引频次总计	每项平均引用次数	H指数
1	USA	647	30.72	34077	52.59	83
2	China	406	19.28	8180	20.15	43
3	India	187	8.88	1696	9.07	21
4	Germany	173	8.21	10286	59.46	46
5	France	122	5.79	4730	38.77	35
6	Brazil	121	5.75	2298	18.84	26
7	Canada	120	5.70	2167	18.06	28
8	Australia	102	4.84	3028	29.69	26
9	England	100	4.75	2499	24.99	24
10	Korea	96	4.56	1998	20.81	24

排名	国家	发文量/篇	WOS发文占比/%	被引频次总计	每项平均引用次数	H指数
1	USA	647	30.72	34077	52.59	83
2	China	406	19.28	8180	20.15	43
3	India	187	8.88	1696	9.07	21
4	Germany	173	8.21	10286	59.46	46
5	France	122	5.79	4730	38.77	35
6	Brazil	121	5.75	2298	18.84	26
7	Canada	120	5.70	2167	18.06	28
8	Australia	102	4.84	3028	29.69	26
9	England	100	4.75	2499	24.99	24
10	Korea	96	4.56	1998	20.81	24

排名	机构	国家	发文量/篇	发文量占比/%
1	Chinese Acad Sci（中国科学院）	中国	119	5.88
2	Univ Calif Berkeley（加利福尼亚大学伯克利分校）	美国	51	2.52
3	Tsinghua Univ（清华大学）	中国	43	2.13
4	Univ Sao Paulo（俄克拉荷马大学）	美国	42	2.08
5	Univ Sao Paulo（圣保罗大学）	巴西	38	1.88
6	Michigan State Univ（密西根州立大学）	美国	38	1.88
7	Lawrence Berkeley Natl Lab（劳伦斯伯克利国家实验室）	美国	31	1.53
8	Univ Chinese Acad Sci（中国科学院大学）	中国	30	1.48
9	Zhejiang Univ（浙江大学）	中国	29	1.43
10	Oak Ridge Natl Lab（美国橡树岭国家实验室）	美国	26	1.29

排名	机构	国家	发文量/篇	发文量占比/%
1	Chinese Acad Sci（中国科学院）	中国	119	5.88
2	Univ Calif Berkeley（加利福尼亚大学伯克利分校）	美国	51	2.52
3	Tsinghua Univ（清华大学）	中国	43	2.13
4	Univ Sao Paulo（俄克拉荷马大学）	美国	42	2.08
5	Univ Sao Paulo（圣保罗大学）	巴西	38	1.88
6	Michigan State Univ（密西根州立大学）	美国	38	1.88
7	Lawrence Berkeley Natl Lab（劳伦斯伯克利国家实验室）	美国	31	1.53
8	Univ Chinese Acad Sci（中国科学院大学）	中国	30	1.48
9	Zhejiang Univ（浙江大学）	中国	29	1.43
10	Oak Ridge Natl Lab（美国橡树岭国家实验室）	美国	26	1.29

排名	机构	发文量/篇	发文量占比/%
1	中国科学院大学	64	8.51
2	中国科学院南京土壤研究所	39	5.19
3	宁夏大学农学院	38	5.05
4	中国科学院生态环境研究中心	24	3.19
5	中国科学院沈阳应用生态研究所	18	2.39
6	中国矿业大学环境与测绘学院	16	2.13
7	中国农业科学院农业环境与可持续发展研究所	16	2.13
8	上海美吉生物医药科技有限公司	15	2.00
9	中国科学院东北地理与农业生态研究所	15	2.00
10	中国矿业大学低碳能源研究院	14	1.89