中国农学通报 ›› 2025, Vol. 41 ›› Issue (1): 33-41.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.casb2023-0893
刘佳1(), 黄大荣2, 尧美英3, 刘硕4, 张玉萍4, 张国薇1(
)
收稿日期:
2023-12-26
修回日期:
2024-11-06
出版日期:
2025-01-01
发布日期:
2025-01-01
通讯作者:
作者简介:
刘佳,女,1983年出生,重庆人,副研究员,博士研究生,研究方向:李、杏新品种选育及高效栽培技术。通信地址:610066 四川省成都市锦江区静居寺路20号 四川省农业科学院园艺研究所,Tel:028-84511911,E-mail:672497068@qq.com。
基金资助:
LIU Jia1(), HUANG Darong2, YAO Meiying3, LIU Shuo4, ZHANG Yuping4, ZHANG Guowei1(
)
Received:
2023-12-26
Revised:
2024-11-06
Published:
2025-01-01
Online:
2025-01-01
摘要:
本研究探讨杏树发芽过程中对低温积累的需求,分析全球变暖导致的暖冬现象对杏产量的影响。以中国南方优质杏品种‘海棠红’及其芽变变种‘早艳’为研究对象,通过4℃处理550 h的转录组学分析,鉴定出3124个差异表达基因(DEGs),其中多与植物激素和蛋白质去磷酸化有关。通过观察低温处理下2个品种的枝条颜色发现,对低温需求量越低,品种耐寒性越强。研究表明,‘早艳’相较于‘海棠红’具有更低的低温需求,2个品种对低温需求量的差异可能与植物激素水平、转录后修饰有关。同时,2个品种表现出的可变剪切差异也可能与它们需冷量之间的差异有关。研究结果可为缓解气候变暖对杏产量的影响提供参考。
刘佳, 黄大荣, 尧美英, 刘硕, 张玉萍, 张国薇. 2个杏栽培品种需冷量差异的分子机制探索[J]. 中国农学通报, 2025, 41(1): 33-41.
LIU Jia, HUANG Darong, YAO Meiying, LIU Shuo, ZHANG Yuping, ZHANG Guowei. Investigation of Molecular Mechanism of Different Chilling Requirements Between Two Apricot Cultivars[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2025, 41(1): 33-41.
目 | 科 | 属 | 种 | NCBI号 |
---|---|---|---|---|
十字花目(Brassicales) | 十字花科(Brassicaceae) | 拟南芥属(Arabidopsis) | 拟南芥(A. thaliana) | GCF_000001735.4 |
蔷薇目(Rosales) | 蔷薇科(Rosaceae) | 蔷薇属(Rosa) | 月季(R. chinensis) | GCF_002994745.2 |
蔷薇目(Rosales) | 蔷薇科(Rosaceae) | 苹果属(Malus) | 苹果(M. domestica) | GCF_002114115.1 |
蔷薇目(Rosales) | 蔷薇科(Rosaceae) | 李属(Prunus) | 甜樱桃(P. avium) | GCF_002207925.1 |
蔷薇目(Rosales) | 蔷薇科(Rosaceae) | 李属(Prunus) | 梅花(P. mume) | GCF_000346735.1 |
蔷薇目(Rosales) | 蔷薇科(Rosaceae) | 李属(Prunus) | 杏(P. armeniaca) | GCF_000002035.6 |
蔷薇目(Rosales) | 蔷薇科(Rosaceae) | 李属(Prunus) | ‘海棠红’ | 试验获取 |
蔷薇目(Rosales) | 蔷薇科(Rosaceae) | 李属(Prunus) | ‘早艳’ | 试验获取 |
目 | 科 | 属 | 种 | NCBI号 |
---|---|---|---|---|
十字花目(Brassicales) | 十字花科(Brassicaceae) | 拟南芥属(Arabidopsis) | 拟南芥(A. thaliana) | GCF_000001735.4 |
蔷薇目(Rosales) | 蔷薇科(Rosaceae) | 蔷薇属(Rosa) | 月季(R. chinensis) | GCF_002994745.2 |
蔷薇目(Rosales) | 蔷薇科(Rosaceae) | 苹果属(Malus) | 苹果(M. domestica) | GCF_002114115.1 |
蔷薇目(Rosales) | 蔷薇科(Rosaceae) | 李属(Prunus) | 甜樱桃(P. avium) | GCF_002207925.1 |
蔷薇目(Rosales) | 蔷薇科(Rosaceae) | 李属(Prunus) | 梅花(P. mume) | GCF_000346735.1 |
蔷薇目(Rosales) | 蔷薇科(Rosaceae) | 李属(Prunus) | 杏(P. armeniaca) | GCF_000002035.6 |
蔷薇目(Rosales) | 蔷薇科(Rosaceae) | 李属(Prunus) | ‘海棠红’ | 试验获取 |
蔷薇目(Rosales) | 蔷薇科(Rosaceae) | 李属(Prunus) | ‘早艳’ | 试验获取 |
品种 | 450 h | 500 h | 55 h | 600 h | 650 h | 700 h | 750 h | 800 h | 850 h | 900 h | 950 h | 1000 h |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
海棠红 | 16.3 | 28.4 | 36.5 | 52.1 | 61.8 | 72.4 | 66.2 | 79 | 79.8 | 74.6 | 78.3 | 62.1 |
早艳 | 20.4 | 40.1 | 55.7 | 71.2 | 68.1 | 79.5 | 70.3 | 83.2 | 85.6 | 87.1 | 90.1 | 88.4 |
品种 | 450 h | 500 h | 55 h | 600 h | 650 h | 700 h | 750 h | 800 h | 850 h | 900 h | 950 h | 1000 h |
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海棠红 | 16.3 | 28.4 | 36.5 | 52.1 | 61.8 | 72.4 | 66.2 | 79 | 79.8 | 74.6 | 78.3 | 62.1 |
早艳 | 20.4 | 40.1 | 55.7 | 71.2 | 68.1 | 79.5 | 70.3 | 83.2 | 85.6 | 87.1 | 90.1 | 88.4 |
样本 | 原始数据 | 高质量序列 | 高质量序列比值/% | 高质量序列Q20/% | 高质量序列Q30/% | GC含量/% |
---|---|---|---|---|---|---|
CK-1 | 40648572 | 40287032 | 99.11 | 97.22 | 92.91 | 46.55 |
CK-2 | 38173746 | 37808236 | 99.04 | 97.17 | 92.77 | 46.95 |
CK-3 | 41197938 | 40877864 | 99.22 | 97.18 | 92.81 | 46.88 |
CT-1 | 41419916 | 41091104 | 99.21 | 97.36 | 93.2 | 45.71 |
CT-2 | 40640516 | 40255906 | 99.05 | 97.19 | 92.78 | 45.58 |
CT-3 | 40091644 | 39681756 | 98.98 | 97.47 | 93.34 | 46.08 |
样本 | 原始数据 | 高质量序列 | 高质量序列比值/% | 高质量序列Q20/% | 高质量序列Q30/% | GC含量/% |
---|---|---|---|---|---|---|
CK-1 | 40648572 | 40287032 | 99.11 | 97.22 | 92.91 | 46.55 |
CK-2 | 38173746 | 37808236 | 99.04 | 97.17 | 92.77 | 46.95 |
CK-3 | 41197938 | 40877864 | 99.22 | 97.18 | 92.81 | 46.88 |
CT-1 | 41419916 | 41091104 | 99.21 | 97.36 | 93.2 | 45.71 |
CT-2 | 40640516 | 40255906 | 99.05 | 97.19 | 92.78 | 45.58 |
CT-3 | 40091644 | 39681756 | 98.98 | 97.47 | 93.34 | 46.08 |
样本 | 高质量序列 | 匹配序列 | 特异匹配序列 | 未匹配序列 | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
序列数 | 百分比/% | 序列数 | 百分比/% | 序列数 | 百分比/% | ||||
CK-1 | 40287032 | 37335146 | 92.67 | 35405770 | 87.88 | 2951886 | 7.33 | ||
CK-2 | 37808236 | 34819110 | 92.09 | 33131620 | 87.63 | 2989126 | 7.91 | ||
CK-3 | 40877864 | 37609952 | 92.01 | 35819288 | 87.63 | 3267912 | 7.99 | ||
CT-1 | 41091104 | 39424324 | 95.94 | 37714540 | 91.78 | 1666780 | 4.06 | ||
CT-2 | 40255906 | 37564490 | 93.31 | 35904926 | 89.19 | 2691416 | 6.69 | ||
CT-3 | 39681756 | 37504956 | 94.51 | 35719604 | 90.02 | 2176800 | 5.49 |
样本 | 高质量序列 | 匹配序列 | 特异匹配序列 | 未匹配序列 | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
序列数 | 百分比/% | 序列数 | 百分比/% | 序列数 | 百分比/% | ||||
CK-1 | 40287032 | 37335146 | 92.67 | 35405770 | 87.88 | 2951886 | 7.33 | ||
CK-2 | 37808236 | 34819110 | 92.09 | 33131620 | 87.63 | 2989126 | 7.91 | ||
CK-3 | 40877864 | 37609952 | 92.01 | 35819288 | 87.63 | 3267912 | 7.99 | ||
CT-1 | 41091104 | 39424324 | 95.94 | 37714540 | 91.78 | 1666780 | 4.06 | ||
CT-2 | 40255906 | 37564490 | 93.31 | 35904926 | 89.19 | 2691416 | 6.69 | ||
CT-3 | 39681756 | 37504956 | 94.51 | 35719604 | 90.02 | 2176800 | 5.49 |
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