本研究旨在探究一株具拮抗活性的生防菌CY-1对稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)的生长抑制机制、基因组特征及其系统分类地位。采用不同浓度和温度处理的CY-1发酵液,对稻瘟病菌进行抑菌活性测定,评估其对稻瘟病菌丝生长及干重的抑制影响;同时,通过全基因组测序对CY-1进行物种鉴定及功能基因分析。结果表明,CY-1发酵液稀释20倍时,对稻瘟病菌菌丝生长的抑制效率达100.00%;而在稀释100倍时,对菌丝干重的抑制率最高,为87.89%。经过不同温度处理的生防菌CY-1发酵液的抑制率显著低于未经温度处理的抑制率;基因组分析显示,CY-1中富含多种与次生代谢产物合成相关的基因簇,推测其可能通过分泌抗生素类次生代谢产物发挥抑菌作用;比较基因组比对结果表明,该菌株为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)。综上所述,菌株CY-1具备显著的生物拮抗潜力,可作为防治稻瘟病的生防资源,为水稻病害绿色防控提供了理论依据与材料支撑。
DUF247基因家族在植物生长发育和逆境响应中发挥重要作用,本研究为揭示穿心莲ApDUF247基因家族生物学功能和在胁迫中的响应机制。基于穿心莲全基因组数据,通过生物信息学方法鉴定ApDUF247基因家族成员,系统分析其理化性质、染色体定位、进化关系、基因结构、顺式作用元件分布、组织与胁迫响应表达模式、蛋白互作关系和ApDUF247与穿心莲内酯生物合成的表达相关性。结果表明,穿心莲中共有12个ApDUF247s不均等地分布于8条染色体上,其结构和功能具有多样性。穿心莲与板蓝、芝麻、拟南芥之间各有11、7、1对共线性DUF247s基因。ApDUF247s启动子区域富集激素响应、光响应和转录因子结合元件。ApDUF247s具有组织表达特异性,在不同胁迫处理下均呈现不同表达模式。ApDUF247_8与5个丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(STK)蛋白互作,ApDUF247_3与5个过氧化物酶体相关蛋白(Pex)和1个E3泛素化连接酶(E3s)蛋白互作,ApDUF247_6、ApDUF247_9和ApDUF247_12与穿心莲内酯生物合成通路基因具有高度表达相关性(Cor>0.8),预测其为穿心莲内酯生物合成候选调控基因。本研究为初步解析穿心莲DUF247基因响应非生物胁迫下的生物学功能和参与穿心莲内酯生物合成调控机制奠定分析基础。
针对菘蓝种质鉴别缺乏有效分子标记,现有方法难以区分种内栽培类型的问题,为开发适用于菘蓝种质鉴别及遗传多样性分析的简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记。基于菘蓝全基因组数据,利用MISA软件筛选SSR位点,通过Primer3.0设计引物,以3份栽培类型菘蓝(18个单株)为材料,验证引物的扩增稳定性、多态性、有效性及品种鉴别能力,计算遗传多样性参数。结果显示:(1)菘蓝基因组共检测到139,852个SSR位点,数目最多的单核苷酸SSR位点约占总数的72.51%,最多的SSR基序A/T,也是总核苷酸SSR基序总重复次数最高的序列,其数目为100,205次,占总重复基序的71.65%;(2)筛选出8对能够稳定扩增出基因且多态性丰富的引物,其中引物SSRSL02可用于本次供试菘蓝种质的鉴别;(3)8对引物的平均期望杂合度(He) 为0.65,Shannon’s信息指数(I)为1.34,多态性信息含量(PIC)的平均值为0.614,表明菘蓝样本具有较高的遗传多样性。综上,本研究开发的8对SSR分子标记可用于菘蓝种质资源的鉴定、遗传多样性分析和品种选育,未来可扩大菘蓝种质样本量,结合表型与有效成分含量,构建指纹图谱,为菘蓝种质资源精准评价提供更全面的技术支撑。
富含甘氨酸蛋白(Glycine-rich proteins, GRPs)是一类含高比例甘氨酸(20%~70%)的蛋白质家族,广泛存在于原核与真核生物中,是植物应对非生物胁迫(高盐、干旱、高低温等)的重要调控因子,其通过RNA结合、蛋白互作等方式调控植物生长发育与抗逆响应,为明确其抗逆功能与应用潜力。本文综述了植物GRPs的结构特征、分类体系、生长发育功能,重点解析其在低温、高温、盐、干旱等非生物胁迫下的响应机制与调控路径。结果显示:(1)结构上,GRPs均含GR结构域,不同亚类还包含RNA识别基序(RRM)、冷休克结构域(CSD)、CCHC锌指等特有结构域;分为5类,其中IV类(GR-RBPs) 分布最丰富且具有RNA 结合功能;(2)功能上,GRPs具有明显的组织特异性,可通过促进细胞伸长、调节气孔开闭等参与植物生长发育;(3)低温胁迫下,Ⅳc亚家族GRPs拟南芥AtGRP2通过RNA伴侣活性增强植物抗冻性。高温胁迫下,水稻OsGRP3/OsGRP162、不结球白菜BcGRP1等受热诱导表达,维持植物耐热性。盐胁迫与渗透胁迫中,二色补血草LbGRP1通过提升抗氧化酶活性增强耐盐性;干旱胁迫下,拟南芥AtGRP2/AtGRP7、水稻OsGRP3等通过调控气孔运动、活性氧(ROS)代谢及木质素合成增强抗旱性。综上可得出,GRPs通过多结构域协同、多路径调控,成为植物响应非生物胁迫的核心因子。未来需结合多组学与遗传学技术,解析GRPs的上游调控网络及多胁迫协同响应机制,为抗逆作物育种提供理论依据与关键靶点。
氮是植物生长发育过程中的关键营养元素之一,其吸收、转运与同化过程受到多种转录因子的精确调控。在bZIP转录因子家族中,TGACG基序结合因子(TGA)被证实对植物氮代谢具有核心调控功能。为明确其分子调控路径,本文系统综述了TGA转录因子的分子特征,重点阐述其在植物硝酸盐吸收、根系发育调控、氮同化过程中的核心功能,解析其通过水杨酸(SA)、茉莉酸(JA)/乙烯(ET)、脱落酸(ABA)激素信号通路及氧化还原修饰参与氮素代谢的分子机制。结果显示:(1)TGA转录因子属于bZIP家族D亚科,分5个亚族,在拟南芥、水稻等多种植物中高度保守;(2)通过激活NRT家族基因表达、调控根系发育,正向促进氮吸收与转运,且与NLP7(NIN-like protein 7)等因子形成调控网络;(3)通过激素信号互作与氧化还原修饰,响应低氮等胁迫,维持氮代谢稳态。综上,TGA转录因子是植物氮代谢调控网络的核心节点,通过多途径协同调控氮吸收、转运与同化。未来研究需结合多组学与基因编辑技术,解析TGA器官特异性功能、互作网络及物种差异,为作物氮高效利用的遗传改良提供理论基础与育种策略。
种子休眠是植物适应环境的核心生物学特性,对种群繁衍、种质资源保护及农林生产具有关键意义。然而其休眠与解除休眠的调控机制复杂多样,现有研究往往仅进行常规的生理生化分析,缺乏系统、全面的深入探讨,而组学技术为解析该过程提供了精准工具。为全面梳理种子休眠与解除休眠的分子机制研究进展,本文系统综述了转录组学、蛋白质组学和代谢组学这3种代表性组学技术在该领域的应用与代表性成果。转录组学可精准挖掘休眠调控关键基因(如DOG1、激素信号通路基因)及非编码RNA,揭示基因表达的时空特异性;蛋白质组学能鉴定休眠转换期的差异丰度蛋白,阐明激素互作、ROS调控及能量代谢的协同作用;代谢组学可定位休眠解除的关键代谢物(如蔗糖、脯氨酸、溶血磷脂),构建“基因-蛋白-代谢物”的关联网络。研究同时指出当前研究存在多组学数据整合不足、物种普适性有限、成果转化不足等问题。据此指出,需强化跨组学数据关联分析、拓展野生与珍稀物种研究、加速基础研究向育种实践转化,为种子休眠机制的全面解析及农业生产应用提供理论支撑。
本研究旨在阐明植物萜类合成酶(terpene synthase,TPS)在萜类化合物生物合成中的关键作用及其复杂调控机制,并探讨其多样化的生物学特性与广阔的应用前景。基于现有文献和研究成果,采用系统综述与综合分析方法,从功能分类、进化历程、结构催化特性及多层次调控(DNA、转录、转录后)维度分析TPS的作用机理与环境响应规律。TPS通过多样化的结构域催化形成种类繁多的萜类骨架,其过程具有高度复杂性。TPS的活性受精细的多层级调控;转录调控受多种转录因子控制;转录后水平调控则包括mRNA稳定性、翻译效率及蛋白质翻译后修饰等;环境因素(如生物/非生物胁迫)可显著影响TPS基因表达及酶活性,进而调控特定萜类产物的合成积累。不同TPS家族成员在进化上呈现发散性,其功能分化与植物适应性及萜类多样性密切相关。对TPS结构与功能关系的深入解析,为理解其底物选择性和产物特异性提供了分子基础。TPS研究为阐明萜类化合物生物合成及调控机制提供了核心理论支撑,极大地推动了其在农业、医药、香料、化妆品及工业领域的创新应用,对促进可持续发展、增进人类健康和提升生活质量具有重要意义。
水稻不仅是中国重要的粮食作物,更是全球30多亿人口的主要食物来源。近几十年来,各种病虫害肆虐、气候变化加剧及其他不利因素对水稻生产及全球粮食安全构成了严重威胁,培育高产抗病水稻品种的需求日益迫切。传统育种方法过程繁琐、效率低下,在此背景下,基因编辑技术已逐渐成为水稻抗病育种领域的研究热点。基因编辑技术历经三代演进:从锌指核酸酶(ZFN)、转录激活样效应因子核酸酶(TALEN)到CRISPR基因编辑系统,并衍生出单碱基编辑和引导编辑系统等技术。本文通过梳理国内外最新研究进展,系统总结了CRISPR-Cas基因编辑技术在水稻稻瘟病、纹枯病、稻曲病、白叶枯病、细菌性条斑病和黑条矮缩病抗性研究中的应用,深入分析其在水稻抗病育种中的应用现状,展望未来发展前景,以期为水稻抗病育种提供新的思路和方法,同时为基因编辑技术的进一步发展提供参考。
高温胁迫已然成为限制植物生长与分布的关键环境因素之一。硒作为动植物生长所必需的微量元素,具备抗氧化、调节生长发育及增强植物抗逆性等多种功能。近年来,硒作为外源物质参与非生物胁迫的响应机制,已成为学术研究的热点领域。本文全面综述了高温胁迫对植物生长、生理生化的影响,以及植物响应高温的生理和分子机制。详细总结了硒在植物体内的吸收转化过程,深入剖析了硒增强植物耐高温性的作用机制。从生理层面而言,外源硒通过维持谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)的高活性,提升植物的抗氧化能力,清除过量的活性氧,维护叶绿体类囊体膜结构的完整性,并借助渗透调节等途径,有效缓解了高温胁迫引发的光合抑制和膜脂过氧化现象。从分子层面来看,硒能够诱导关键耐热基因、抗氧基因以及相关代谢途径的基因表达,以响应高温胁迫。未来有关硒在植物抗逆性方面的研究,应采用多组学联合分析方法,深入挖掘和解析硒的应用价值,旨在为提高植物的抗逆性提供坚实的理论依据。
为筛选参与桂花成花调控的候选基因,本研究以‘日香桂’全基因组为试材,采用生物信息学方法鉴定OfBBX基因家族成员,对其理化性质、系统进化关系、桂花种内及桂花-拟南芥种间共线性关系、组织表达模式进行综合分析,并结合启动子区顺式作用元件预测其功能。结果共鉴定出42个OfBBX基因,其编码蛋白分子量20.54k~53.71 kDa,等电点4.46~8.61,疏水指数-0.904~-0.027。系统进化将OfBBX分为I-V五组(11/7/5/14/7个成员),各组Motif与B-box/CCT结构域高度保守。检测到OfBBX基因发生了串联重复或片段复制事件,与拟南芥存在48对共线BBX基因。其中7个OfBBX基因在花组织中表达量较高,启动子富含光反应型元件;OfBBX19与拟南芥AtBBX1(CONSTANS)同支、共线、同源,其表达量在花器官中显著上调。本研究筛选出OfBBX18/19等7个候选基因,OfBBX19可能是CONSTANS同源基因并介导光周期调控,为桂花花发育机制研究提供分子标记。
为定向改良荧光假单胞菌(Pseudomonads fluorescens) CLW17高效优良促生长特性,为微生物菌肥生产提供优质菌种。本研究以具有解磷、产嗜铁素能力的CLW17野生株为出发菌株,采用常温常压等离子(ARTP)诱变技术进行菌株改良,通过“定性初筛-定量复筛-分子鉴定”三级筛选体系,获得高效促生长突变株并优化诱变条件。结果表明:CLW17菌株的最佳ARTP诱变条件为输出功率100 W,照射距离2 mm,处理时间240 s,此条件下菌株致死率达91.67%,正突变率为11.27%。经NBRIP-BPB平板解磷圈定性筛选(SI值)、钼锑抗比色法解磷定量测定及CAS平板/液体法产嗜铁素能力测定,最终筛选出2株高效优良促生长突变株CLW17-240-2-1和CLW17-240-3-2,其解磷量分别为553.08 mg/L、584.47 mg/L,较野生株(453.77 mg/L)提升21.89%、30.40%;产嗜铁素能力分别为62.52%、72.33%,较野生株(51.55%)提升21.27%、40.29%。16S rDNA分子鉴定证实,2株突变株均为CLW17的遗传突变体,无外源污染。本研究通过ARTP诱变成功实现CLW17菌株“解磷-产嗜铁素”双促生性状的协同提升,为植物根际促生菌(PGPR)的定向育种提供了技术参考,也为南方红豆杉等林木专用微生物菌肥的研发奠定了菌种基础。
为了充分挖掘蟑螂的应用潜力并为生物资源开发提供科学参考,本文从蟑螂种类、起源等总结了蟑螂的生物学特性,分析了蟑螂在环境污染和疾病传播方面的具体情况。系统阐述了蟑螂在医疗领域、环境领域、食品工业等领域的应用。指出了目前对蟑螂的研究和开发还处于早期阶段,尤其对蟑螂肠道菌群的研究相对较少,人类对蟑螂相关应用的接受度也相对较低。并提出今后应优化养殖加工技术,多角度开发应用潜力。此外,量化优化其生物降解性,同时加强理论和应用研究以及环境管理,为蟑螂资源的持续开发奠定了基础。
为探究深地封闭环境中植物生长敏感期的动态变化与适应性调控规律,以本氏烟草(Nicotiana benthamiana)为模型,采用L9(3³)正交试验设计调控光照强度(4000~12000 Lux)、温度(20~30℃)和湿度(60%~80% RH),定量测定株高、叶面积等生长及生理指标,结合主成分分析(PCA)解析环境敏感性特征。结果表明,本氏烟草周期可划分为萌发-快速生长期(1~14 d)、快速生长-稳定期(15~62 d)及稳定-成熟期(63~76 d);PCA分析显示PC1-PC2累计解释58.6%的变异,其中PC1 (44.90%)主要关联光照强度与叶面积,PC2(13.70%)主要关联土壤氧化还原电位(Eh)与温度。植物在生长初期(1~62 d)对环境高度敏感,尤其对光照和温度响应显著,12000 Lux组日均株高增长量达4.82±0.15 mm,较8000 Lux 组提升17.0%;成熟期(63 d后)转向生理调控主导。第63天为环境依赖型生长向生理调控型生长的敏感转折点。优化的种植条件为20℃~25℃、70%~80% RH、8000~12000 Lux,此条件下植株光合-氮代谢耦合效率最优,叶绿素含量较30℃/60% RH/4000 Lux对照组提升28.3%,氮同化能力提升31.5%。本研究揭示了深地密闭环境下植物的阶段性适应机制,为深地植物种植环境调控与深地农业理论构建提供理论参考。
本研究旨在探究外源褪黑素对盐碱胁迫下谷子萌发及幼苗抗氧化生理的影响。以谷子品种‘济谷22’为试验材料,分别采用浓度为0、100、200、300 μmol/L的褪黑素溶液进行浸种处理,测定不同处理在盐碱胁迫条件下的萌发指标。基于萌发试验结果,筛选出褪黑素浸种的最适浓度,并对谷子幼苗进行喷施处理。在苗期,运用100 mmol/L的混合盐碱溶液(NaCl:NaHCO3=4:1)模拟盐碱胁迫环境,测定谷子幼苗的株高、鲜重、干重,以及丙二醛(MDA)、可溶性糖(SS)含量和超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)活性。研究结果显示,盐碱胁迫显著降低了谷子的发芽势、发芽率、发芽指数、根长、芽长、幼苗株高以及地上部物质的积累量,同时提高了SOD、POD、CAT活性以及MDA和SS的含量。施加不同浓度的褪黑素对盐碱胁迫下谷子的萌发和幼苗生长具有一定的缓解作用,其中 200 μmol/L的褪黑素溶液效果最为显著。喷施该最适浓度的褪黑素溶液能够显著提高抗氧化酶(SOD、POD、CAT)的活性以及SS含量,降低MDA含量。综上所述,盐碱胁迫会对谷子的萌发和幼苗生长产生抑制作用,而施加适宜浓度的褪黑素能够有效缓解盐碱胁迫对谷子造成的损伤,增强谷子的耐盐碱性。
本研究旨在提高红曲色素色价,为红曲色素的广泛应用提供技术支持。通过单因素实验结合响应面法(RSM)对红曲霉液体发酵培养基进行优化。首先通过单因素实验筛选出葡萄糖、蛋白胨和磷酸二氢钾为关键影响因素;随后利用Plackett-Burman实验和最陡爬坡实验确定各因素最佳响应区间;最终通过Box-Behnken实验优化得到最优培养基配方:葡萄糖59.3 g/L、蛋白胨30.5 g/L、磷酸二氢钾0.8 g/L、硫酸镁1.0 g/L、硫酸锌0.1 g/L;在此条件下,红曲色素色价最高值为268.49 U/mL,是优化前的3.23倍。研究表明,响应面法可高效优化优化培养基,显著提高红曲色素产量,为其工业化应用提供理论依据。
腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(ADP-glucose pyrophosphorylase,AGPase)是植物淀粉合成途径的限速酶。克隆卷丹百合AGPase同源基因并分析其表达特征,有助于深入了解珠芽生长发育期的淀粉合成规律,为开发利用珠芽作为种子的价值或膳食功能提供依据。本研究运用同源克隆技术,从卷丹百合中成功克隆到一个腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶小亚基编码基因(LlAGPS1),并采用荧光定量PCR技术对LlAGPS1在叶片、珠芽组织部位的表达差异进行分析。研究表明,LlAGPS1基因编码蛋白具有PLN02241、GlgC保守结构域,属于cl33437超级家族蛋白;蛋白序列比对显示,其与其他作物AGPase小亚基序列具有较高同源性。qPCR分析表明,LlAGPS1基因主要在珠芽中表达,其表达量显著高于叶片中表达量。摘花蕾处理能上调叶片中LlAGPS1的表达量,同时该基因在叶片和珠芽中的表达量日变化均呈现下降规律。LlAGPS1基因编码蛋白具有cl33437家族特有的PLN02241、GlgC保守结构域,是编码AGPase蛋白的同源基因,具有明显的组织表达特异性,在珠芽生长发育过程中呈现高表达。本研究结果可为后续研究LlAGPS1基因表达调节技术对卷丹百合珠芽淀粉合成及生长发育的影响,以及开发珠芽价值提供参考。
为准确掌握楚雄州永兴乡境内分布的野生羊肚菌物种和发生规律,推动当地野生羊肚菌资源的长期保护利用与栽培驯化研究,对永兴地区的那软、小庄、观音寺、灰坝、拉姑5个地点进行野生羊肚菌资源调查,结合子实体形态特征,采用分子鉴定技术对选取的5份样本进行了分子鉴定与命名。研究结果表明,永兴地区野生羊肚菌的出菇时间为9月底至10月下旬,多发生在降雨后的1~3 d,生长呈弱碱性(pH 7.13~8.20),生长环境以栎树、桦树为主的阔叶混交林为主,仅基于ITS构建系统发育树表明5份羊肚菌均为黄色羊肚菌类群,但不能将羊肚菌属内所有物种准确区分开,采用多基因谱系一致性发育物种识别法基于ITS+LSU+EF1-α+RPB1+RPB2联合构建系统发育树表明永兴地区分布的羊肚菌为Morchella sp. Mes-15和Morchella sp. Mes-19两个黄色支系物种,为首次报道。