Genomic DNA of Pilose Antler: Comparison of Extraction Methods

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb20191100790

Abstract

Abstract:

The objectives are to establish a stable and efficient method for extracting DNA from pilose antler and meet the needs of DNA barcode identification methods for pilose antler in the future. The genomic DNAs from 8 batches of velvet medicinal materials from 5 manufacturers on the market were extracted by two kinds of kits, modified CTAB method and SDS method. The three factors of sample size, water bath temperature and action time were investigated by referring to 9107 from the General Principles of Pharmacopoeia of the People's Republic of China (Ⅳ, 2015). The results showed that all methods could extract genomic DNAs from pilose antler. TIANamp Genomic DNA Kit got the best extraction, while the modified CTAB method had worse extraction. By methodological study, TIANamp Genomic DNA Kit had the best extraction with the extraction condition of the sample quantity for 70 mg, and the water bath temperature 56℃ for 6 h. TIANamp Genomic DNA Kit screened in this study can use simple and convenient method to extract and obtain excellent concentration and quality DNA, so it can be used for subsequent identification of DNA barcode in the future.

Key words: pilose antler, DNA extraction, SDS, CTAB, kit

CLC Number:

Yang Chonghui, Zhao Daqing, Song Wenbo, Yin Chengcheng, He Huinan, Wang Xiuge, Li Fangyu, Yang Yang, Jing Li, Qi Bin. Genomic DNA of Pilose Antler: Comparison of Extraction Methods[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2020, 36(11): 26-32.

Figures/Tables 14

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编号	市场标签	产地	厂家	生产批号
1	梅花鹿茸粉片	吉林	吉林敖东世航药业股份有限公司	X1710024
2	梅花鹿茸	吉林	安国市东方药城中药材有限公司	170401
3	梅花鹿茸	吉林	安国市东方药城中药材有限公司	170403
4	梅花鹿茸三叉	吉林	安国圣山药业有限公司	170401
5	梅花鹿茸三叉	吉林	陕西医药控股集团派昂中药有限公司	170403
6	梅花鹿茸粉片	吉林	吉林敖东世航药业股份有限公司	X1710025
7	马鹿茸	吉林	河北益生膳中药材有限公司	170401
8	马鹿茸	吉林	河北益生膳中药材有限公司	170402

编号	市场标签	产地	厂家	生产批号
1	梅花鹿茸粉片	吉林	吉林敖东世航药业股份有限公司	X1710024
2	梅花鹿茸	吉林	安国市东方药城中药材有限公司	170401
3	梅花鹿茸	吉林	安国市东方药城中药材有限公司	170403
4	梅花鹿茸三叉	吉林	安国圣山药业有限公司	170401
5	梅花鹿茸三叉	吉林	陕西医药控股集团派昂中药有限公司	170403
6	梅花鹿茸粉片	吉林	吉林敖东世航药业股份有限公司	X1710025
7	马鹿茸	吉林	河北益生膳中药材有限公司	170401
8	马鹿茸	吉林	河北益生膳中药材有限公司	170402

样品编号	Con/(ng/μL)/A₂₆₀/A₂₈₀	样品编号	Con/(ng/μL)/A₂₆₀/A₂₈₀
1	2 219.31/1.94	11	958.15/1.93
2	1 906.17/1.94	12	272.76/1.93
3	540.37/1.91	13	1 540.89/1.94
4	107.81/1.80	14	1 103.42/1.92
5	1 674.00/1.94	15	780.20/1.91
6	1 814.75/1.92	16	1 410.22/1.93
7	2 152.00/1.94	17	2 229.87/1.91
8	2 115.68/1.94	18	1 752.24/1.94
9	884.66/1.92	19	295.62/1.90
10	1 000.62/1.93	20	385.93/1.94

样品编号	Con/(ng/μL)/A₂₆₀/A₂₈₀	样品编号	Con/(ng/μL)/A₂₆₀/A₂₈₀
1	2 219.31/1.94	11	958.15/1.93
2	1 906.17/1.94	12	272.76/1.93
3	540.37/1.91	13	1 540.89/1.94
4	107.81/1.80	14	1 103.42/1.92
5	1 674.00/1.94	15	780.20/1.91
6	1 814.75/1.92	16	1 410.22/1.93
7	2 152.00/1.94	17	2 229.87/1.91
8	2 115.68/1.94	18	1 752.24/1.94
9	884.66/1.92	19	295.62/1.90
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