Chinese Agricultural Science Bulletin ›› 2024, Vol. 40 ›› Issue (2): 61-70.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.casb2023-0087
Previous Articles Next Articles
NI Xia1(), GONG Lin1, CHEN Hua1, SONG Mingjian1, ZHOU Yuzhong1, CHEN Min2(), FU Yeming1, GONG Haohan1, PAN Wenzheng3, ZHANG Mengsheng1, LUO Qipeng3, LI Jianyun3, BAO Hongming3, LI Dewen3, ZHANG Haikun3
Received:
2023-01-19
Revised:
2023-11-02
Online:
2024-01-10
Published:
2024-01-10
NI Xia, GONG Lin, CHEN Hua, SONG Mingjian, ZHOU Yuzhong, CHEN Min, FU Yeming, GONG Haohan, PAN Wenzheng, ZHANG Mengsheng, LUO Qipeng, LI Jianyun, BAO Hongming, LI Dewen, ZHANG Haikun. Analysis of Soil Fungal Diversity in Zhaotong Core Tobacco-growing Area Based on High-throughput Sequencing[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2024, 40(2): 61-70.
Add to citation manager EndNote|Ris|BibTeX
URL: https://www.casb.org.cn/EN/10.11924/j.issn.1000-6850.casb2023-0087
门 | 新烟区(A) | 连作区(B) | 轮作区(E) |
---|---|---|---|
子囊菌门Ascomycota | 75.38 | 81.36 | 73.95 |
被孢霉门Mortierellomycota | 14.06 | 9.48 | 16.05 |
担子菌门Basidiomycota | 7.72 | 6.68 | 6.95 |
壶菌门Chytridiomycota | 0.48 | 0.77 | 0.86 |
毛霉门Mucoromycota | 0.24 | 0.45 | 0.23 |
球囊菌门Glomeromycota | 0.11 | 0.06 | 0.09 |
其他 | 0.11 | 0.03 | 0.04 |
未归类 | 1.90 | 1.16 | 1.84 |
门 | 新烟区(A) | 连作区(B) | 轮作区(E) |
---|---|---|---|
子囊菌门Ascomycota | 75.38 | 81.36 | 73.95 |
被孢霉门Mortierellomycota | 14.06 | 9.48 | 16.05 |
担子菌门Basidiomycota | 7.72 | 6.68 | 6.95 |
壶菌门Chytridiomycota | 0.48 | 0.77 | 0.86 |
毛霉门Mucoromycota | 0.24 | 0.45 | 0.23 |
球囊菌门Glomeromycota | 0.11 | 0.06 | 0.09 |
其他 | 0.11 | 0.03 | 0.04 |
未归类 | 1.90 | 1.16 | 1.84 |
属 | 新烟区(A) | 连作区(B) | 轮作区(E) |
---|---|---|---|
被孢霉属Mortierella | 14.06 | 9.48 | 16.05 |
青霉菌属Penicillium | 9.13 | 9.21 | 7.98 |
拟青霉菌属Purpureocillium | 1.55 | 6.72 | 1.75 |
曲霉菌属Aspergillus | 1.80 | 3.80 | 4.00 |
假裸囊菌属Pseudogymnoascus | 2.55 | 4.11 | 1.33 |
镶刀菌属Fusarium | 1.75 | 2.76 | 3.65 |
腐质霉属Humicola | 2.56 | 1.89 | 2.22 |
壳二胞菌属Ascochyta | 2.55 | 1.36 | 1.29 |
篮状菌属Talaromyces | 1.65 | 1.89 | 0.81 |
柱孢属Cylindrocarpon | 0.51 | 1.47 | 2.15 |
其他 | 28.93 | 27.00 | 29.01 |
未归类 | 32.97 | 30.33 | 29.78 |
属 | 新烟区(A) | 连作区(B) | 轮作区(E) |
---|---|---|---|
被孢霉属Mortierella | 14.06 | 9.48 | 16.05 |
青霉菌属Penicillium | 9.13 | 9.21 | 7.98 |
拟青霉菌属Purpureocillium | 1.55 | 6.72 | 1.75 |
曲霉菌属Aspergillus | 1.80 | 3.80 | 4.00 |
假裸囊菌属Pseudogymnoascus | 2.55 | 4.11 | 1.33 |
镶刀菌属Fusarium | 1.75 | 2.76 | 3.65 |
腐质霉属Humicola | 2.56 | 1.89 | 2.22 |
壳二胞菌属Ascochyta | 2.55 | 1.36 | 1.29 |
篮状菌属Talaromyces | 1.65 | 1.89 | 0.81 |
柱孢属Cylindrocarpon | 0.51 | 1.47 | 2.15 |
其他 | 28.93 | 27.00 | 29.01 |
未归类 | 32.97 | 30.33 | 29.78 |
分类单位 | 新烟区(A) | 连作区(B) | 轮作区(E) |
---|---|---|---|
门 | Neocallimastigomycota | Olpidiomycota | |
纲 | GS13、GS14、Laboulbeniomycetes、 Neocallimastigomycetes | Atractiellomycetes、 Olpidiomycetes、Xylonomycetes | |
目 | GS10、Myriangiales、Neocallimastigales、 Pyxidiophorales、Trapeliales | Boliniales、Microstromatales | Atractiellales、GS34、Olpidiales、 Togniniales、Valsariales |
科 | Astraeaceae、Boletaceae、Clavulinaceae、 Cryptobasidiaceae、Dothioraceae、Elsinoaceae、 Exidiaceae、Halomycetaceae、Hydnangiaceae、 Hymenochaetaceae、Kappamycetaceae、Lentitheciaceae、Massarinaceae、Metschnikowiaceae、Microbotryomycetes_fam_Incertae_sedis、 Neocallimastigaceae、Pleomassariaceae、Russulaceae、Rutstroemiaceae、Schizoparmaceae、Sclerodermataceae、Sebacinaceae、Trapeliaceae、Ustilentylomataceae | Auriculariaceae、Boliniaceae、 Chionosphaeraceae、Crepidotaceae、 Diversisporaceae、Entylomataceae、 Exobasidiaceae、Fomitopsidaceae、 Hyphodermataceae、Microstromatales_fam_Incertae_sedis、 Parmeliaceae、Tilletiariaceae、 Trichomonascaceae | Botryobasidiaceae、Brachybasidiaceae、 Coniophoraceae、Diatrypaceae、 Endogonaceae、Gjaerumiaceae、 Gyrodontaceae、Olpidiaceae、 Pichiaceae、Thermoascaceae、 Togniniaceae、Valsaceae、 Valsariaceae |
属 | Acaromyces、Anthopsis、Apodus、Archaeospora、 Arnium、Astraeus、Bullera、Calloria、 Camptophora、Chrysozyma、Cistella、Clavatospora、 Clavispora、Clavulina、Coniella、Cotylidia、 Cryptosporiopsis、Curvibasidium、Dimorphospora、 Diplodia、Galerina、Goffeauzyma、Gorgomyces、 Helicosporium、Heterochaete、Hymenochaete、 Hyphodiscus、Hypholoma、Kappamyces、Laccaria、 Lactarius、Laetisaria、Magnaporthiopsis、Massarina、 Meliniomyces、Membranomyces、Microbotryozyma、Mycosymbioces、Myxotrichum、Naevala、Neocallimastix、Paranamyces、Paraphaeosphaeria、Peltaster、Peniophora、Perusta、Pleuroascus、Polycephalomyces、Rhexodenticula、Rhinocladiella、Rhizoctonia、Rugosomyces、Russula、Scleroderma、Sebacina、Sordaria、 Sphaceloma、Sporobolomyces、Stomiopeltis、 Trapelia、Trichosporon、Tumularia、 Udeniomyces、Ustilentyloma、Viridispora、 Volvariella、Wickerhamomyces | Acremoniopsis、Actinomucor、Antennariella、 Auricularia、Brachyphoris、Cetrelia、 Crepidotus、Cystobasidiopsis、Engyodontium、 Entyloma、Eupenidiella、Exobasidium、 Hyphoderma、Hypochnicium、Lyophyllum、 Monodictys、Nigrograna、Nodulisporium、 Ovadendron、Phaeoisaria、Pluteus、 Polyschema、Pseudomicrostroma、 Pseudovalsaria、Tilletiaria、 Toxicocladosporium、Trichomonascus、 Tubaria、Tulostoma、 Veronaea | Arxiella、Auxarthronopsis、Bjerkandera、 Botryobasidium、Capnodium、Cheilymenia、 Coniophora、Corallomycetella、Corticium、 Endogone、Flagelloscypha、Gjaerumia、 Gyrodon、Meira、Mrakia、 Myriodontium、Myrmaecium、Nemania、 Neopestalotiopsis、Olpidium、Parasola、 Phaeoacremonium、Phanerochaete、 Pichia、Pleurotheciella、Rhinocladium、 Spissiomyces、Thelephora、 Thermoascus、Tricharina、 Trichophaeopsis、Verrucocladosporium |
分类单位 | 新烟区(A) | 连作区(B) | 轮作区(E) |
---|---|---|---|
门 | Neocallimastigomycota | Olpidiomycota | |
纲 | GS13、GS14、Laboulbeniomycetes、 Neocallimastigomycetes | Atractiellomycetes、 Olpidiomycetes、Xylonomycetes | |
目 | GS10、Myriangiales、Neocallimastigales、 Pyxidiophorales、Trapeliales | Boliniales、Microstromatales | Atractiellales、GS34、Olpidiales、 Togniniales、Valsariales |
科 | Astraeaceae、Boletaceae、Clavulinaceae、 Cryptobasidiaceae、Dothioraceae、Elsinoaceae、 Exidiaceae、Halomycetaceae、Hydnangiaceae、 Hymenochaetaceae、Kappamycetaceae、Lentitheciaceae、Massarinaceae、Metschnikowiaceae、Microbotryomycetes_fam_Incertae_sedis、 Neocallimastigaceae、Pleomassariaceae、Russulaceae、Rutstroemiaceae、Schizoparmaceae、Sclerodermataceae、Sebacinaceae、Trapeliaceae、Ustilentylomataceae | Auriculariaceae、Boliniaceae、 Chionosphaeraceae、Crepidotaceae、 Diversisporaceae、Entylomataceae、 Exobasidiaceae、Fomitopsidaceae、 Hyphodermataceae、Microstromatales_fam_Incertae_sedis、 Parmeliaceae、Tilletiariaceae、 Trichomonascaceae | Botryobasidiaceae、Brachybasidiaceae、 Coniophoraceae、Diatrypaceae、 Endogonaceae、Gjaerumiaceae、 Gyrodontaceae、Olpidiaceae、 Pichiaceae、Thermoascaceae、 Togniniaceae、Valsaceae、 Valsariaceae |
属 | Acaromyces、Anthopsis、Apodus、Archaeospora、 Arnium、Astraeus、Bullera、Calloria、 Camptophora、Chrysozyma、Cistella、Clavatospora、 Clavispora、Clavulina、Coniella、Cotylidia、 Cryptosporiopsis、Curvibasidium、Dimorphospora、 Diplodia、Galerina、Goffeauzyma、Gorgomyces、 Helicosporium、Heterochaete、Hymenochaete、 Hyphodiscus、Hypholoma、Kappamyces、Laccaria、 Lactarius、Laetisaria、Magnaporthiopsis、Massarina、 Meliniomyces、Membranomyces、Microbotryozyma、Mycosymbioces、Myxotrichum、Naevala、Neocallimastix、Paranamyces、Paraphaeosphaeria、Peltaster、Peniophora、Perusta、Pleuroascus、Polycephalomyces、Rhexodenticula、Rhinocladiella、Rhizoctonia、Rugosomyces、Russula、Scleroderma、Sebacina、Sordaria、 Sphaceloma、Sporobolomyces、Stomiopeltis、 Trapelia、Trichosporon、Tumularia、 Udeniomyces、Ustilentyloma、Viridispora、 Volvariella、Wickerhamomyces | Acremoniopsis、Actinomucor、Antennariella、 Auricularia、Brachyphoris、Cetrelia、 Crepidotus、Cystobasidiopsis、Engyodontium、 Entyloma、Eupenidiella、Exobasidium、 Hyphoderma、Hypochnicium、Lyophyllum、 Monodictys、Nigrograna、Nodulisporium、 Ovadendron、Phaeoisaria、Pluteus、 Polyschema、Pseudomicrostroma、 Pseudovalsaria、Tilletiaria、 Toxicocladosporium、Trichomonascus、 Tubaria、Tulostoma、 Veronaea | Arxiella、Auxarthronopsis、Bjerkandera、 Botryobasidium、Capnodium、Cheilymenia、 Coniophora、Corallomycetella、Corticium、 Endogone、Flagelloscypha、Gjaerumia、 Gyrodon、Meira、Mrakia、 Myriodontium、Myrmaecium、Nemania、 Neopestalotiopsis、Olpidium、Parasola、 Phaeoacremonium、Phanerochaete、 Pichia、Pleurotheciella、Rhinocladium、 Spissiomyces、Thelephora、 Thermoascus、Tricharina、 Trichophaeopsis、Verrucocladosporium |
处理 | Sobs 指数 | Chao指数 | ACE指数 | 香浓指数 | 辛普森指数 |
---|---|---|---|---|---|
新烟区(A) | 877.84Aa | 1123.47A | 1131.26A | 5.9879Aa | 0.9361AB |
连作区(B) | 736.38Bc | 948.81C | 954.90C | 5.7760ABb | 0.9430A |
轮作区(E) | 775.49Bb | 1016.61B | 1027.65B | 5.5174Bc | 0.9089B |
处理 | Sobs 指数 | Chao指数 | ACE指数 | 香浓指数 | 辛普森指数 |
---|---|---|---|---|---|
新烟区(A) | 877.84Aa | 1123.47A | 1131.26A | 5.9879Aa | 0.9361AB |
连作区(B) | 736.38Bc | 948.81C | 954.90C | 5.7760ABb | 0.9430A |
轮作区(E) | 775.49Bb | 1016.61B | 1027.65B | 5.5174Bc | 0.9089B |
Trophic | A | B | E |
---|---|---|---|
病理营养型 | 7.50 | 14.17 | 9.50 |
病理—腐生营养型 | 5.61 | 3.90 | 5.17 |
病理—腐生—共生营养型 | 6.76 | 7.70 | 12.22 |
病理—共生营养型 | 2.42 | 2.08 | 2.32 |
腐生营养型 | 10.64 | 15.02 | 10.28 |
腐生—共生营养型 | 16.51 | 10.55 | 17.61 |
共生营养型 | 1.61 | 0.63 | 1.35 |
Unassigned | 48.96 | 45.95 | 41.56 |
Trophic | A | B | E |
---|---|---|---|
病理营养型 | 7.50 | 14.17 | 9.50 |
病理—腐生营养型 | 5.61 | 3.90 | 5.17 |
病理—腐生—共生营养型 | 6.76 | 7.70 | 12.22 |
病理—共生营养型 | 2.42 | 2.08 | 2.32 |
腐生营养型 | 10.64 | 15.02 | 10.28 |
腐生—共生营养型 | 16.51 | 10.55 | 17.61 |
共生营养型 | 1.61 | 0.63 | 1.35 |
Unassigned | 48.96 | 45.95 | 41.56 |
[1] |
穆青, 刘洋, 展彬华, 等. 我国植烟土壤主要问题及其防控措施研究进展[J]. 江苏农业科学, 2018, 46(21):16-20.
|
[2] |
何亦男. 浅谈分子生物学在农田土壤微生物多样性研究中的应用[J]. 种子科技, 2021, 39(14):91-92.
|
[3] |
doi: 10.1080/15226514.2017.1337073 pmid: 28678529 |
[4] |
doi: 10.1016/0038-0717(95)00034-C URL |
[5] |
夏强, 秦冰, 王雅楠, 等. 麦玉秸秆还田对土壤真菌群落结构的影响:面向未来的土壤科学[C]. 2012.
|
[6] |
刘高远, 郭天文, 谭雪莲, 等. 不同栽培方式下马铃薯土壤微生物区系的动态变化[J]. 华中农业大学学报, 2014, 33(4):19-24.
|
[7] |
张艺洁, 邵惠芳, 张珂, 等. 基于高通量测序研究施肥对连作植烟土壤环境及微生物的影响[J]. 中国农业科技导报, 2018, 20(5):16-25.
doi: 10.13304/j.nykjdb.2017.0348 |
[8] |
陈丹梅, 段玉琪, 杨宇虹, 等. 轮作模式对植烟土壤酶活性及真菌群落的影响[J]. 生态学报, 2016, 36(8):2373-2381.
|
[9] |
杨灵朋, 姚晓远, 李倩, 等. 烟草根腐病发生的土壤微生物功能多样性分析[J]. 植物医生, 2020, 33(5): 36-41.
|
[10] |
陈尧, 郑华, 石俊雄, 等. 施用化肥和菜籽粕对烤烟根际微生物的影响[J]. 土壤学报, 2012, 49(1):198-203.
|
[11] |
何川, 刘国顺, 蒋士君. 连作对植烟土壤微生物群落多样性的影响[J]. 江西农业大学学报, 2012, 34(04): 658-663.
|
[12] |
贾志红, 易建华, 苏以荣, 等. 云南玉溪烟区轮作与连作土壤细菌群落多样性比较研究[J]. 应用与环境生物学报, 2011, 17(2):162-169.
|
[13] |
王飞, 徐茜, 陈志厚, 等. 翻压不同绿肥对植烟土壤细菌类群的影响[J]. 江苏农业科学, 2019, 47(11):317-321.
|
[14] |
杨帅, 潘磊, 陈连红, 等. 基于高通量测序的不同轮作方式下烟田土壤细菌群落组成分析[J]. 分子植物育种, 2021, 19(1):343-348.
|
[15] |
齐虹凌, 贺国强, 李恒全, 等. 轮作与连作对烤烟不同生育期根际土壤细菌群落结构的影响[J]. 中国烟草学报, 2015, 21(5):42-48.
|
[16] |
赵辉, 王喜英, 刘国权, 等. 植烟土壤微生物多样性研究进展[J]. 南方农业, 2020, 14(34): 57-61.
|
[17] |
doi: 10.3389/fimmu.2017.00354 pmid: 28424690 |
[18] |
|
[19] |
doi: 10.1038/nmeth.2276 pmid: 23202435 |
[20] |
doi: 10.1038/nmeth.2604 pmid: 23955772 |
[21] |
doi: 10.1186/1471-2105-12-385 |
[22] |
doi: 10.1002/wics.v3.2 URL |
[23] |
doi: 10.1186/1471-2105-12-35 |
[24] |
|
[25] |
|
[26] |
doi: 10.1186/gb-2011-12-6-r60 URL |
[27] |
doi: 10.1038/nmeth.f.303 pmid: 20383131 |
[28] |
doi: 10.1016/j.funeco.2015.06.006 URL |
[1] | GAO Bingying, WANG Ping, WANG Yanchun, DING Xi, ZHANG Jingwei, LIU Shuying. Investigation of Rhizosphere Fungi in Pinus tabuliformis Forests in Beijing ---- Taking Songshan National Nature Reserve as An Example [J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2024, 40(2): 8-15. |
[2] | ZHAO Ajuan, LIU Qiongfeng, ZHOU Shimin, ZHAI Zhengguang, HU Liangliang, DUAN Meizhen, XIE Pengfei, LI Mingde, XIE Yangjun, HE Jiguang, LIANG Qizheng, LIU Youxiong. Effects of Dolomite Powder and Magnesium Oxide Fertilizer on Calcium and Magnesium Nutrient Elements in Tobacco Planting Soil and Tobacco Leaves [J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2024, 40(1): 7-11. |
[3] | MIAO Fan, LIU Xin, LIN Gang, CHEN Yanting, LIU Yanfei, ZHENG Yi. Characteristics Analysis of Phycosphere Bacteria and Algal Bacterial Communities of Shell Conchocelis of Porphyrahaitanensis with White Spot Disease [J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2023, 39(5): 154-164. |
[4] | QIN Helan, LIANG Fang, JIN Yingshan, LI Zijing, ZHANG Hua, HU Xuefan. Transcriptomic Analysis of the Mosaic Leaf Mutant in Heliopsis helianthoides [J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2023, 39(29): 1-7. |
[5] | SHAN Jinfeng, WANG Feifei, WANG Xinhai. Microflora Characteristics of Integrated Rice-Crayfish Farming System in Spring [J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2023, 39(28): 158-164. |
[6] | LIAN Han, HAN Rongrong, YANG Xiaoyu, TANG Xiangyou, ZHANG Xingcui, HU Kaizhi. Effects of Lysimachia christinae Hance—Rice Rotation on Soil Microbial Community Structure [J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2023, 39(24): 84-89. |
[7] | CAI Liqiong, CHEN Rui, YANG Deqiang, ZHAO Changlin. The Rhizosphere Bacterial Community of Gastrodia elata Under Continuous Cropping in Yiliang County, Yunnan Province [J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2023, 39(19): 80-87. |
[8] | TIAN Jia, LI Fei, SUN Chao, SHANGGUAN Yiqing, QI Fan. Soil Nematode Communities in Apple Orchards in Shaanxi Province: Distribution Characteristics Analysis Based on High-throughput Sequencing [J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2023, 39(15): 118-126. |
[9] | ZHAO Yahong, WU Zhixing, LIU Minrong, TU Yanfang, XUE Jianping, WANG Yue, LU Chao, LIU Jiani, YU Lei, YAO Ruyu, CHEN Zhixing, HUANG Feiyan. Bacterial Community Diversity in Rhizosphere Soil of Chrysanthemum Wilt Plants: A Comparative Study [J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2023, 39(13): 109-116. |
[10] | DENG Yinglian, ZHAO Changlin. Soil Bacterial Community Structure and Diversity of Morchella in Jianchuan of Dali in Yunnan Province Based on High-throughput Sequencing [J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2023, 39(10): 79-87. |
[11] | CHEN Dao, WANG Xin, JIANG Shan, ZHANG Jie, WU Zujian, DING Xinlun. Strawberry Mottle Virus Isolated in Fujian: Complete Genome Sequence and Molecular Variation [J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2022, 38(6): 94-101. |
[12] | WANG Yan, WANG Liwei, ZHAO Hongyan, ZHAO Min, YANG Hongyan. Characteristics of Nutrients and Microbial Community Composition of Different Panax ginseng Cultivation Soil [J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2022, 38(5): 60-68. |
[13] | CHEN Liuhong, ZHAO Chunlei, WANG Xi, LI Yanli, DING Guangzhou, CHEN Li. Single-cell Transcriptome Sequencing Technology and Its Application in Plant Research [J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2022, 38(3): 87-93. |
[14] | ZHANG Heqing, WU Jie, HAN Shuai, XI Yadong, LI Yuejian, LIANG Genyun. Effects of Four Annual Rotation Patterns on Soil Microbial Community [J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2022, 38(20): 73-80. |
[15] | WANG Lixue, HAN Jing, CHEN Longbin, YU Xinyue, LIU Jingxi, MA Yi, HUO Wenjuan. Effects of Formic Acid and Wood Vinegar on Bacterial Community Composition of Alfalfa Silage [J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2022, 38(2): 92-101. |
Viewed | ||||||
Full text |
|
|||||
Abstract |
|
|||||