基于CiteSpace的鳞翅目昆虫转录组学研究态势分析

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb2022-0513

中国农学通报 ›› 2023, Vol. 39 ›› Issue (8): 142-148.doi: 10.11924/j.issn.1000-6850.casb2022-0513

基于CiteSpace的鳞翅目昆虫转录组学研究态势分析

梁展图¹^,²^,³(), 全林发¹, 梁盛曦⁴, 陈炳旭¹, 马群²(), 姚琼¹()

¹ 广东省农业科学院植物保护研究所/农业农村部华南果蔬绿色防控重点实验室/广东省植物保护新技术重点实验室，广州 510640
² 广东省农业技术推广中心，广州 510520
³ 华南师范大学生物科学学院，广州 510631
⁴ 仲恺农业工程学院，广州 510225

收稿日期:2022-06-27 修回日期:2023-01-06 出版日期:2023-03-15 发布日期:2023-03-14
通讯作者: 马群，1981年出生，江苏高邮人，高级农艺师，博士，研究方向为作物栽培与耕作学。通信地址：510520 广州市天河区柯木塱南路28号广东省农业技术推广中心，Tel：020-87051831，E-mail：71196928@qq.com。姚琼，1984年出生，副研究员，博士，研究方向为农业昆虫与害虫防治。通信地址：510640 广州市天河区金颖路7号广东省农业科学院植物保护研究所，Tel：020-87590733，E-mail：joanyao_0603@163.com。
作者简介:
梁展图，男，1998年出生，广东中山人，本科，研究方向为生物医学工程。Tel：020-87590733，E-mail：1506026993@qq.com。
基金资助:
广东省农业科学院协同创新中心项目“农作物病虫害智能识别与监测技术研发与应用”(XTXM202202); 国家自然科学基金项目“光照通过生物钟基因调控荔枝蒂蛀虫生殖行为节律的机制”(32102222); 国家荔枝龙眼产业技术体系(CARS-32); 广东省农业科学院农业优势产业学科团队建设项目“作物抗虫性遗传改良团队”(202117TD)

Transcriptome Analysis of Lepidoptera Insects Based on CiteSpace

LIANG Zhantu¹^,²^,³(), QUAN Linfa¹, LIANG Shengxi⁴, CHEN Bingxu¹, MA Qun²(), YAO Qiong¹()

¹ Institute of Plant Protection, Guangdong Academy of Agricultural Sciences/ Key Laboratory of Green Prevention and Control on Fruits and Vegetables in South China, Ministry of Agriculture and Rural Affairs/ Guangdong Provincial Key Laboratory of High Technology for Plant Protection, Guangzhou 510640
² Guangdong Agricultural Technology Extension Center, Guangzhou 510520
³ School of Life Sciences, South China Normal University, Guangzhou 510631
⁴ Zhongkai University of Agriculture and Engineering, Guangzhou 510225

Received:2022-06-27 Revised:2023-01-06 Online:2023-03-15 Published:2023-03-14

摘要/Abstract

摘要：

基于《中国知网》和PubMed平台，通过文献计量学的方法分析鳞翅目昆虫转录组学文献数量、年代分布、国家、作者信息、出版刊物及研究内容等信息，并采用CiteSpace V可视化软件进行作者聚簇、关键词共现和研究热点分析。《中国知网》数据库中检索出科技文献10篇，研究机构9个，发文作者9位，来源期刊8种。PubMed数据库共检索出科技文献927篇，发文作者690位，来源期刊162种。2015—2020年鳞翅目转录组学的研究热度很高。其中，夜蛾科、蚕蛾科、螟蛾科、粉蝶科，菜蛾科5个科的资料在CNKI和PubMed数据库相对其他科鳞翅目昆虫更为全面和详细。研究内容涉及高通量测序、基因表达、体外微环境、合成通路蛋白、基因家族、激素、遗传调控、转录应答等方面。研究热点有嗅觉受体、家蚕、毒性、氧化脂类、节肢动物触角、性引诱剂、病毒学、免疫学、核酸分子杂交等。客观总结了国内外的鳞翅目昆虫转录组学的研究现状，分析汇总出研究的热点以及薄弱点，可为昆虫学科研人员提供数据参考。

关键词: 鳞翅目, 转录组学, CiteSpace, CNKI, PubMed, 研究态势

Abstract:

Based on the databases of CNKI and PubMed, this paper analyzed the numbers, chronological distribution, countries, authors, journals and research contents of transcriptome studies on Lepidoptera insects by bibliometrics. We used CiteSpace V visualization software to analyze author clustering, keyword co-occurrence and research hotspots. Ten scientific papers, 9 research institutions, 9 authors and 8 journals were searched from the database of CNKI, while 927 papers, 690 authors and 162 journals were searched from the database of PubMed. From 2015 to 2020, the transcriptome study on Lepidoptera insects was very hot. Among the studies, the information of Noctuidae, Bombycidae, Pyralidae, Pieridae and Plutellidae was more comprehensive and detailed than that of other Lepidoptera insects in PubMed and CNKI databases. The research covered high-throughput sequencing, gene expression, in vitro microenvironment, synthetic pathway proteins, gene families, hormones, genetic regulation, transcriptional responses etc. Research hotspots included olfactory receptors, Bombyx mori, toxicity, oxidized lipids, arthropod antennae, sexual attractants, virology, immunology, nucleic acid molecular hybridization etc. This paper objectively summarizes the research status of Lepidoptera transcriptome at home and abroad, and analyzes the research hotspots and unpopular areas, in order to provide data reference for entomologists.

Key words: Lepidoptera, transcriptome, CiteSpace, CNKI, PubMed, research situation

梁展图, 全林发, 梁盛曦, 陈炳旭, 马群, 姚琼. 基于CiteSpace的鳞翅目昆虫转录组学研究态势分析[J]. 中国农学通报, 2023, 39(8): 142-148.

LIANG Zhantu, QUAN Linfa, LIANG Shengxi, CHEN Bingxu, MA Qun, YAO Qiong. Transcriptome Analysis of Lepidoptera Insects Based on CiteSpace[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2023, 39(8): 142-148.

图/表 8

参考文献 31

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科名	CNKI数据库		PubMed数据库		合计/篇
科名	数量/篇	占比/%	数量/篇	占比/%	合计/篇
夜蛾科(Noctuidae)	2	20.0	289	31.2	291
蚕蛾科(Bombycidae)	1	10.0	176	19.0	177
螟蛾科(Pyralidae)	1	10.0	144	15.5	145
粉蝶科(Pieridae)	0	0.0	56	6.0	56
菜蛾科(Plutellidae)	0	0.0	50	5.4	50
天蛾科(Sphingidae)	0	0.0	35	3.8	35
卷蛾科(Tortricidae)	1	10.0	33	3.6	34
蛱蝶科(Nymphalidae)	0	0.0	22	2.4	22
尺蛾科(Geometridae)	1	10.0	16	1.7	17
蝙蝠蛾科(Hepialidae)	2	20.0	14	1.5	16
毒蛾科(Lymantriidae)	0	0.0	13	1.4	13
天蚕蛾科(Saturniidae)	0	0.0	14	1.5	14
灯蛾科(Arctiidae)	0	0.0	6	0.6	6
木蠹蛾科(Cossidae)	0	0.0	8	0.9	8
凤蝶科(Papilionidae)	0	0.0	8	0.9	8
细蛾科(Gracilariidae)	1	10.0	5	0.5	6
舟蛾科(Notodontidae)	0	0.0	6	0.6	6
枯叶蛾科(Lasiocampidae)	0	0.0	7	0.8	7
蛀果蛾科(Carposinidae)	1	10.0	4	0.4	5
斑蛾科(Zygaenidae)	0	0.0	4	0.4	4
大蚕蛾科(Saturniidae)	0	0.0	4	0.4	4
麦蛾科(gelechiidae)	0	0.0	2	0.2	2
举肢蛾科(Heliodinidae)	0	0.0	2	0.2	2
蓑蛾科(Psychidae)	0	0.0	2	0.2	2
蕈蛾科(Tineida)	0	0.0	2	0.2	2
绡蝶科(Ithomiidae)	0	0.0	1	0.1	1
钩蛾科(Drepanidae)	0	0.0	1	0.1	1
织蛾科(Oecophoridae)	0	0.0	1	0.1	1
灰蝶科(Lycaenidae)	0	0.0	1	0.1	1
蝶蛾科(Castniidae)	0	0.0	1	0.1	1

科名	CNKI数据库		PubMed数据库		合计/篇
科名	数量/篇	占比/%	数量/篇	占比/%	合计/篇
夜蛾科(Noctuidae)	2	20.0	289	31.2	291
蚕蛾科(Bombycidae)	1	10.0	176	19.0	177
螟蛾科(Pyralidae)	1	10.0	144	15.5	145
粉蝶科(Pieridae)	0	0.0	56	6.0	56
菜蛾科(Plutellidae)	0	0.0	50	5.4	50
天蛾科(Sphingidae)	0	0.0	35	3.8	35
卷蛾科(Tortricidae)	1	10.0	33	3.6	34
蛱蝶科(Nymphalidae)	0	0.0	22	2.4	22
尺蛾科(Geometridae)	1	10.0	16	1.7	17
蝙蝠蛾科(Hepialidae)	2	20.0	14	1.5	16
毒蛾科(Lymantriidae)	0	0.0	13	1.4	13
天蚕蛾科(Saturniidae)	0	0.0	14	1.5	14
灯蛾科(Arctiidae)	0	0.0	6	0.6	6
木蠹蛾科(Cossidae)	0	0.0	8	0.9	8
凤蝶科(Papilionidae)	0	0.0	8	0.9	8
细蛾科(Gracilariidae)	1	10.0	5	0.5	6
舟蛾科(Notodontidae)	0	0.0	6	0.6	6
枯叶蛾科(Lasiocampidae)	0	0.0	7	0.8	7
蛀果蛾科(Carposinidae)	1	10.0	4	0.4	5
斑蛾科(Zygaenidae)	0	0.0	4	0.4	4
大蚕蛾科(Saturniidae)	0	0.0	4	0.4	4
麦蛾科(gelechiidae)	0	0.0	2	0.2	2
举肢蛾科(Heliodinidae)	0	0.0	2	0.2	2
蓑蛾科(Psychidae)	0	0.0	2	0.2	2
蕈蛾科(Tineida)	0	0.0	2	0.2	2
绡蝶科(Ithomiidae)	0	0.0	1	0.1	1
钩蛾科(Drepanidae)	0	0.0	1	0.1	1
织蛾科(Oecophoridae)	0	0.0	1	0.1	1
灰蝶科(Lycaenidae)	0	0.0	1	0.1	1
蝶蛾科(Castniidae)	0	0.0	1	0.1	1

发文期刊	发文量/篇	发文量占比/%	出版地
《PLoS One》	103	11.11	美国
《BMC Genomics》	76	8.20	英国
《Insect Biochemistry and Molecular Biology》	61	6.58	英国
《Scientific Report》	54	5.83	英国
《International Journal of Molecular Science》	30	3.24	美国
《Archives of Insect Biochemistry and Physiology》	26	2.80	美国
《Insect Science》	25	2.70	中国
《Gene》	24	2.59	荷兰
《Comparative Biochemistry and Physiology D- Genomics & Proteomics》	22	2.37	美国
《Molecular Ecology》	22	2.37	美国

发文期刊	发文量/篇	发文量占比/%	出版地
《PLoS One》	103	11.11	美国
《BMC Genomics》	76	8.20	英国
《Insect Biochemistry and Molecular Biology》	61	6.58	英国
《Scientific Report》	54	5.83	英国
《International Journal of Molecular Science》	30	3.24	美国
《Archives of Insect Biochemistry and Physiology》	26	2.80	美国
《Insect Science》	25	2.70	中国
《Gene》	24	2.59	荷兰
《Comparative Biochemistry and Physiology D- Genomics & Proteomics》	22	2.37	美国
《Molecular Ecology》	22	2.37	美国

关键词	频次	中心性	初现年
分子机理(molecular mechanism)	145	0.07	2011
转录组分析(transcriptome analysis)	142	0.05	2010
基因表达(gene expression)	100	0.12	2006
表达水平(expression level)	86	0.04	2011
系统分析(phylogenetic analysis)	86	0.06	2012
表达模式(expression pattern)	71	0.05	2008
脂肪体(fat body)	64	0.03	2013
表达谱(expression profile)	62	0.03	2013
嗅觉受体(odorant receptor)	59	0.01	2012
化学感受蛋白(chemosensory protein)	57	0.02	2013
免疫反应(immune response)	56	0.04	2014
发展阶段(developmental stage)	55	0.03	2013
转录组学分析(transcriptomic analysis)	54	0.03	2014
离子型受体(ionotropic receptor)	53	0.01	2012
基因本体论(gene ontology)	49	0.04	2012
候选基因(candidate gene)	47	0.14	2009
味觉受体(gustatory receptor)	45	0.07	2012
信号通路(signaling pathway)	45	0.02	2014
差异表达(differential expression)	44	0.17	2011
RNA干扰(RNA interference)	42	0.02	2014

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Transcriptome Analysis of Lepidoptera Insects Based on CiteSpace

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数据来源	文献量/篇	发文作者	出版刊物	国家
PubMed	927	687	161	36
CNKI	10	9	8	1

数据来源	文献量/篇	发文作者	出版刊物	国家
PubMed	927	687	161	36
CNKI	10	9	8	1