Genetic Diversity and Genetic Relationship Analysis of Longan Germplasm Resources Based on ISSR Markers

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb2021-1199

Abstract

Abstract:

In order to clarify the genetic diversity level and genetic relationship of the collected longan germplasm resources, ISSR molecular markers were used to analyze the genetic characterization of 20 longan germplasm resources. The results showed that 113 DNA fragments were amplified from 11 ISSR primers, of which 90 fragments (79.65%) were polymorphic. The genetic similarity coefficient ranged from 0.5487 to 0.8673, and the average value was 0.7758. The ISSR clustering results of the 20 longan germplasm resources showed that the genetic relationship of the tested longan materials was close. The clustering results were affected by the parental relationship and the geographical distribution to a certain extent, which was more consistent with the traditional classification methods. The results provided theoretical and technical support for the classification, conservation and utilization, genetic evolution research and hybrid combination selection of the longan resources.

Key words: longan, inter-simple sequence repeat, molecular marker, genetic diversity, genetic relationship

CLC Number:

S667.2

LIU Xiaoying, WU Bijun, ZHANG Younan, HUANG Feilong, LIU Guoqiang. Genetic Diversity and Genetic Relationship Analysis of Longan Germplasm Resources Based on ISSR Markers[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2022, 38(31): 60-65.

Figures/Tables 6

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编号	品种（品系）	选育途径	来源地
1	水南1号	实生选育	莆田荔城区
2	美国1号	引种	美国夏威夷
3	泉龙103	实生选育	泉州鲤城区
4	泉龙104	芽变选种	泉州鲤城区
5	泉龙157	实生选育	福州福清市
6	泉龙207	实生选育	泉州泉港区
7	泉龙222	实生选育	漳州龙海市
8	泉龙223	实生选育	漳州龙海市
9	美国2号	引种	美国夏威夷
10	石硖	引种	广西平南县
11	四季蜜	引种	广西
12	晚香	实生选育	不详
13	斑叶龙眼	实生选育	福建莆田市
14	凤梨穗	实生选育	厦门同安区
15	白皮龙眼	引种	马来西亚
16	松风本	实生选育	福建莆田市
17	软枝乌龙岭	实生选育	莆田城厢区
18	翠香	杂交育种	福建福州市
19	福晚3号	杂交育种	福建福州市
20	福晚8号	杂交育种	福建福州市

编号	品种（品系）	选育途径	来源地
1	水南1号	实生选育	莆田荔城区
2	美国1号	引种	美国夏威夷
3	泉龙103	实生选育	泉州鲤城区
4	泉龙104	芽变选种	泉州鲤城区
5	泉龙157	实生选育	福州福清市
6	泉龙207	实生选育	泉州泉港区
7	泉龙222	实生选育	漳州龙海市
8	泉龙223	实生选育	漳州龙海市
9	美国2号	引种	美国夏威夷
10	石硖	引种	广西平南县
11	四季蜜	引种	广西
12	晚香	实生选育	不详
13	斑叶龙眼	实生选育	福建莆田市
14	凤梨穗	实生选育	厦门同安区
15	白皮龙眼	引种	马来西亚
16	松风本	实生选育	福建莆田市
17	软枝乌龙岭	实生选育	莆田城厢区
18	翠香	杂交育种	福建福州市
19	福晚3号	杂交育种	福建福州市
20	福晚8号	杂交育种	福建福州市

引物	引物序列(5’- 3’)	扩增条带/条	多态性条带/条	多态性比例/%	Tm/℃	实验T值/℃
UBC807	AGAGAGAGAGAGAGAGT	12	9	75.00	46.4	49.9
UBC810	GAGAGAGAGAGAGAGAT	8	7	87.50	44.9	48.8
UBC812	GAGAGAGAGAGAGAGAA	15	11	73.33	45.1	47.1
UBC825	ACACACACACACACACT	8	6	75.00	50.8	52.8
UBC835	AGAGAGAGAGAGAGAGYC	12	10	83.33	50.2	52.8
UBC841	GAGAGAGAGAGAGAGAYC	10	6	60.00	48.5	50.5
UBC855	ACACACACACACACACYT	7	7	100.00	47.0	56.3
UBC857	ACACACACACACACACYG	8	7	87.50	54.3	56.3
UBC873	GACAGACAGACAGACA	7	5	71.43	46.9	46.8
UBC878	GGATGGATGGATGGAT	13	9	69.23	47.0	48.7
UBC881	GGGTGGGGTGGGGTG	13	13	100.00	60.6	58.6
总计		113	90
平均		10.27	8.18	79.65

引物	引物序列(5’- 3’)	扩增条带/条	多态性条带/条	多态性比例/%	Tm/℃	实验T值/℃
UBC807	AGAGAGAGAGAGAGAGT	12	9	75.00	46.4	49.9
UBC810	GAGAGAGAGAGAGAGAT	8	7	87.50	44.9	48.8
UBC812	GAGAGAGAGAGAGAGAA	15	11	73.33	45.1	47.1
UBC825	ACACACACACACACACT	8	6	75.00	50.8	52.8
UBC835	AGAGAGAGAGAGAGAGYC	12	10	83.33	50.2	52.8
UBC841	GAGAGAGAGAGAGAGAYC	10	6	60.00	48.5	50.5
UBC855	ACACACACACACACACYT	7	7	100.00	47.0	56.3
UBC857	ACACACACACACACACYG	8	7	87.50	54.3	56.3
UBC873	GACAGACAGACAGACA	7	5	71.43	46.9	46.8
UBC878	GGATGGATGGATGGAT	13	9	69.23	47.0	48.7
UBC881	GGGTGGGGTGGGGTG	13	13	100.00	60.6	58.6
总计		113	90
平均		10.27	8.18	79.65

	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20
1	1.0000
2	0.7434	1.0000
3	0.8407	0.7434	1.0000
4	0.8053	0.7257	0.8407	1.0000
5	0.7876	0.7788	0.8407	0.8407	1.0000
6	0.8053	0.7434	0.8407	0.8053	0.8053	1.0000
7	0.7788	0.7345	0.8319	0.8319	0.8319	0.8142	1.0000
8	0.8496	0.7345	0.8319	0.8142	0.8319	0.7965	0.8230	1.0000
9	0.7788	0.8053	0.7611	0.7611	0.7434	0.7611	0.7522	0.7522	1.0000
10	0.7788	0.7876	0.7434	0.7788	0.7965	0.7965	0.7876	0.7699	0.7699	1.0000
11	0.7965	0.7876	0.8142	0.8142	0.8319	0.7611	0.8230	0.7876	0.7699	0.8407	1.0000
12	0.7965	0.8230	0.7434	0.7965	0.8142	0.7434	0.7345	0.7522	0.8053	0.8230	0.7876	1.0000
13	0.7611	0.7522	0.7434	0.7611	0.7611	0.7611	0.7876	0.7876	0.7876	0.7699	0.7522	0.7876	1.0000
14	0.7611	0.6991	0.7611	0.6372	0.7434	0.7611	0.6991	0.7345	0.7345	0.7168	0.6991	0.6991	0.6637	1.0000
15	0.6814	0.6903	0.6637	0.6637	0.6814	0.6814	0.6372	0.6549	0.7434	0.6549	0.6726	0.7257	0.7257	0.6726	1.0000
16	0.8053	0.7257	0.8053	0.7876	0.8053	0.8053	0.8496	0.8673	0.7965	0.7788	0.7611	0.7434	0.8673	0.7257	0.6814	1.0000
17	0.7434	0.7168	0.7434	0.7257	0.7434	0.7257	0.7168	0.7168	0.7345	0.7168	0.7345	0.7345	0.6991	0.6991	0.6549	0.7257	1.0000
18	0.7434	0.7168	0.7611	0.7257	0.7257	0.7965	0.7699	0.7168	0.6991	0.7168	0.6991	0.6991	0.7522	0.7168	0.5841	0.7965	0.6991	1.0000
19	0.7611	0.7699	0.8142	0.7965	0.8319	0.7965	0.7699	0.7699	0.7345	0.7168	0.7345	0.7522	0.7699	0.7168	0.6018	0.7965	0.7876	0.8230	1.0000
20	0.6726	0.7168	0.6903	0.7080	0.7434	0.6549	0.7345	0.6991	0.6814	0.6814	0.6991	0.6991	0.6991	0.6637	0.5487	0.6726	0.7345	0.7168	0.8053	1.0000