Technology of Improved CTAB Method for Extracting Total RNA from Different Crops

doi:10.11924/j.issn.1000-6850.casb2023-0668

Abstract

Abstract:

In order to improve the operation efficiency, a simple and effective method for crop total RNA extraction was developed. Total RNA was extracted from different tissues of rape, cotton, peanut, wheat, potato, corn, soybean, zucchini and other crops by CTAB method, improved CTAB method and TanSzol Reagent kit method. The detection results showed that the quality of total RNA extracted by improved CTAB method was higher. High total RNA yields were obtained in rape petals, wheat, peanut and zucchini leaves, which were 24.5, 23.7, 26.4 and 17.35 μg/mL, respectively; and the OD_260/280 and OD_260/230 values were 1.90, 1.73, 1.72, 1.80 and 2.10, 1.50, 2.01, 1.70, respectively. By comprehensive comparison of the above three methods, the improved CTAB method is suitable for total RNA extraction of rape, wheat, peanut, zucchini and other crops, which lays a foundation for subsequent molecular biological detection.

Key words: improved CTAB method, total RNA, RNA extraction

LIU Guomei, GUO Shuhui, SUN Xuan, YAO Lin, ZHANG Gaoyang, DU Chunfang. Technology of Improved CTAB Method for Extracting Total RNA from Different Crops[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2024, 40(11): 28-35.

Figures/Tables 9

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作物	组织/器官	时期
油菜	花瓣	盛花期
	根茎	角果期
	籽粒	成熟期
小麦	叶片	灌浆期
花生	叶片	苗期
桑葚	叶片	成熟期
西葫芦	叶片	结瓜期
棉花	叶片	苗期
大豆	叶片	幼苗期
马铃薯	叶片	结薯期
玉米	叶片	拔节期

作物	组织/器官	时期
油菜	花瓣	盛花期
	根茎	角果期
	籽粒	成熟期
小麦	叶片	灌浆期
花生	叶片	苗期
桑葚	叶片	成熟期
西葫芦	叶片	结瓜期
棉花	叶片	苗期
大豆	叶片	幼苗期
马铃薯	叶片	结薯期
玉米	叶片	拔节期

作物	组织/器官	OD₂₆₀/₂₈₀	OD₂₆₀/₂₃₀	得率/(μg/mL)
油菜	花瓣	1.90±0.05	2.10±0.51 ^**	24.50±16.48 ^**
	根茎	1.87±0.05	1.68±0.54	25.60±18.31 ^**
	籽粒	1.65±0.21	1.44±0.56	21.51±20.40 ^**
小麦	叶片	1.73±0.10	1.50±0.22	23.65±21.83 ^**
花生	叶片	1.72±0.16	2.01±0.52 ^**	26.40±22.77 ^**
桑葚	叶片	1.48±0.16	1.24±0.61	1.63±24.50
西葫芦	叶片	1.80±0.20	1.70±0.42 ^*	17.35±12.80 ^**
棉花	叶片	1.45±0.87	1.21±0.02	8.50±7.40
大豆	叶片	1.57±0.17	1.38±0.42	5.75±5.93
马铃薯	叶片	1.75±0.23	1.54±0.31	5.40±4.10
玉米	叶片	1.44±0.07	1.19±0.02	3.35±1.73

作物	组织/器官	OD₂₆₀/₂₈₀	OD₂₆₀/₂₃₀	得率/(μg/mL)
油菜	花瓣	1.90±0.05	2.10±0.51 ^**	24.50±16.48 ^**
	根茎	1.87±0.05	1.68±0.54	25.60±18.31 ^**
	籽粒	1.65±0.21	1.44±0.56	21.51±20.40 ^**
小麦	叶片	1.73±0.10	1.50±0.22	23.65±21.83 ^**
花生	叶片	1.72±0.16	2.01±0.52 ^**	26.40±22.77 ^**
桑葚	叶片	1.48±0.16	1.24±0.61	1.63±24.50
西葫芦	叶片	1.80±0.20	1.70±0.42 ^*	17.35±12.80 ^**
棉花	叶片	1.45±0.87	1.21±0.02	8.50±7.40
大豆	叶片	1.57±0.17	1.38±0.42	5.75±5.93
马铃薯	叶片	1.75±0.23	1.54±0.31	5.40±4.10
玉米	叶片	1.44±0.07	1.19±0.02	3.35±1.73

作物	组织/器官	OD₂₆₀/₂₈₀	OD₂₆₀/₂₃₀	得率/(μg/mL)
油菜	花瓣	0.00±0.82	0.00±0.55	0.00±6.05
	根茎	0.91±0.09	0.55±0.00	2.47±3.58
	籽粒	1.22±0.40^*	0.72±0.18	4.23±1.82
小麦	叶片	1.35±0.53^*	1.04±0.64^*	11.7±5.65^*
花生	叶片	1.07±0.25	0.82±0.28^*	10.63±4.58^*
桑葚	叶片	1.13±0.31	0.55±0.00	6.17±0.12
西葫芦	叶片	0.66±0.16	0.56±0.02	4.90±1.15
棉花	叶片	1.21±0.39^*	0.57±0.02	12.77±6.7^*
大豆	叶片	0.00±0.82	0.00±0.55	0.00±6.05
马铃薯	叶片	1.44±0.63^*	1.19±0.49^*	14.43±7.38^*
玉米	叶片	0.00±0.82	0.00±0.55	0.27±5.78